FuNGI

A0A5N6DZW9

Protein Details

Accession

A0A5N6DZW9

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
329-348	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
440-462	TSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
333-338	RRKKRK
445-456	KRKGAKAKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 9, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRSQNDPLIHDASADDRVLAPVSGPAAGSSTLEARGKKLSDLASEFGGEPVRRNEGEAANYGIFYDDSKYDYMQHLRELNTGGGDSYFVEAKSKDKGKAKGMKLEDALRQVTLDDARSEYGPGSVYGSEMRSTASSYVRQPTYQDQQNVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEFVDADDEEDVFGKLTSQAEEMDQGDWEDTLFDEEDDDGWESDATEKAPVQPSTTDYKPPQRDEFAQNKSQDAEPGELPDHDAPAPDMDPDDQGWMREFAKFKKEGKVKAAPAAPPSIVPSEQRSTLASTVFTVGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFDRVEALYALDEEDEYDDSMSMVSGMTGMTGMTGFSTASSQAPSLIDANGAAVAPRHDFNNVMDDFLAGWDGNTSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGIKMLDEIRQGLGPAKMPGRASGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.62
4	0.63
5	0.57
6	0.51
7	0.52
8	0.5
9	0.51
10	0.56
11	0.48
12	0.4
13	0.43
14	0.41
15	0.34
16	0.32
17	0.27
18	0.21
19	0.21
20	0.19
21	0.14
22	0.12
23	0.13
24	0.13
25	0.13
26	0.1
27	0.09
28	0.1
29	0.1
30	0.09
31	0.09
32	0.09
33	0.1
34	0.1
35	0.09
36	0.1
37	0.14
38	0.17
39	0.18
40	0.18
41	0.23
42	0.24
43	0.24
44	0.27
45	0.26
46	0.28
47	0.31
48	0.3
49	0.26
50	0.27
51	0.26
52	0.22
53	0.24
54	0.19
55	0.18
56	0.2
57	0.23
58	0.22
59	0.24
60	0.27
61	0.26
62	0.29
63	0.28
64	0.29
65	0.24
66	0.24
67	0.22
68	0.18
69	0.14
70	0.12
71	0.12
72	0.09
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.15
77	0.2
78	0.24
79	0.23
80	0.27
81	0.29
82	0.3
83	0.31
84	0.31
85	0.26
86	0.22
87	0.2
88	0.16
89	0.12
90	0.11
91	0.09
92	0.08
93	0.09
94	0.08
95	0.1
96	0.1
97	0.12
98	0.19
99	0.23
100	0.29
101	0.35
102	0.41
103	0.49
104	0.58
105	0.61
106	0.62
107	0.61
108	0.59
109	0.55
110	0.53
111	0.47
112	0.41
113	0.38
114	0.29
115	0.26
116	0.2
117	0.19
118	0.16
119	0.14
120	0.11
121	0.11
122	0.12
123	0.12
124	0.13
125	0.11
126	0.1
127	0.1
128	0.09
129	0.1
130	0.09
131	0.09
132	0.1
133	0.11
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.09
138	0.1
139	0.11
140	0.13
141	0.15
142	0.17
143	0.24
144	0.24
145	0.24
146	0.26
147	0.3
148	0.35
149	0.38
150	0.39
151	0.35
152	0.37
153	0.4
154	0.38
155	0.32
156	0.25
157	0.19
158	0.15
159	0.14
160	0.11
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.13
170	0.13
171	0.13
172	0.13
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.12
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.06
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.05
195	0.06
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.09
201	0.09
202	0.08
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.08
228	0.12
229	0.12
230	0.13
231	0.13
232	0.16
233	0.2
234	0.21
235	0.23
236	0.22
237	0.31
238	0.35
239	0.38
240	0.38
241	0.36
242	0.39
243	0.42
244	0.47
245	0.44
246	0.45
247	0.42
248	0.39
249	0.38
250	0.34
251	0.28
252	0.21
253	0.18
254	0.13
255	0.14
256	0.14
257	0.12
258	0.14
259	0.12
260	0.12
261	0.09
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.09
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.1
272	0.09
273	0.09
274	0.1
275	0.11
276	0.11
277	0.14
278	0.16
279	0.16
280	0.23
281	0.27
282	0.29
283	0.36
284	0.42
285	0.43
286	0.48
287	0.53
288	0.49
289	0.5
290	0.51
291	0.43
292	0.39
293	0.37
294	0.3
295	0.22
296	0.22
297	0.18
298	0.15
299	0.15
300	0.18
301	0.18
302	0.19
303	0.19
304	0.18
305	0.19
306	0.19
307	0.19
308	0.14
309	0.13
310	0.13
311	0.12
312	0.11
313	0.09
314	0.08
315	0.11
316	0.13
317	0.18
318	0.25
319	0.36
320	0.43
321	0.47
322	0.56
323	0.63
324	0.71
325	0.75
326	0.78
327	0.78
328	0.8
329	0.81
330	0.72
331	0.64
332	0.54
333	0.43
334	0.35
335	0.25
336	0.17
337	0.13
338	0.12
339	0.1
340	0.11
341	0.12
342	0.11
343	0.12
344	0.17
345	0.17
346	0.17
347	0.19
348	0.19
349	0.21
350	0.27
351	0.27
352	0.24
353	0.23
354	0.23
355	0.22
356	0.21
357	0.21
358	0.13
359	0.14
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.07
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.05
390	0.06
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.1
395	0.1
396	0.12
397	0.12
398	0.11
399	0.11
400	0.09
401	0.1
402	0.09
403	0.08
404	0.07
405	0.06
406	0.08
407	0.1
408	0.1
409	0.11
410	0.12
411	0.13
412	0.15
413	0.22
414	0.21
415	0.2
416	0.19
417	0.18
418	0.17
419	0.16
420	0.16
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.07
425	0.07
426	0.09
427	0.11
428	0.13
429	0.21
430	0.27
431	0.31
432	0.35
433	0.43
434	0.51
435	0.58
436	0.65
437	0.69
438	0.73
439	0.79
440	0.84
441	0.82
442	0.81
443	0.8
444	0.74
445	0.7
446	0.61
447	0.53
448	0.46
449	0.41
450	0.31
451	0.27
452	0.23
453	0.17
454	0.17
455	0.16
456	0.15
457	0.15
458	0.16
459	0.16
460	0.18
461	0.19
462	0.23
463	0.24
464	0.26
465	0.26
466	0.31

A0A5N6DZW9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer