Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6DGC0

Protein Details
Accession A0A5N6DGC0    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAKARTKKRTHVRAQNASAATHydrophilic
363-400EEDMKKLDKNWEKRKKEKEERKRQQKENIEKKKAEKAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-247KRIRRLDPKEIRNREKR
300-327RELQRMKAGEKDKAEKKLKAAPEVEKRA
370-403DKNWEKRKKEKEERKRQQKENIEKKKAEKAKARA
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKARTKKRTHVRAQNASAATAKGSASSMSKTPKSMVIRIGGSQVGSSVSQLVKDVRLMMEPDTAVRLKERKSNRLRDYTVMAGPLGVTHLMLFSKSATGNTNMRLALTPRGPTLHFKVENYSLCRDVEKALKRPRGGGQDHKTPPLLVMNNFNSPNATEDGKVPKRLETLTTTIFQSLFPPINPQATPLSSIRRVMLLNRELKSDGQEDDSYVLNLRHYAITTRKTGVSKRIRRLDPKEIRNREKRGVAVPNLGKLEDAADYLLDPSAAGYTSASETELDTDNEVEIAESTTKRVLNKRELQRMKAGEKDKAEKKLKAAPEVEKRAVKLVELGPRLKLRLIKVEEGLCDGKVMWHDYIHKSEEDMKKLDKNWEKRKKEKEERKRQQKENIEKKKAEKAKARAEGKVVEDDDDEEMDVDDDEDDWLSDDFGEEEEGAEQEGEEDDDESMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.85
3 0.75
4 0.65
5 0.57
6 0.46
7 0.36
8 0.27
9 0.21
10 0.14
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.16
15 0.2
16 0.25
17 0.28
18 0.29
19 0.3
20 0.37
21 0.4
22 0.42
23 0.42
24 0.4
25 0.4
26 0.39
27 0.4
28 0.33
29 0.28
30 0.23
31 0.18
32 0.14
33 0.12
34 0.11
35 0.12
36 0.11
37 0.11
38 0.13
39 0.15
40 0.14
41 0.15
42 0.17
43 0.14
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.18
48 0.17
49 0.17
50 0.19
51 0.19
52 0.17
53 0.2
54 0.24
55 0.24
56 0.32
57 0.4
58 0.46
59 0.56
60 0.66
61 0.7
62 0.74
63 0.75
64 0.7
65 0.67
66 0.61
67 0.53
68 0.43
69 0.34
70 0.24
71 0.21
72 0.17
73 0.12
74 0.08
75 0.06
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.06
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.12
86 0.16
87 0.19
88 0.21
89 0.24
90 0.21
91 0.21
92 0.22
93 0.21
94 0.23
95 0.22
96 0.22
97 0.2
98 0.22
99 0.22
100 0.26
101 0.29
102 0.33
103 0.32
104 0.32
105 0.35
106 0.39
107 0.43
108 0.42
109 0.39
110 0.32
111 0.31
112 0.3
113 0.27
114 0.24
115 0.27
116 0.3
117 0.36
118 0.43
119 0.49
120 0.49
121 0.52
122 0.55
123 0.55
124 0.54
125 0.55
126 0.52
127 0.56
128 0.58
129 0.57
130 0.51
131 0.42
132 0.38
133 0.34
134 0.3
135 0.21
136 0.26
137 0.26
138 0.3
139 0.3
140 0.29
141 0.23
142 0.21
143 0.22
144 0.17
145 0.16
146 0.12
147 0.15
148 0.24
149 0.27
150 0.31
151 0.29
152 0.29
153 0.3
154 0.3
155 0.3
156 0.24
157 0.25
158 0.23
159 0.24
160 0.23
161 0.21
162 0.21
163 0.18
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.11
168 0.14
169 0.15
170 0.17
171 0.17
172 0.18
173 0.17
174 0.17
175 0.2
176 0.17
177 0.21
178 0.19
179 0.2
180 0.19
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.23
185 0.24
186 0.28
187 0.28
188 0.29
189 0.28
190 0.28
191 0.28
192 0.23
193 0.18
194 0.15
195 0.14
196 0.13
197 0.14
198 0.14
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.13
209 0.16
210 0.17
211 0.19
212 0.21
213 0.22
214 0.24
215 0.32
216 0.38
217 0.43
218 0.5
219 0.57
220 0.59
221 0.65
222 0.69
223 0.71
224 0.69
225 0.7
226 0.73
227 0.73
228 0.76
229 0.77
230 0.75
231 0.69
232 0.63
233 0.55
234 0.5
235 0.48
236 0.42
237 0.4
238 0.36
239 0.35
240 0.32
241 0.3
242 0.24
243 0.18
244 0.17
245 0.09
246 0.09
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.06
278 0.08
279 0.1
280 0.12
281 0.15
282 0.21
283 0.27
284 0.35
285 0.44
286 0.52
287 0.6
288 0.63
289 0.63
290 0.65
291 0.64
292 0.58
293 0.56
294 0.51
295 0.45
296 0.45
297 0.51
298 0.49
299 0.53
300 0.56
301 0.51
302 0.51
303 0.54
304 0.53
305 0.51
306 0.5
307 0.49
308 0.52
309 0.57
310 0.58
311 0.52
312 0.49
313 0.47
314 0.42
315 0.34
316 0.29
317 0.27
318 0.29
319 0.31
320 0.31
321 0.3
322 0.32
323 0.33
324 0.31
325 0.3
326 0.25
327 0.31
328 0.34
329 0.34
330 0.36
331 0.37
332 0.35
333 0.35
334 0.33
335 0.23
336 0.2
337 0.16
338 0.14
339 0.14
340 0.17
341 0.13
342 0.15
343 0.2
344 0.23
345 0.27
346 0.28
347 0.26
348 0.25
349 0.34
350 0.37
351 0.37
352 0.37
353 0.37
354 0.4
355 0.43
356 0.51
357 0.51
358 0.55
359 0.62
360 0.69
361 0.75
362 0.79
363 0.87
364 0.88
365 0.9
366 0.91
367 0.91
368 0.92
369 0.94
370 0.96
371 0.96
372 0.93
373 0.92
374 0.91
375 0.91
376 0.91
377 0.9
378 0.88
379 0.84
380 0.81
381 0.81
382 0.78
383 0.76
384 0.75
385 0.73
386 0.74
387 0.78
388 0.76
389 0.69
390 0.66
391 0.61
392 0.55
393 0.52
394 0.42
395 0.34
396 0.31
397 0.29
398 0.25
399 0.21
400 0.18
401 0.12
402 0.11
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.09
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.08
431 0.07