Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6D5Q2

Protein Details
Accession A0A5N6D5Q2    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
554-579SGDKQGRATKRVRKSRLPKDYDASKTHydrophilic
584-612RWLPLRDRSSYRPKGRKGKQRAAERTQGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
550-573RKRTSGDKQGRATKRVRKSRLPKD
587-606PLRDRSSYRPKGRKGKQRAA
635-646GGANKKKKKGKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MATQSLSSLLQRTSIDDHEEVLRSSNAALAKSKSDIQAQHVKVVALLKLDRYEDALRVFEEGGDALKKRAALEYAYTLYKTANLDEAIEVVSQVANDRGARHLEAQTTYRAEKFRRAADLYEELTKDEAALANEANDLRINAWAVDAQLQWKGYPDYVRHNRPTRDDLEAFETVYNAACLSIAKGEFGQGEMLLKRAKELCRTSEDLTPEDKAAELLPIAVQQLYVLIRQGKSEEAESVLEEISVNDISELSTKRVALNNITLVRDTTTNPYALYKSLHATPVSIDNDKLFDYQDNIVTGNVHAADLLVQKYDGIIRSTSKALSQAPYPSAKPNVNLLSVYNAAAHARGQAGTPALRAILPALERRPKDIGLALTAVQLYVTEGNTTSAITTLEKSLQLLEDSISEQDKEVRFNPGLLGILVSLYKLEGRRVQIRSELAKAAAYWQEHVEAPSSLLRAAAQSLLHSSDRTDLTTAGDLFKSLYQKDRNDSFAIAGYVASQATLDYAKIESQVDTLPPIDDLISGVDVNALESAGISPPSSAAAAAIASARKRTSGDKQGRATKRVRKSRLPKDYDASKTPDPERWLPLRDRSSYRPKGRKGKQRAAERTQGGIVNEKAEESPAPVAQQQKSQGGGGANKKKKKGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.25
4 0.27
5 0.27
6 0.29
7 0.26
8 0.24
9 0.22
10 0.17
11 0.17
12 0.18
13 0.17
14 0.17
15 0.2
16 0.2
17 0.22
18 0.25
19 0.28
20 0.28
21 0.32
22 0.32
23 0.36
24 0.43
25 0.42
26 0.44
27 0.42
28 0.39
29 0.35
30 0.35
31 0.3
32 0.24
33 0.23
34 0.21
35 0.22
36 0.23
37 0.21
38 0.23
39 0.24
40 0.23
41 0.24
42 0.23
43 0.21
44 0.21
45 0.21
46 0.16
47 0.15
48 0.12
49 0.12
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.14
54 0.15
55 0.16
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.2
60 0.24
61 0.26
62 0.26
63 0.25
64 0.23
65 0.21
66 0.22
67 0.2
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.14
75 0.13
76 0.11
77 0.08
78 0.08
79 0.06
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.13
86 0.16
87 0.18
88 0.21
89 0.23
90 0.24
91 0.26
92 0.27
93 0.29
94 0.3
95 0.3
96 0.3
97 0.32
98 0.31
99 0.37
100 0.4
101 0.4
102 0.44
103 0.44
104 0.42
105 0.43
106 0.46
107 0.4
108 0.39
109 0.34
110 0.28
111 0.26
112 0.24
113 0.18
114 0.14
115 0.13
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.19
142 0.2
143 0.29
144 0.37
145 0.45
146 0.52
147 0.59
148 0.61
149 0.62
150 0.66
151 0.58
152 0.57
153 0.5
154 0.44
155 0.41
156 0.37
157 0.32
158 0.26
159 0.23
160 0.15
161 0.14
162 0.12
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.07
177 0.09
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.17
184 0.2
185 0.25
186 0.29
187 0.31
188 0.35
189 0.4
190 0.4
191 0.39
192 0.39
193 0.34
194 0.32
195 0.29
196 0.23
197 0.19
198 0.17
199 0.12
200 0.1
201 0.09
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.14
242 0.17
243 0.18
244 0.17
245 0.19
246 0.22
247 0.23
248 0.23
249 0.21
250 0.18
251 0.18
252 0.17
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.12
263 0.12
264 0.14
265 0.16
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.18
270 0.19
271 0.18
272 0.16
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.15
277 0.1
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.08
288 0.07
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.15
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.2
318 0.2
319 0.19
320 0.22
321 0.22
322 0.2
323 0.2
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.13
350 0.18
351 0.19
352 0.22
353 0.24
354 0.22
355 0.22
356 0.23
357 0.2
358 0.16
359 0.17
360 0.14
361 0.12
362 0.12
363 0.1
364 0.07
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.06
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.12
395 0.13
396 0.14
397 0.15
398 0.19
399 0.19
400 0.19
401 0.19
402 0.15
403 0.15
404 0.12
405 0.11
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.04
411 0.04
412 0.06
413 0.07
414 0.09
415 0.13
416 0.17
417 0.25
418 0.27
419 0.29
420 0.31
421 0.35
422 0.35
423 0.34
424 0.31
425 0.24
426 0.22
427 0.21
428 0.19
429 0.19
430 0.16
431 0.14
432 0.14
433 0.15
434 0.15
435 0.16
436 0.14
437 0.11
438 0.12
439 0.12
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.14
455 0.15
456 0.16
457 0.16
458 0.13
459 0.15
460 0.17
461 0.17
462 0.14
463 0.13
464 0.12
465 0.13
466 0.15
467 0.16
468 0.14
469 0.21
470 0.26
471 0.3
472 0.36
473 0.39
474 0.4
475 0.39
476 0.38
477 0.32
478 0.28
479 0.24
480 0.18
481 0.14
482 0.11
483 0.1
484 0.09
485 0.07
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.05
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.09
495 0.1
496 0.09
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.07
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.04
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.08
526 0.08
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.08
533 0.09
534 0.1
535 0.13
536 0.13
537 0.14
538 0.16
539 0.22
540 0.29
541 0.38
542 0.47
543 0.54
544 0.61
545 0.7
546 0.75
547 0.76
548 0.75
549 0.74
550 0.75
551 0.76
552 0.77
553 0.77
554 0.81
555 0.86
556 0.88
557 0.86
558 0.82
559 0.79
560 0.8
561 0.76
562 0.71
563 0.66
564 0.59
565 0.58
566 0.55
567 0.53
568 0.5
569 0.48
570 0.5
571 0.49
572 0.51
573 0.51
574 0.57
575 0.58
576 0.58
577 0.59
578 0.6
579 0.66
580 0.7
581 0.75
582 0.75
583 0.78
584 0.83
585 0.86
586 0.89
587 0.89
588 0.89
589 0.87
590 0.89
591 0.89
592 0.86
593 0.85
594 0.77
595 0.7
596 0.63
597 0.57
598 0.47
599 0.44
600 0.37
601 0.3
602 0.27
603 0.24
604 0.21
605 0.2
606 0.19
607 0.15
608 0.17
609 0.16
610 0.18
611 0.2
612 0.27
613 0.28
614 0.33
615 0.36
616 0.36
617 0.37
618 0.36
619 0.36
620 0.34
621 0.39
622 0.43
623 0.49
624 0.54
625 0.59
626 0.67