Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179UWD1

Protein Details
Accession A0A179UWD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
365-390SPTTPGGGKERVKRRKSKVSSATVASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
357-382KAGRGGEKSPTTPGGGKERVKRRKSK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG bgh:BDBG_07755  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAAQSAVPLEEITWRSPLHVQTMGGFLHSNNILFYFAESPFFDQTSNNASLAIQANYNENFRPFIETREAFEGRLKTMQGLEFMVVHDPLQEAAAAAAVGGKQQRKQQELSNIWVIRKQMRKKRTGVGSGAAGGDDEIQVLATYFVVGDSVFMAPSVLRVVGSRMLSAVTSLTRALSVASPLPTFSPSYGHTYMPPVPKSLEASRPGVQQSGQQSVGDAPMPDASSQSKGGSVLSATGTTQQPTASTSPLASSSTTTQDSRSLVEAFNLLSRYGDEYMDDAPLLGEPGSFIIGKTSTEPLVVGMRQPMSSKVSKAPTPAPSAGAGPGASKPWTPAATGGAAAPPAIKTDAATLGAGKAGRGGEKSPTTPGGGKERVKRRKSKVSSATVASLAAGSSAGGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.26
4 0.28
5 0.28
6 0.29
7 0.28
8 0.26
9 0.3
10 0.27
11 0.23
12 0.22
13 0.16
14 0.17
15 0.18
16 0.16
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.13
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.16
25 0.16
26 0.19
27 0.2
28 0.2
29 0.19
30 0.16
31 0.18
32 0.22
33 0.23
34 0.2
35 0.18
36 0.17
37 0.21
38 0.23
39 0.21
40 0.16
41 0.15
42 0.19
43 0.2
44 0.22
45 0.2
46 0.18
47 0.19
48 0.18
49 0.25
50 0.22
51 0.25
52 0.31
53 0.31
54 0.34
55 0.39
56 0.39
57 0.33
58 0.37
59 0.34
60 0.28
61 0.3
62 0.27
63 0.21
64 0.23
65 0.23
66 0.19
67 0.18
68 0.16
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.06
87 0.1
88 0.12
89 0.15
90 0.21
91 0.27
92 0.31
93 0.33
94 0.38
95 0.45
96 0.46
97 0.49
98 0.52
99 0.48
100 0.44
101 0.44
102 0.4
103 0.37
104 0.42
105 0.46
106 0.46
107 0.53
108 0.6
109 0.63
110 0.69
111 0.7
112 0.67
113 0.61
114 0.54
115 0.47
116 0.41
117 0.35
118 0.27
119 0.18
120 0.12
121 0.09
122 0.06
123 0.05
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.17
176 0.18
177 0.18
178 0.18
179 0.21
180 0.25
181 0.28
182 0.26
183 0.21
184 0.2
185 0.21
186 0.24
187 0.23
188 0.24
189 0.22
190 0.25
191 0.26
192 0.27
193 0.27
194 0.24
195 0.21
196 0.19
197 0.19
198 0.19
199 0.18
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.16
204 0.12
205 0.1
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.13
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.12
237 0.12
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.14
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.18
246 0.18
247 0.18
248 0.18
249 0.16
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.12
254 0.13
255 0.12
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.14
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.18
295 0.2
296 0.22
297 0.24
298 0.27
299 0.31
300 0.32
301 0.35
302 0.39
303 0.39
304 0.43
305 0.41
306 0.37
307 0.33
308 0.32
309 0.28
310 0.23
311 0.18
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.13
318 0.17
319 0.18
320 0.17
321 0.18
322 0.19
323 0.18
324 0.19
325 0.17
326 0.13
327 0.12
328 0.12
329 0.11
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.11
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.15
342 0.14
343 0.11
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.15
348 0.16
349 0.21
350 0.25
351 0.27
352 0.28
353 0.3
354 0.31
355 0.33
356 0.36
357 0.38
358 0.42
359 0.47
360 0.53
361 0.61
362 0.68
363 0.74
364 0.8
365 0.8
366 0.83
367 0.85
368 0.87
369 0.86
370 0.85
371 0.82
372 0.76
373 0.7
374 0.59
375 0.51
376 0.4
377 0.3
378 0.2
379 0.14
380 0.09