Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179URB8

Protein Details
Accession A0A179URB8    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-122VDTTGGKKKRKRAPHDPNAPKRALBasic
237-257PEPVREPTPPRTKRRRTTGGABasic
313-333AATETPKGKGGKKKRKSEAGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-119GKKKRKRAPHDPNAPK
247-253RTKRRRT
269-329SASTKKASPEKKMRGAAAKREKEREEAAAALTGSGKLKRGAVAAAATETPKGKGGKKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11.5, cyto 8, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRKDDKAKDSTAIVTVNIDDFTRTRDSVIVSLATLQSAVSDLSRAYINHANTVLNRGPSTLDLGGITSSLLENGLLSGARVLSPGGGIAGVARGPGGVDTTGGKKKRKRAPHDPNAPKRALTPYFLYMQHNRATIAEELGENARPRGVADEGTKRWAEMPDHEKQEKMRAYKAGLPIPEDGYATGAAVNANVAAAMQLQQGVHHAAAGEEEASSEGSEQESEEEEEEEEEEEESSPEPVREPTPPRTKRRRTTGGAAAADVKPATPLSASTKKASPEKKMRGAAAKREKEREEAAAALTGSGKLKRGAVAAAATETPKGKGGKKKRKSEAGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.23
3 0.2
4 0.18
5 0.16
6 0.13
7 0.12
8 0.11
9 0.15
10 0.18
11 0.18
12 0.18
13 0.19
14 0.21
15 0.21
16 0.23
17 0.2
18 0.16
19 0.18
20 0.17
21 0.14
22 0.12
23 0.1
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.08
31 0.1
32 0.1
33 0.14
34 0.2
35 0.2
36 0.23
37 0.24
38 0.25
39 0.23
40 0.3
41 0.27
42 0.24
43 0.23
44 0.2
45 0.2
46 0.19
47 0.23
48 0.17
49 0.15
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.03
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.04
84 0.05
85 0.04
86 0.05
87 0.06
88 0.12
89 0.18
90 0.23
91 0.3
92 0.34
93 0.44
94 0.52
95 0.61
96 0.66
97 0.71
98 0.78
99 0.82
100 0.88
101 0.89
102 0.9
103 0.86
104 0.77
105 0.66
106 0.57
107 0.53
108 0.44
109 0.35
110 0.29
111 0.25
112 0.27
113 0.28
114 0.3
115 0.26
116 0.27
117 0.27
118 0.25
119 0.23
120 0.2
121 0.21
122 0.17
123 0.14
124 0.12
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.11
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.13
138 0.19
139 0.2
140 0.23
141 0.23
142 0.21
143 0.21
144 0.21
145 0.18
146 0.18
147 0.22
148 0.25
149 0.31
150 0.31
151 0.31
152 0.29
153 0.36
154 0.34
155 0.31
156 0.28
157 0.25
158 0.27
159 0.3
160 0.34
161 0.29
162 0.25
163 0.25
164 0.23
165 0.23
166 0.21
167 0.16
168 0.12
169 0.1
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.03
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.17
229 0.22
230 0.31
231 0.41
232 0.5
233 0.59
234 0.68
235 0.77
236 0.8
237 0.84
238 0.84
239 0.8
240 0.79
241 0.78
242 0.75
243 0.66
244 0.57
245 0.51
246 0.41
247 0.36
248 0.28
249 0.19
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.07
254 0.09
255 0.16
256 0.24
257 0.27
258 0.29
259 0.32
260 0.37
261 0.45
262 0.49
263 0.51
264 0.54
265 0.61
266 0.67
267 0.68
268 0.68
269 0.7
270 0.71
271 0.72
272 0.72
273 0.72
274 0.69
275 0.72
276 0.69
277 0.64
278 0.6
279 0.53
280 0.45
281 0.38
282 0.32
283 0.27
284 0.25
285 0.2
286 0.17
287 0.15
288 0.14
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.16
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.18
297 0.18
298 0.17
299 0.18
300 0.17
301 0.16
302 0.17
303 0.17
304 0.16
305 0.19
306 0.22
307 0.27
308 0.37
309 0.48
310 0.57
311 0.66
312 0.76
313 0.81