Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179UM40

Protein Details
Accession A0A179UM40    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-34LLDGVHNSKKRKKDASERKPQSSKRRAVADDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-29KKRKKDASERKPQSSKRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, plas 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG bgh:BDBG_04181  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPGLLDGVHNSKKRKKDASERKPQSSKRRAVADDNEDKNRIQQLEDQIAESRKYYNNIVTLISLFITEDSTKSPNLTVALSLCRVFCRLLAGGQFNKPKGASEQDLILVAWLKERYQEYQQGLINVLKKAEPTAQIAALSLCMRLIKEQSINGGAGADVGVWKGGYFNDLVIALIEAQDGERVRSEFIENFLTKYHDVAFYTLLRLSDFASTNKSPESIEVVISLLSALGQPPPPNHEFESFYTDLSSVGQKHKATLLSVSSYKQRVQAAWLSVLRSNTLNEQQRKTLLRLMSRLIAPWFLKPEMLMDFLTDSYDQGGSTSLLALSGLFYLIQEKNLDYPQFYQKLYSLLDADLLHSKHRSRFFRLLDTFLSSSHLPATLVASFIKRLSRLALNAPPAAIVVIVPWIYNLLKSHPTCTFMLHRVIRDEDSQSKLQSHGMTDPFDPTEPDPTRTGALESSLWEIETLQSHYHPNVASLSKIISEQFTKQAYNLEDFLDHSYQGMVGMELGKEEKEFRKAPVVEFQIPKRIFTDRLLEEDGGVDKEVGALVRGLWDFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.71
3 0.75
4 0.82
5 0.85
6 0.89
7 0.89
8 0.9
9 0.9
10 0.9
11 0.9
12 0.89
13 0.87
14 0.83
15 0.83
16 0.77
17 0.76
18 0.76
19 0.74
20 0.73
21 0.71
22 0.68
23 0.61
24 0.57
25 0.52
26 0.49
27 0.4
28 0.32
29 0.33
30 0.36
31 0.41
32 0.42
33 0.39
34 0.38
35 0.4
36 0.39
37 0.33
38 0.29
39 0.25
40 0.28
41 0.3
42 0.3
43 0.3
44 0.31
45 0.31
46 0.28
47 0.25
48 0.22
49 0.19
50 0.14
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.12
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.16
61 0.15
62 0.16
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.18
70 0.17
71 0.18
72 0.17
73 0.15
74 0.16
75 0.15
76 0.17
77 0.21
78 0.26
79 0.28
80 0.34
81 0.39
82 0.35
83 0.37
84 0.34
85 0.32
86 0.3
87 0.33
88 0.29
89 0.26
90 0.27
91 0.25
92 0.25
93 0.23
94 0.2
95 0.15
96 0.12
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.15
101 0.17
102 0.21
103 0.24
104 0.32
105 0.31
106 0.37
107 0.38
108 0.35
109 0.35
110 0.35
111 0.32
112 0.26
113 0.24
114 0.19
115 0.17
116 0.18
117 0.2
118 0.19
119 0.19
120 0.21
121 0.21
122 0.2
123 0.2
124 0.18
125 0.16
126 0.14
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.2
138 0.2
139 0.18
140 0.16
141 0.12
142 0.09
143 0.08
144 0.06
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.13
173 0.12
174 0.14
175 0.19
176 0.18
177 0.18
178 0.18
179 0.2
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.15
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.14
203 0.14
204 0.18
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.13
221 0.14
222 0.17
223 0.19
224 0.2
225 0.22
226 0.23
227 0.3
228 0.26
229 0.24
230 0.22
231 0.2
232 0.17
233 0.15
234 0.15
235 0.1
236 0.12
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.19
241 0.19
242 0.17
243 0.17
244 0.16
245 0.14
246 0.16
247 0.16
248 0.17
249 0.18
250 0.19
251 0.21
252 0.2
253 0.18
254 0.2
255 0.22
256 0.2
257 0.22
258 0.21
259 0.19
260 0.2
261 0.2
262 0.17
263 0.14
264 0.13
265 0.12
266 0.18
267 0.24
268 0.26
269 0.28
270 0.28
271 0.32
272 0.33
273 0.33
274 0.32
275 0.27
276 0.26
277 0.26
278 0.26
279 0.25
280 0.23
281 0.22
282 0.17
283 0.17
284 0.15
285 0.14
286 0.16
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.13
291 0.11
292 0.12
293 0.11
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.11
323 0.14
324 0.14
325 0.12
326 0.15
327 0.21
328 0.23
329 0.23
330 0.22
331 0.21
332 0.23
333 0.23
334 0.21
335 0.15
336 0.12
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.16
344 0.18
345 0.22
346 0.3
347 0.33
348 0.36
349 0.44
350 0.47
351 0.54
352 0.54
353 0.51
354 0.45
355 0.45
356 0.37
357 0.29
358 0.29
359 0.19
360 0.17
361 0.14
362 0.13
363 0.09
364 0.09
365 0.11
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.11
372 0.13
373 0.11
374 0.12
375 0.14
376 0.17
377 0.18
378 0.23
379 0.26
380 0.28
381 0.28
382 0.27
383 0.23
384 0.2
385 0.18
386 0.12
387 0.07
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.11
398 0.19
399 0.2
400 0.24
401 0.24
402 0.28
403 0.27
404 0.3
405 0.32
406 0.28
407 0.36
408 0.35
409 0.35
410 0.35
411 0.37
412 0.35
413 0.32
414 0.33
415 0.3
416 0.32
417 0.32
418 0.3
419 0.29
420 0.28
421 0.28
422 0.25
423 0.23
424 0.23
425 0.24
426 0.25
427 0.24
428 0.25
429 0.23
430 0.22
431 0.22
432 0.17
433 0.25
434 0.25
435 0.27
436 0.26
437 0.26
438 0.27
439 0.26
440 0.26
441 0.17
442 0.17
443 0.15
444 0.15
445 0.16
446 0.15
447 0.14
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.14
452 0.14
453 0.12
454 0.14
455 0.17
456 0.17
457 0.2
458 0.19
459 0.18
460 0.2
461 0.2
462 0.19
463 0.18
464 0.18
465 0.16
466 0.17
467 0.16
468 0.14
469 0.16
470 0.18
471 0.23
472 0.25
473 0.25
474 0.25
475 0.3
476 0.29
477 0.3
478 0.28
479 0.23
480 0.21
481 0.22
482 0.26
483 0.21
484 0.18
485 0.15
486 0.14
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.1
498 0.14
499 0.18
500 0.23
501 0.26
502 0.28
503 0.37
504 0.39
505 0.41
506 0.46
507 0.49
508 0.5
509 0.54
510 0.54
511 0.54
512 0.53
513 0.51
514 0.44
515 0.41
516 0.37
517 0.35
518 0.4
519 0.33
520 0.38
521 0.41
522 0.38
523 0.34
524 0.33
525 0.31
526 0.23
527 0.21
528 0.15
529 0.11
530 0.11
531 0.11
532 0.09
533 0.08
534 0.07
535 0.07
536 0.11