Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179UE35

Protein Details
Accession A0A179UE35    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-54PQKDAAKYPPARPRRPNYKHIHRFPLPLHydrophilic
148-170EVTGKRRLERRERKLERARKEKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-169KRRLERRERKLERARKEK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR036167  tRNA_intron_Endo_cat-like_sf  
IPR006677  tRNA_intron_Endonuc_cat-like  
IPR006676  tRNA_splic  
IPR016589  tRNA_splic_SEN2  
Gene Ontology GO:0000214  C:tRNA-intron endonuclease complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000213  F:tRNA-intron endonuclease activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
KEGG bgh:BDBG_01279  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01974  tRNA_int_endo  
CDD cd22363  tRNA-intron_lyase_C  
Amino Acid Sequences MASSTTSAVSTVSNGRLNSSNNSNLDPQKDAAKYPPARPRRPNYKHIHRFPLPLHVYPLPPLIPHNPLSLISIALSYLTYLISPPHQHIYTAYFDPSTSSIHVTDARAIRTLWEMGFFGKGSLSRSEPSWLDREKNRRGLTGDATSEEVTGKRRLERRERKLERARKEKEAIAEQLKAEAQLRDARGDFQSSELDKTFTALESPVHDAAVAQLDDKPRDTHGQESTVTANNSSISKQDMTNGHVGSVRSNGGKTVRFSPVVEQKCYDAQATIPWLPEPSIPSTDKNEHTVVLKNEEHLQLSNEEALFLVYGLGVLQVYNSDRTSILSASSLLTVFRQHSYFPPRESSAPAQPDDPFMLSYVVYHHFRSLGWVIRSGVKFGVDYLLYNRGPVFSHAEFAVCLLPAYSDPYWTATEERRQKTAKKEGRTWWWLHCVNRVQAQVKKSLVLCYVEVPPPHTQPPPTDATGEGGELDIGTLLRTYKVREMTIKRWVPNRSRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.3
4 0.32
5 0.35
6 0.37
7 0.39
8 0.37
9 0.41
10 0.44
11 0.44
12 0.44
13 0.42
14 0.37
15 0.37
16 0.37
17 0.36
18 0.35
19 0.41
20 0.43
21 0.48
22 0.57
23 0.59
24 0.67
25 0.75
26 0.79
27 0.81
28 0.83
29 0.85
30 0.86
31 0.87
32 0.89
33 0.88
34 0.87
35 0.8
36 0.79
37 0.71
38 0.71
39 0.64
40 0.55
41 0.52
42 0.44
43 0.41
44 0.36
45 0.37
46 0.27
47 0.23
48 0.25
49 0.23
50 0.25
51 0.25
52 0.26
53 0.24
54 0.24
55 0.26
56 0.23
57 0.19
58 0.15
59 0.13
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.11
70 0.13
71 0.16
72 0.22
73 0.22
74 0.23
75 0.24
76 0.26
77 0.27
78 0.27
79 0.25
80 0.19
81 0.18
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.14
86 0.15
87 0.14
88 0.16
89 0.19
90 0.18
91 0.23
92 0.24
93 0.24
94 0.23
95 0.22
96 0.21
97 0.21
98 0.22
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.13
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.12
109 0.14
110 0.16
111 0.15
112 0.17
113 0.2
114 0.2
115 0.22
116 0.26
117 0.27
118 0.3
119 0.36
120 0.45
121 0.49
122 0.57
123 0.56
124 0.52
125 0.52
126 0.5
127 0.48
128 0.44
129 0.37
130 0.29
131 0.29
132 0.26
133 0.23
134 0.2
135 0.16
136 0.14
137 0.17
138 0.17
139 0.22
140 0.27
141 0.35
142 0.46
143 0.56
144 0.63
145 0.7
146 0.75
147 0.79
148 0.84
149 0.85
150 0.84
151 0.84
152 0.79
153 0.75
154 0.72
155 0.65
156 0.59
157 0.55
158 0.5
159 0.43
160 0.4
161 0.32
162 0.3
163 0.27
164 0.22
165 0.19
166 0.14
167 0.12
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.18
173 0.17
174 0.18
175 0.16
176 0.14
177 0.16
178 0.15
179 0.17
180 0.15
181 0.15
182 0.14
183 0.14
184 0.13
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.12
197 0.09
198 0.07
199 0.09
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.16
206 0.16
207 0.19
208 0.2
209 0.22
210 0.22
211 0.22
212 0.23
213 0.22
214 0.21
215 0.16
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.14
225 0.15
226 0.17
227 0.2
228 0.19
229 0.18
230 0.19
231 0.19
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.14
240 0.15
241 0.17
242 0.19
243 0.2
244 0.2
245 0.24
246 0.3
247 0.31
248 0.3
249 0.27
250 0.26
251 0.26
252 0.26
253 0.22
254 0.13
255 0.1
256 0.1
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.12
266 0.15
267 0.16
268 0.18
269 0.22
270 0.26
271 0.27
272 0.28
273 0.26
274 0.23
275 0.23
276 0.26
277 0.23
278 0.24
279 0.23
280 0.21
281 0.23
282 0.24
283 0.22
284 0.18
285 0.18
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.04
304 0.05
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.1
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.18
326 0.26
327 0.29
328 0.3
329 0.32
330 0.33
331 0.34
332 0.38
333 0.37
334 0.36
335 0.37
336 0.35
337 0.32
338 0.3
339 0.31
340 0.27
341 0.23
342 0.16
343 0.13
344 0.13
345 0.11
346 0.1
347 0.11
348 0.14
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.2
355 0.2
356 0.23
357 0.22
358 0.24
359 0.25
360 0.31
361 0.32
362 0.28
363 0.25
364 0.19
365 0.18
366 0.16
367 0.18
368 0.11
369 0.12
370 0.13
371 0.19
372 0.18
373 0.19
374 0.18
375 0.16
376 0.17
377 0.19
378 0.23
379 0.16
380 0.18
381 0.18
382 0.18
383 0.17
384 0.17
385 0.16
386 0.09
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.12
392 0.11
393 0.12
394 0.13
395 0.15
396 0.17
397 0.18
398 0.21
399 0.21
400 0.31
401 0.39
402 0.42
403 0.46
404 0.5
405 0.55
406 0.61
407 0.67
408 0.66
409 0.65
410 0.7
411 0.71
412 0.76
413 0.78
414 0.72
415 0.67
416 0.67
417 0.64
418 0.58
419 0.58
420 0.55
421 0.52
422 0.55
423 0.55
424 0.52
425 0.52
426 0.52
427 0.51
428 0.45
429 0.44
430 0.39
431 0.37
432 0.34
433 0.32
434 0.3
435 0.26
436 0.29
437 0.29
438 0.29
439 0.29
440 0.3
441 0.32
442 0.35
443 0.36
444 0.34
445 0.34
446 0.38
447 0.4
448 0.38
449 0.35
450 0.31
451 0.31
452 0.29
453 0.25
454 0.2
455 0.14
456 0.12
457 0.1
458 0.09
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.1
465 0.11
466 0.15
467 0.21
468 0.26
469 0.31
470 0.39
471 0.47
472 0.51
473 0.6
474 0.63
475 0.63
476 0.65
477 0.7