Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179UD15

Protein Details
Accession A0A179UD15    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-72GPPPYGKRAGWRPRNPEDFAHydrophilic
387-413DEEAARERERRRRQQRQEDERQLRQSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-241KFKHKKIPRGPPSPP
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 9, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG bgh:BDBG_01418  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATSIAQGLFKSLPKPKYTGEDEELPIHAQPKGPRIIGASAINESQVVLKTVGPPPYGKRAGWRPRNPEDFADGGAFPEIPVAQYPLDMGRKGTSSTSNALAVQVDAEGKVKYDAIAKQGHGENRIVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLARPSQEEVAEQMEKTKAALAKLVTGAVAAQKPKNVKGGKRSEPTFVRYTPANQMGDTSQKNDRIMKIVERQVDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPVSNWKNPRGYTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRAQMQQKLAEKEKAQKEEHLRQLAQKAREARSGGTSRQESRARTRSRSASGSRSPSPYSSRSATPSEDEEAARERERRRRQQRQEDERQLRQSRMGTERRIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQSSGFDSGFNEDQPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQADDFDDEEAAGAEMSRIERNSRFEVLGRAKQGFKGAADAEARDGPVQFEKDTSDPFGIDGMIAEVTGAGGSGQKRYGIQEAEGANERGSKRARVDDDDDDDDHDRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.42
3 0.43
4 0.49
5 0.53
6 0.54
7 0.51
8 0.52
9 0.51
10 0.49
11 0.47
12 0.4
13 0.34
14 0.28
15 0.24
16 0.22
17 0.24
18 0.28
19 0.33
20 0.32
21 0.32
22 0.34
23 0.35
24 0.35
25 0.35
26 0.3
27 0.26
28 0.26
29 0.24
30 0.2
31 0.18
32 0.15
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.13
37 0.18
38 0.23
39 0.27
40 0.26
41 0.28
42 0.31
43 0.4
44 0.43
45 0.38
46 0.42
47 0.49
48 0.58
49 0.65
50 0.7
51 0.69
52 0.75
53 0.81
54 0.76
55 0.69
56 0.63
57 0.54
58 0.46
59 0.4
60 0.3
61 0.23
62 0.2
63 0.17
64 0.11
65 0.11
66 0.09
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.14
74 0.17
75 0.17
76 0.18
77 0.18
78 0.19
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.22
83 0.24
84 0.25
85 0.24
86 0.23
87 0.23
88 0.2
89 0.16
90 0.13
91 0.1
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.13
101 0.15
102 0.19
103 0.23
104 0.22
105 0.27
106 0.32
107 0.34
108 0.32
109 0.32
110 0.28
111 0.28
112 0.31
113 0.26
114 0.22
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.18
119 0.21
120 0.19
121 0.23
122 0.29
123 0.34
124 0.32
125 0.34
126 0.35
127 0.29
128 0.32
129 0.28
130 0.22
131 0.21
132 0.19
133 0.16
134 0.18
135 0.17
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.14
152 0.14
153 0.17
154 0.15
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.13
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.16
166 0.19
167 0.21
168 0.29
169 0.32
170 0.34
171 0.42
172 0.51
173 0.56
174 0.61
175 0.61
176 0.59
177 0.58
178 0.57
179 0.52
180 0.43
181 0.37
182 0.31
183 0.32
184 0.32
185 0.34
186 0.29
187 0.25
188 0.25
189 0.24
190 0.29
191 0.27
192 0.24
193 0.22
194 0.25
195 0.27
196 0.29
197 0.28
198 0.27
199 0.28
200 0.3
201 0.32
202 0.34
203 0.37
204 0.35
205 0.35
206 0.32
207 0.31
208 0.27
209 0.27
210 0.27
211 0.24
212 0.25
213 0.34
214 0.4
215 0.4
216 0.5
217 0.52
218 0.58
219 0.67
220 0.76
221 0.75
222 0.77
223 0.79
224 0.78
225 0.76
226 0.72
227 0.66
228 0.56
229 0.52
230 0.49
231 0.5
232 0.5
233 0.5
234 0.48
235 0.49
236 0.51
237 0.46
238 0.43
239 0.43
240 0.42
241 0.4
242 0.37
243 0.35
244 0.34
245 0.33
246 0.32
247 0.28
248 0.21
249 0.15
250 0.16
251 0.18
252 0.26
253 0.29
254 0.36
255 0.4
256 0.46
257 0.52
258 0.49
259 0.51
260 0.43
261 0.42
262 0.39
263 0.43
264 0.42
265 0.4
266 0.41
267 0.36
268 0.33
269 0.33
270 0.29
271 0.2
272 0.16
273 0.14
274 0.14
275 0.15
276 0.14
277 0.11
278 0.13
279 0.12
280 0.15
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.11
287 0.11
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.16
302 0.25
303 0.31
304 0.34
305 0.38
306 0.38
307 0.44
308 0.49
309 0.5
310 0.44
311 0.44
312 0.43
313 0.44
314 0.45
315 0.41
316 0.36
317 0.41
318 0.43
319 0.42
320 0.38
321 0.4
322 0.45
323 0.5
324 0.54
325 0.5
326 0.45
327 0.42
328 0.48
329 0.48
330 0.42
331 0.37
332 0.36
333 0.34
334 0.37
335 0.36
336 0.3
337 0.31
338 0.32
339 0.29
340 0.3
341 0.3
342 0.28
343 0.34
344 0.37
345 0.33
346 0.39
347 0.47
348 0.46
349 0.47
350 0.51
351 0.5
352 0.5
353 0.53
354 0.49
355 0.47
356 0.48
357 0.5
358 0.47
359 0.45
360 0.42
361 0.38
362 0.39
363 0.34
364 0.32
365 0.29
366 0.28
367 0.29
368 0.3
369 0.29
370 0.26
371 0.26
372 0.24
373 0.23
374 0.21
375 0.18
376 0.19
377 0.2
378 0.2
379 0.23
380 0.26
381 0.34
382 0.45
383 0.54
384 0.62
385 0.71
386 0.79
387 0.86
388 0.91
389 0.92
390 0.93
391 0.93
392 0.89
393 0.85
394 0.83
395 0.75
396 0.65
397 0.59
398 0.51
399 0.46
400 0.46
401 0.46
402 0.42
403 0.44
404 0.48
405 0.47
406 0.46
407 0.4
408 0.36
409 0.39
410 0.42
411 0.41
412 0.4
413 0.38
414 0.42
415 0.43
416 0.42
417 0.33
418 0.27
419 0.23
420 0.19
421 0.19
422 0.16
423 0.14
424 0.12
425 0.14
426 0.13
427 0.15
428 0.16
429 0.17
430 0.18
431 0.2
432 0.21
433 0.22
434 0.28
435 0.29
436 0.31
437 0.35
438 0.34
439 0.36
440 0.39
441 0.36
442 0.29
443 0.26
444 0.24
445 0.22
446 0.24
447 0.2
448 0.16
449 0.16
450 0.2
451 0.19
452 0.18
453 0.16
454 0.13
455 0.14
456 0.15
457 0.19
458 0.16
459 0.15
460 0.16
461 0.16
462 0.18
463 0.17
464 0.2
465 0.16
466 0.18
467 0.19
468 0.2
469 0.19
470 0.17
471 0.17
472 0.18
473 0.19
474 0.17
475 0.19
476 0.21
477 0.22
478 0.27
479 0.32
480 0.34
481 0.33
482 0.33
483 0.3
484 0.25
485 0.24
486 0.19
487 0.13
488 0.06
489 0.05
490 0.04
491 0.05
492 0.07
493 0.1
494 0.1
495 0.14
496 0.18
497 0.24
498 0.29
499 0.3
500 0.3
501 0.3
502 0.38
503 0.42
504 0.44
505 0.42
506 0.41
507 0.4
508 0.4
509 0.42
510 0.35
511 0.28
512 0.27
513 0.24
514 0.25
515 0.25
516 0.24
517 0.23
518 0.22
519 0.22
520 0.18
521 0.18
522 0.15
523 0.18
524 0.2
525 0.18
526 0.17
527 0.2
528 0.22
529 0.24
530 0.26
531 0.22
532 0.2
533 0.2
534 0.19
535 0.16
536 0.13
537 0.11
538 0.08
539 0.07
540 0.06
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.04
545 0.04
546 0.03
547 0.07
548 0.08
549 0.1
550 0.12
551 0.13
552 0.15
553 0.18
554 0.24
555 0.23
556 0.23
557 0.27
558 0.27
559 0.3
560 0.33
561 0.31
562 0.25
563 0.29
564 0.28
565 0.29
566 0.31
567 0.32
568 0.33
569 0.41
570 0.46
571 0.48
572 0.54
573 0.55
574 0.58
575 0.57
576 0.52
577 0.47
578 0.44