Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5Q4C4A1

Protein Details
Accession A0A5Q4C4A1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-427PSPPLVSRKTKEPRRLRLRPSTPIYPHydrophilic
477-499EEPTSSPVPKKPQVRPKPVVTVQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, plas 7, mito 5, E.R. 2, cyto 1, extr 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021013  ATPase_Vma12  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0070072  P:vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF11712  Vma12  
Amino Acid Sequences MVRLTITLCITEGLQKLAEVRSNREKSEGLDKKTNTATQTTTSDAPSPSAATPEAEEPSLEKPIVGNPITHRQILDLHKELRIEGVDGFSLEGLLRGATVYIPPPPPKPKPSAEYKALMARLRREEEERTYQRMMKQPSRLENFSQQFPSATTRAHAFAEVNRPMRESDNGDDEATLGDVQKQVMVILNFLISIIGVAATIWIAARWWNITARIFLTLAGSILVLVAEVAVYSGYVWRLTEAKANRKEPEEIKEVMQTWVLGKDEDGGGKPGVEPTMLLDTKTQDTDEGIRRRLKGLSYSPKRQLLRPTTDKRRALRTYSKRLRLTEDESDPGPLMKKRKVDTEPATRTPDLQRLPAAQPAPPSSNIPKSSILSYFKPCRSSSATESSDLLSESDKLINTPPSPPLVSRKTKEPRRLRLRPSTPIYPSSDTTEDSTDHNEEYRDINRPGLRKGLRSRTRSTRERWDTANVDGLEDEEEPTSSPVPKKPQVRPKPVVTVQTTINLSSKPTFMECKTCRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.19
4 0.21
5 0.26
6 0.24
7 0.3
8 0.39
9 0.43
10 0.44
11 0.45
12 0.43
13 0.41
14 0.5
15 0.51
16 0.47
17 0.51
18 0.51
19 0.53
20 0.57
21 0.57
22 0.48
23 0.44
24 0.39
25 0.35
26 0.37
27 0.35
28 0.32
29 0.3
30 0.31
31 0.28
32 0.27
33 0.23
34 0.23
35 0.19
36 0.2
37 0.18
38 0.15
39 0.17
40 0.18
41 0.19
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.18
46 0.2
47 0.18
48 0.15
49 0.14
50 0.17
51 0.24
52 0.22
53 0.23
54 0.24
55 0.34
56 0.37
57 0.37
58 0.34
59 0.28
60 0.35
61 0.37
62 0.4
63 0.36
64 0.36
65 0.37
66 0.38
67 0.36
68 0.31
69 0.27
70 0.2
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.11
89 0.16
90 0.19
91 0.25
92 0.33
93 0.4
94 0.45
95 0.5
96 0.52
97 0.54
98 0.61
99 0.62
100 0.6
101 0.56
102 0.53
103 0.52
104 0.5
105 0.48
106 0.41
107 0.39
108 0.4
109 0.41
110 0.41
111 0.39
112 0.39
113 0.43
114 0.5
115 0.48
116 0.47
117 0.47
118 0.47
119 0.49
120 0.51
121 0.53
122 0.49
123 0.53
124 0.54
125 0.59
126 0.63
127 0.6
128 0.57
129 0.59
130 0.55
131 0.51
132 0.46
133 0.38
134 0.32
135 0.3
136 0.3
137 0.22
138 0.19
139 0.17
140 0.17
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.13
145 0.16
146 0.24
147 0.28
148 0.3
149 0.28
150 0.29
151 0.29
152 0.3
153 0.29
154 0.25
155 0.22
156 0.23
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.2
161 0.17
162 0.13
163 0.11
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.06
195 0.08
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.11
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.13
228 0.17
229 0.26
230 0.32
231 0.36
232 0.37
233 0.38
234 0.41
235 0.38
236 0.39
237 0.34
238 0.29
239 0.26
240 0.27
241 0.26
242 0.22
243 0.2
244 0.15
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.14
271 0.08
272 0.09
273 0.14
274 0.21
275 0.23
276 0.26
277 0.29
278 0.3
279 0.32
280 0.32
281 0.29
282 0.27
283 0.32
284 0.38
285 0.42
286 0.48
287 0.52
288 0.58
289 0.58
290 0.56
291 0.56
292 0.53
293 0.55
294 0.58
295 0.61
296 0.64
297 0.72
298 0.75
299 0.69
300 0.7
301 0.65
302 0.62
303 0.64
304 0.63
305 0.66
306 0.69
307 0.74
308 0.69
309 0.67
310 0.66
311 0.61
312 0.58
313 0.53
314 0.46
315 0.4
316 0.35
317 0.34
318 0.28
319 0.23
320 0.2
321 0.17
322 0.19
323 0.22
324 0.27
325 0.28
326 0.37
327 0.39
328 0.46
329 0.5
330 0.56
331 0.58
332 0.58
333 0.61
334 0.53
335 0.52
336 0.47
337 0.46
338 0.36
339 0.31
340 0.28
341 0.27
342 0.28
343 0.31
344 0.28
345 0.23
346 0.24
347 0.25
348 0.26
349 0.23
350 0.26
351 0.26
352 0.32
353 0.33
354 0.33
355 0.33
356 0.32
357 0.33
358 0.34
359 0.33
360 0.3
361 0.35
362 0.4
363 0.4
364 0.43
365 0.41
366 0.41
367 0.42
368 0.44
369 0.43
370 0.44
371 0.43
372 0.4
373 0.41
374 0.36
375 0.31
376 0.25
377 0.2
378 0.12
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.14
385 0.17
386 0.18
387 0.2
388 0.2
389 0.21
390 0.23
391 0.24
392 0.3
393 0.34
394 0.41
395 0.41
396 0.5
397 0.57
398 0.65
399 0.73
400 0.75
401 0.78
402 0.8
403 0.87
404 0.86
405 0.87
406 0.85
407 0.84
408 0.8
409 0.77
410 0.7
411 0.66
412 0.63
413 0.55
414 0.5
415 0.46
416 0.41
417 0.35
418 0.33
419 0.3
420 0.25
421 0.23
422 0.25
423 0.21
424 0.2
425 0.2
426 0.18
427 0.18
428 0.21
429 0.22
430 0.24
431 0.24
432 0.29
433 0.32
434 0.35
435 0.37
436 0.43
437 0.43
438 0.45
439 0.53
440 0.58
441 0.63
442 0.66
443 0.71
444 0.72
445 0.78
446 0.77
447 0.75
448 0.75
449 0.75
450 0.73
451 0.69
452 0.66
453 0.6
454 0.55
455 0.56
456 0.44
457 0.36
458 0.31
459 0.28
460 0.21
461 0.19
462 0.17
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.12
467 0.13
468 0.16
469 0.2
470 0.25
471 0.34
472 0.41
473 0.5
474 0.58
475 0.68
476 0.74
477 0.81
478 0.82
479 0.81
480 0.83
481 0.8
482 0.78
483 0.71
484 0.64
485 0.55
486 0.54
487 0.48
488 0.4
489 0.36
490 0.28
491 0.27
492 0.26
493 0.25
494 0.21
495 0.23
496 0.27
497 0.28
498 0.39