Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N7AFN5

Protein Details
Accession A0A5N7AFN5    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-436YPPMLPRKLRVMRAKKQPKKREAGGSTHydrophilic
487-518DGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-108KRK
127-143EQKEEQKRRAEKAKRQK
338-341KKKK
415-439PRKLRVMRAKKQPKKREAGGSTQGK
491-527RIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAAGGKKRKTE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 11.833, cyto 4.5, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKSKSQSENAPQTEKAETSLPFIAGSAAVDPTLASLFETSSGPVKAPSLPTTSSTVEKPAAGDDTSEDVSEPEDEDQVMQEVSEASSDAGDDPAQAASEPPSRKRKRTAGEDLEESYMRRIAKEEQKEEQKRRAEKAKRQKAEGEEEDEATSTDKPDGEDEDESSDEDGEIAIPKHETLTGDAQSSNIDKSNRTVFLSNVSNEAIKSKSAKKTLLKHFESFLSTLPESTGPHKVESIRFRSTAFASGGKIPKRAAFAKREVLDETTPSTNAYIVYSTVQAARKAPAALNGTVVLDRHVRVDSVAHPAPVDNKRCVFVGNLNFVDQEGNADDEEKPKKKKAPADVEEGLWRTFNAHTSKPKDQTIRRGNVESVRVVRDSVTRVSKGFAYVQFYDQNCVEEALLLDGKQYPPMLPRKLRVMRAKKQPKKREAGGSTQGKSLREADKTLQGRAGKLFGRAGAAKVRADATKSISNNSLVFEGHRATDDGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAAGGKKRKTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.55
3 0.45
4 0.36
5 0.3
6 0.25
7 0.25
8 0.26
9 0.24
10 0.2
11 0.2
12 0.18
13 0.14
14 0.14
15 0.1
16 0.08
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.17
35 0.21
36 0.23
37 0.24
38 0.25
39 0.27
40 0.31
41 0.32
42 0.31
43 0.29
44 0.29
45 0.27
46 0.25
47 0.24
48 0.21
49 0.21
50 0.18
51 0.17
52 0.15
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.15
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.1
87 0.17
88 0.2
89 0.27
90 0.38
91 0.45
92 0.51
93 0.6
94 0.66
95 0.68
96 0.74
97 0.77
98 0.76
99 0.74
100 0.71
101 0.64
102 0.58
103 0.49
104 0.4
105 0.3
106 0.24
107 0.19
108 0.16
109 0.16
110 0.21
111 0.3
112 0.38
113 0.42
114 0.47
115 0.58
116 0.67
117 0.71
118 0.71
119 0.7
120 0.67
121 0.69
122 0.72
123 0.71
124 0.72
125 0.77
126 0.8
127 0.76
128 0.74
129 0.74
130 0.69
131 0.68
132 0.61
133 0.56
134 0.46
135 0.42
136 0.38
137 0.32
138 0.26
139 0.18
140 0.15
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.12
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.15
180 0.2
181 0.2
182 0.21
183 0.21
184 0.18
185 0.23
186 0.26
187 0.23
188 0.2
189 0.19
190 0.17
191 0.16
192 0.18
193 0.13
194 0.11
195 0.14
196 0.19
197 0.25
198 0.28
199 0.34
200 0.39
201 0.48
202 0.57
203 0.63
204 0.6
205 0.56
206 0.54
207 0.49
208 0.44
209 0.36
210 0.27
211 0.21
212 0.17
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.15
218 0.2
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.2
223 0.25
224 0.3
225 0.33
226 0.29
227 0.29
228 0.29
229 0.3
230 0.28
231 0.26
232 0.21
233 0.17
234 0.16
235 0.2
236 0.24
237 0.23
238 0.24
239 0.21
240 0.21
241 0.24
242 0.28
243 0.28
244 0.29
245 0.32
246 0.37
247 0.37
248 0.37
249 0.34
250 0.31
251 0.26
252 0.22
253 0.2
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.16
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.1
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.21
297 0.25
298 0.27
299 0.23
300 0.24
301 0.25
302 0.25
303 0.25
304 0.21
305 0.21
306 0.22
307 0.25
308 0.24
309 0.24
310 0.24
311 0.23
312 0.22
313 0.15
314 0.11
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.08
319 0.08
320 0.13
321 0.2
322 0.24
323 0.28
324 0.32
325 0.38
326 0.43
327 0.5
328 0.55
329 0.6
330 0.58
331 0.63
332 0.59
333 0.54
334 0.51
335 0.46
336 0.35
337 0.24
338 0.2
339 0.14
340 0.13
341 0.17
342 0.18
343 0.21
344 0.29
345 0.36
346 0.43
347 0.46
348 0.52
349 0.55
350 0.56
351 0.62
352 0.64
353 0.65
354 0.61
355 0.59
356 0.56
357 0.52
358 0.5
359 0.42
360 0.35
361 0.3
362 0.26
363 0.24
364 0.22
365 0.2
366 0.2
367 0.23
368 0.24
369 0.23
370 0.23
371 0.24
372 0.24
373 0.23
374 0.25
375 0.22
376 0.23
377 0.23
378 0.25
379 0.3
380 0.3
381 0.3
382 0.27
383 0.25
384 0.2
385 0.19
386 0.16
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.09
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.11
398 0.17
399 0.25
400 0.33
401 0.35
402 0.39
403 0.48
404 0.54
405 0.61
406 0.66
407 0.68
408 0.69
409 0.76
410 0.84
411 0.83
412 0.87
413 0.89
414 0.88
415 0.87
416 0.85
417 0.84
418 0.78
419 0.78
420 0.76
421 0.74
422 0.66
423 0.62
424 0.57
425 0.47
426 0.44
427 0.41
428 0.37
429 0.31
430 0.33
431 0.31
432 0.38
433 0.39
434 0.39
435 0.39
436 0.35
437 0.34
438 0.33
439 0.34
440 0.27
441 0.27
442 0.27
443 0.22
444 0.25
445 0.24
446 0.24
447 0.25
448 0.27
449 0.24
450 0.24
451 0.26
452 0.23
453 0.25
454 0.25
455 0.25
456 0.29
457 0.3
458 0.32
459 0.32
460 0.33
461 0.31
462 0.3
463 0.26
464 0.19
465 0.19
466 0.19
467 0.17
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.2
473 0.21
474 0.21
475 0.23
476 0.26
477 0.28
478 0.32
479 0.37
480 0.38
481 0.44
482 0.51
483 0.59
484 0.65
485 0.72
486 0.78
487 0.81
488 0.86
489 0.9
490 0.9
491 0.89
492 0.89
493 0.9
494 0.9
495 0.92
496 0.89
497 0.89
498 0.86
499 0.85
500 0.79
501 0.76
502 0.7
503 0.66
504 0.66
505 0.64
506 0.63
507 0.61