Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179UP89

Protein Details
Accession A0A179UP89    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-135DLYGEDDKRPPKRRKKVIDTPRKGERRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-147KRPPKRRKKVIDTPRKGERRSGRVKPSLPTSPK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG bgh:BDBG_04605  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MIPKRPNSSYAATFQTRHNHTGGAPLTQAGGQLINRRDSGPGPNGSTNRKVKPEPATDDEPLSSTDESEQLNSHSELPPSPEPTWKSYSRSPKEAASRSAGNTRVDADLYGEDDKRPPKRRKKVIDTPRKGERRSGRVKPSLPTSPKETPRKPIFMESDSLFSPYRPPPTKRQYGATNIHAAPSRKSSKHFEVPVSTAEDGQSAIHSSQVSSNGPKFKTPLSFPNEVTSSASLFTGTSHFDDYDDDGDSSLSSLSSISSSISLHLAEAEKHELDCATPRQKAIICPMCDQAVDPRFIDDLRSPKNLSYRKKAQFCRDHRIRAAEYEWANRGYPTINWENLHKRIEKHYVELDQILTMKKSSFYRNELESSRTGKKKGNLRLTVDEDEADKFLPGYYGPWGAKKMMDAIISHFAGKFKHLAPTDHLIKAAGVSGFVQSVMVPELAVMLVKEDMGLDDAGARQVLTDSMEIGNLINKQPDDVIKQVGRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.5
3 0.49
4 0.47
5 0.44
6 0.38
7 0.35
8 0.41
9 0.37
10 0.3
11 0.26
12 0.23
13 0.22
14 0.2
15 0.21
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.2
20 0.23
21 0.25
22 0.26
23 0.27
24 0.28
25 0.28
26 0.34
27 0.33
28 0.34
29 0.36
30 0.42
31 0.45
32 0.49
33 0.55
34 0.56
35 0.55
36 0.57
37 0.55
38 0.55
39 0.6
40 0.63
41 0.62
42 0.61
43 0.61
44 0.56
45 0.56
46 0.49
47 0.41
48 0.33
49 0.28
50 0.21
51 0.16
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.14
58 0.17
59 0.18
60 0.19
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.25
65 0.27
66 0.29
67 0.3
68 0.34
69 0.34
70 0.39
71 0.44
72 0.41
73 0.43
74 0.46
75 0.56
76 0.56
77 0.59
78 0.56
79 0.57
80 0.63
81 0.62
82 0.58
83 0.52
84 0.49
85 0.45
86 0.48
87 0.45
88 0.37
89 0.32
90 0.3
91 0.26
92 0.23
93 0.2
94 0.16
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.18
101 0.24
102 0.32
103 0.41
104 0.49
105 0.58
106 0.68
107 0.78
108 0.84
109 0.88
110 0.9
111 0.91
112 0.92
113 0.89
114 0.86
115 0.85
116 0.82
117 0.73
118 0.71
119 0.68
120 0.67
121 0.68
122 0.69
123 0.68
124 0.69
125 0.71
126 0.66
127 0.64
128 0.63
129 0.58
130 0.52
131 0.51
132 0.51
133 0.57
134 0.63
135 0.6
136 0.6
137 0.63
138 0.65
139 0.59
140 0.58
141 0.54
142 0.46
143 0.46
144 0.37
145 0.33
146 0.28
147 0.28
148 0.21
149 0.16
150 0.19
151 0.19
152 0.27
153 0.3
154 0.34
155 0.42
156 0.51
157 0.59
158 0.57
159 0.59
160 0.56
161 0.59
162 0.6
163 0.54
164 0.51
165 0.42
166 0.42
167 0.39
168 0.35
169 0.28
170 0.3
171 0.32
172 0.28
173 0.32
174 0.37
175 0.41
176 0.47
177 0.49
178 0.45
179 0.42
180 0.42
181 0.4
182 0.36
183 0.29
184 0.22
185 0.18
186 0.15
187 0.12
188 0.1
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.17
200 0.21
201 0.22
202 0.22
203 0.22
204 0.22
205 0.24
206 0.25
207 0.29
208 0.3
209 0.33
210 0.33
211 0.35
212 0.33
213 0.3
214 0.29
215 0.21
216 0.15
217 0.12
218 0.12
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.05
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.11
262 0.15
263 0.17
264 0.19
265 0.19
266 0.22
267 0.23
268 0.25
269 0.31
270 0.33
271 0.31
272 0.31
273 0.33
274 0.3
275 0.29
276 0.27
277 0.25
278 0.21
279 0.2
280 0.18
281 0.17
282 0.17
283 0.17
284 0.19
285 0.15
286 0.19
287 0.21
288 0.25
289 0.24
290 0.26
291 0.35
292 0.4
293 0.43
294 0.46
295 0.52
296 0.57
297 0.66
298 0.7
299 0.72
300 0.75
301 0.76
302 0.77
303 0.75
304 0.73
305 0.67
306 0.67
307 0.58
308 0.51
309 0.45
310 0.4
311 0.34
312 0.31
313 0.3
314 0.25
315 0.24
316 0.21
317 0.2
318 0.15
319 0.14
320 0.17
321 0.19
322 0.21
323 0.21
324 0.27
325 0.32
326 0.36
327 0.4
328 0.37
329 0.35
330 0.39
331 0.47
332 0.43
333 0.41
334 0.41
335 0.4
336 0.38
337 0.37
338 0.3
339 0.22
340 0.22
341 0.19
342 0.14
343 0.12
344 0.11
345 0.14
346 0.16
347 0.22
348 0.26
349 0.3
350 0.34
351 0.37
352 0.41
353 0.4
354 0.4
355 0.37
356 0.38
357 0.41
358 0.41
359 0.41
360 0.42
361 0.46
362 0.52
363 0.57
364 0.62
365 0.6
366 0.63
367 0.67
368 0.67
369 0.63
370 0.55
371 0.46
372 0.37
373 0.31
374 0.25
375 0.18
376 0.12
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.09
383 0.15
384 0.16
385 0.18
386 0.2
387 0.21
388 0.22
389 0.21
390 0.23
391 0.2
392 0.21
393 0.19
394 0.21
395 0.26
396 0.26
397 0.25
398 0.23
399 0.21
400 0.2
401 0.21
402 0.21
403 0.16
404 0.24
405 0.26
406 0.28
407 0.32
408 0.39
409 0.43
410 0.4
411 0.39
412 0.31
413 0.29
414 0.26
415 0.24
416 0.15
417 0.11
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.08
440 0.08
441 0.06
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.07
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.13
458 0.14
459 0.15
460 0.18
461 0.17
462 0.18
463 0.21
464 0.25
465 0.27
466 0.28
467 0.34