Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179UJK4

Protein Details
Accession A0A179UJK4    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-135ESLTPEKGRKRKRGGADDLEEBasic
311-338QQTTQQQEEEKKKKKKKNTPRADVEEGLHydrophilic
540-570GFKVKTKSRGAKGRAGKPKTRSTRRAAAFRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-128KGRKRKRG
145-161DAKEDEKRRSEKAKRRK
321-329KKKKKKKNT
425-455PRRLRVTRAKRVLKSAKDRGRGNGRKRDSGN
531-583RARPDKGPGGFKVKTKSRGAKGRAGKPKTRSTRRAAAFRAGGGVKKKGEAKGS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG bgh:BDBG_04226  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKQKSQPKAAVPAGEENNAGSALAANGSVLPFLAGGGDTTAAMDPMLASLFEKSAGPVKAPQFTSANLAATSKPKGRTSERNAMQSSSSDEDEAAEEALSESSDEVMEDVDDESLTPEKGRKRKRGGADDLEESYMRRVAKEDAKEDEKRRSEKAKRRKVVETVGRESDSSDSEGNDEGNEDSIASPPPLHESLSNNPDAALLDKSARTVFLSNVSTEAIKSKSAKKTLLRHLSSFIPSLPESATPHKIESIRFRSTAFATRSMPKRAALPQARAHGLHHPQHKRIPLHLPRLRRRGFVDEETPNAEQQQTTQQQEEEKKKKKKKNTPRADVEEGLWRTFNEHARASTVAAQPSTSTPAPSNNNGDRSNNTSPAVLGPVESVRVVRDPATRIGKGIAYVQFRDENAVEAALLLDGQKFPPLLPRRLRVTRAKRVLKSAKDRGRGNGRKRDSGNANKTALGVRRGGDRQASFQGRAEGLLGKARTWMAQNPGSNGHGGGGGGGGGGGGGGGGGDGDGGKGSGAFVFEGFRARPDKGPGGFKVKTKSRGAKGRAGKPKTRSTRRAAAFRAGGGVKKKGEAKGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.58
3 0.5
4 0.4
5 0.31
6 0.28
7 0.23
8 0.19
9 0.11
10 0.08
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.05
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.15
44 0.16
45 0.18
46 0.23
47 0.27
48 0.33
49 0.34
50 0.36
51 0.32
52 0.32
53 0.36
54 0.31
55 0.29
56 0.22
57 0.23
58 0.21
59 0.23
60 0.27
61 0.27
62 0.3
63 0.33
64 0.39
65 0.45
66 0.54
67 0.59
68 0.65
69 0.65
70 0.68
71 0.66
72 0.61
73 0.54
74 0.45
75 0.41
76 0.33
77 0.28
78 0.2
79 0.18
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.12
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.13
107 0.21
108 0.3
109 0.4
110 0.49
111 0.57
112 0.66
113 0.75
114 0.8
115 0.81
116 0.81
117 0.76
118 0.69
119 0.61
120 0.54
121 0.44
122 0.35
123 0.27
124 0.21
125 0.17
126 0.13
127 0.14
128 0.18
129 0.25
130 0.3
131 0.32
132 0.36
133 0.42
134 0.49
135 0.51
136 0.54
137 0.54
138 0.52
139 0.54
140 0.58
141 0.62
142 0.66
143 0.73
144 0.75
145 0.75
146 0.78
147 0.78
148 0.75
149 0.74
150 0.73
151 0.7
152 0.64
153 0.6
154 0.55
155 0.48
156 0.42
157 0.34
158 0.26
159 0.2
160 0.15
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.12
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.17
182 0.23
183 0.27
184 0.27
185 0.23
186 0.22
187 0.22
188 0.2
189 0.17
190 0.12
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.14
201 0.15
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.15
208 0.1
209 0.12
210 0.14
211 0.21
212 0.27
213 0.31
214 0.36
215 0.41
216 0.48
217 0.56
218 0.64
219 0.59
220 0.54
221 0.52
222 0.5
223 0.44
224 0.36
225 0.26
226 0.19
227 0.16
228 0.16
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.17
233 0.21
234 0.19
235 0.19
236 0.22
237 0.23
238 0.24
239 0.3
240 0.33
241 0.31
242 0.31
243 0.31
244 0.3
245 0.3
246 0.35
247 0.28
248 0.25
249 0.25
250 0.3
251 0.34
252 0.35
253 0.34
254 0.27
255 0.29
256 0.29
257 0.36
258 0.34
259 0.35
260 0.36
261 0.39
262 0.39
263 0.36
264 0.34
265 0.3
266 0.32
267 0.32
268 0.36
269 0.36
270 0.39
271 0.42
272 0.47
273 0.42
274 0.4
275 0.45
276 0.44
277 0.51
278 0.51
279 0.57
280 0.58
281 0.66
282 0.64
283 0.57
284 0.53
285 0.48
286 0.48
287 0.42
288 0.4
289 0.32
290 0.32
291 0.33
292 0.3
293 0.24
294 0.2
295 0.17
296 0.11
297 0.1
298 0.17
299 0.18
300 0.19
301 0.2
302 0.21
303 0.25
304 0.33
305 0.42
306 0.43
307 0.49
308 0.58
309 0.67
310 0.74
311 0.8
312 0.84
313 0.86
314 0.87
315 0.88
316 0.88
317 0.88
318 0.87
319 0.81
320 0.71
321 0.61
322 0.57
323 0.47
324 0.38
325 0.29
326 0.21
327 0.17
328 0.2
329 0.22
330 0.17
331 0.18
332 0.18
333 0.2
334 0.2
335 0.2
336 0.23
337 0.22
338 0.19
339 0.18
340 0.18
341 0.16
342 0.17
343 0.2
344 0.14
345 0.12
346 0.12
347 0.18
348 0.21
349 0.24
350 0.3
351 0.29
352 0.34
353 0.35
354 0.36
355 0.33
356 0.37
357 0.37
358 0.33
359 0.3
360 0.24
361 0.23
362 0.22
363 0.21
364 0.13
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.13
376 0.15
377 0.22
378 0.27
379 0.26
380 0.26
381 0.27
382 0.25
383 0.22
384 0.24
385 0.23
386 0.2
387 0.2
388 0.22
389 0.22
390 0.21
391 0.24
392 0.19
393 0.16
394 0.14
395 0.13
396 0.11
397 0.09
398 0.09
399 0.06
400 0.06
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.16
409 0.22
410 0.3
411 0.35
412 0.41
413 0.48
414 0.54
415 0.6
416 0.62
417 0.66
418 0.68
419 0.72
420 0.76
421 0.71
422 0.75
423 0.77
424 0.75
425 0.75
426 0.75
427 0.73
428 0.72
429 0.72
430 0.7
431 0.72
432 0.72
433 0.72
434 0.72
435 0.68
436 0.69
437 0.69
438 0.69
439 0.67
440 0.69
441 0.68
442 0.64
443 0.6
444 0.53
445 0.51
446 0.47
447 0.41
448 0.34
449 0.27
450 0.22
451 0.27
452 0.28
453 0.29
454 0.31
455 0.29
456 0.3
457 0.36
458 0.39
459 0.34
460 0.34
461 0.36
462 0.3
463 0.29
464 0.26
465 0.19
466 0.17
467 0.21
468 0.19
469 0.15
470 0.17
471 0.17
472 0.18
473 0.19
474 0.22
475 0.23
476 0.29
477 0.31
478 0.32
479 0.35
480 0.34
481 0.32
482 0.27
483 0.21
484 0.16
485 0.13
486 0.1
487 0.07
488 0.06
489 0.05
490 0.04
491 0.03
492 0.02
493 0.02
494 0.02
495 0.02
496 0.01
497 0.01
498 0.01
499 0.02
500 0.02
501 0.02
502 0.02
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.04
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.08
514 0.09
515 0.13
516 0.13
517 0.16
518 0.19
519 0.21
520 0.25
521 0.3
522 0.37
523 0.38
524 0.45
525 0.46
526 0.52
527 0.53
528 0.54
529 0.57
530 0.57
531 0.6
532 0.63
533 0.67
534 0.68
535 0.75
536 0.76
537 0.76
538 0.77
539 0.79
540 0.81
541 0.79
542 0.78
543 0.75
544 0.8
545 0.82
546 0.83
547 0.81
548 0.78
549 0.81
550 0.81
551 0.82
552 0.76
553 0.74
554 0.66
555 0.58
556 0.56
557 0.48
558 0.45
559 0.4
560 0.42
561 0.35
562 0.37
563 0.42