Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N7A1D0

Protein Details
Accession A0A5N7A1D0    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-163ESEKWDKRMEKKQRHRDDVABasic
250-273DLRKAEEVRLKKRRERRGEEDADVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-266RLKKRRERR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPTEHSTEQPASKVSDDNEPVSITAKEQNNAAEDFTASQKESQGAEASGSPSKVVESVKEDDTATKARERRERFKALQARAKSATERNLKETAAETQRLATDPSLLSSLSRKHAFASHNLLKADTEAAGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRMEKKQRHRDDVAFQDYTQDARKVYKRQLREIQPDLEAYEREKLAAIEKAAANGDLEIVETNDGEMIAVDKNGSFYSTADTVGFTENKPDRAAVDKLVGDLRKAEEVRLKKRRERRGEEDADVTYINEKNKQFNQKLARFYNKYTTEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.32
4 0.31
5 0.31
6 0.28
7 0.27
8 0.26
9 0.25
10 0.18
11 0.22
12 0.24
13 0.23
14 0.24
15 0.26
16 0.26
17 0.27
18 0.26
19 0.19
20 0.16
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.18
28 0.18
29 0.18
30 0.18
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.18
35 0.18
36 0.17
37 0.15
38 0.13
39 0.13
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.17
44 0.2
45 0.22
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.24
50 0.25
51 0.22
52 0.25
53 0.27
54 0.33
55 0.42
56 0.49
57 0.54
58 0.59
59 0.66
60 0.64
61 0.71
62 0.72
63 0.71
64 0.72
65 0.65
66 0.62
67 0.56
68 0.54
69 0.47
70 0.43
71 0.44
72 0.44
73 0.43
74 0.42
75 0.42
76 0.4
77 0.37
78 0.34
79 0.32
80 0.28
81 0.27
82 0.22
83 0.21
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.14
88 0.13
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.12
95 0.15
96 0.17
97 0.19
98 0.18
99 0.18
100 0.24
101 0.25
102 0.26
103 0.33
104 0.33
105 0.36
106 0.35
107 0.34
108 0.29
109 0.28
110 0.24
111 0.15
112 0.1
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.14
124 0.16
125 0.17
126 0.19
127 0.23
128 0.27
129 0.27
130 0.26
131 0.26
132 0.32
133 0.28
134 0.27
135 0.25
136 0.25
137 0.32
138 0.42
139 0.49
140 0.53
141 0.63
142 0.73
143 0.79
144 0.81
145 0.78
146 0.72
147 0.68
148 0.64
149 0.58
150 0.48
151 0.38
152 0.33
153 0.29
154 0.26
155 0.21
156 0.15
157 0.11
158 0.15
159 0.2
160 0.23
161 0.31
162 0.36
163 0.39
164 0.46
165 0.54
166 0.58
167 0.6
168 0.59
169 0.53
170 0.48
171 0.44
172 0.37
173 0.3
174 0.22
175 0.16
176 0.15
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.11
190 0.09
191 0.08
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.15
221 0.11
222 0.19
223 0.21
224 0.22
225 0.23
226 0.22
227 0.21
228 0.25
229 0.27
230 0.21
231 0.22
232 0.21
233 0.22
234 0.26
235 0.25
236 0.2
237 0.2
238 0.2
239 0.22
240 0.22
241 0.23
242 0.27
243 0.35
244 0.45
245 0.52
246 0.58
247 0.61
248 0.7
249 0.78
250 0.81
251 0.83
252 0.8
253 0.82
254 0.81
255 0.76
256 0.7
257 0.6
258 0.5
259 0.41
260 0.33
261 0.26
262 0.22
263 0.21
264 0.24
265 0.25
266 0.31
267 0.39
268 0.49
269 0.48
270 0.55
271 0.63
272 0.63
273 0.7
274 0.71
275 0.73
276 0.67
277 0.69
278 0.7
279 0.63
280 0.6
281 0.56
282 0.54
283 0.52
284 0.49
285 0.48
286 0.43
287 0.43
288 0.41