FuNGI

A0A5N6ZYP5

Protein Details

Accession

A0A5N6ZYP5

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-50	GSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKKKPTAKPAIPIAG	Hydrophilic
132-153	DENQFTRPVRLQRRDPRARSHE	Hydrophilic
520-540	GTDTSRKKGKSKDQSSQPTPQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-45	MRIRRPKAADPLVRPKKKPTAKPA
412-434	EKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE
497-509	PLKKGTAAAPRKR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MATPTNDLNARTSTGSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKKKPTAKPAIPIAGNGPALKAVSSRPATSNPPSMPHSERGKPSSSGADFSANGFSGPLLSETYTDYPLVTTKRALREGLKHHIARFASKKTVDPRDENQFTRPVRLQRRDPRARSHEMTSEKSQGMQKTTSESSHQIDEVEREELEARKAAREKERAENLAQIAPSAGSAPKRANAPKQKTQQVSKTDMTPEEMAKTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLEATGKMRMIPVEKWYRFNAKNQFKALTIEEAEKFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPSGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEDAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKDYEQEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDEESSDDSEAERLKEEERKAEEEKNKKDVTTSSKGNNTPSGRPKHTDPLKKGTAAAPRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKGKSKDQSSQPTPQPSSRNMSPVASSQMPLGKKRVRNVPLGGAGSGSDADGGAGSGAEMSESGKTKKLKLNPPAVSQGGTPQGSRAGSPTPLAGRSFSGSRASSPESFRGQTRVSTPVHAGNQSFPTPAEIHAAIPPSGILSSDLLKIFRPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGTLKES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.29
3	0.3
4	0.36
5	0.35
6	0.38
7	0.43
8	0.49
9	0.55
10	0.6
11	0.64
12	0.67
13	0.74
14	0.76
15	0.81
16	0.81
17	0.79
18	0.78
19	0.81
20	0.82
21	0.82
22	0.77
23	0.75
24	0.76
25	0.77
26	0.78
27	0.77
28	0.78
29	0.77
30	0.82
31	0.81
32	0.78
33	0.69
34	0.61
35	0.53
36	0.47
37	0.41
38	0.33
39	0.25
40	0.18
41	0.18
42	0.17
43	0.15
44	0.12
45	0.18
46	0.21
47	0.23
48	0.25
49	0.29
50	0.35
51	0.4
52	0.46
53	0.39
54	0.41
55	0.42
56	0.45
57	0.45
58	0.47
59	0.49
60	0.48
61	0.53
62	0.52
63	0.54
64	0.5
65	0.48
66	0.49
67	0.43
68	0.38
69	0.33
70	0.32
71	0.28
72	0.28
73	0.27
74	0.19
75	0.17
76	0.15
77	0.13
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.08
82	0.08
83	0.09
84	0.13
85	0.15
86	0.16
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.17
91	0.19
92	0.17
93	0.2
94	0.25
95	0.31
96	0.34
97	0.37
98	0.38
99	0.44
100	0.5
101	0.55
102	0.57
103	0.53
104	0.51
105	0.54
106	0.5
107	0.49
108	0.48
109	0.44
110	0.43
111	0.42
112	0.47
113	0.49
114	0.58
115	0.56
116	0.56
117	0.56
118	0.59
119	0.63
120	0.59
121	0.54
122	0.52
123	0.47
124	0.48
125	0.48
126	0.47
127	0.52
128	0.58
129	0.64
130	0.66
131	0.76
132	0.8
133	0.8
134	0.81
135	0.78
136	0.78
137	0.72
138	0.67
139	0.63
140	0.59
141	0.59
142	0.53
143	0.51
144	0.43
145	0.42
146	0.42
147	0.38
148	0.36
149	0.32
150	0.28
151	0.29
152	0.31
153	0.29
154	0.28
155	0.28
156	0.27
157	0.26
158	0.26
159	0.21
160	0.2
161	0.2
162	0.19
163	0.16
164	0.14
165	0.13
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.16
170	0.15
171	0.19
172	0.23
173	0.28
174	0.34
175	0.4
176	0.43
177	0.49
178	0.55
179	0.52
180	0.5
181	0.49
182	0.42
183	0.38
184	0.33
185	0.24
186	0.18
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.11
193	0.12
194	0.14
195	0.2
196	0.24
197	0.33
198	0.42
199	0.49
200	0.56
201	0.63
202	0.69
203	0.7
204	0.72
205	0.7
206	0.66
207	0.64
208	0.57
209	0.52
210	0.47
211	0.41
212	0.37
213	0.31
214	0.26
215	0.22
216	0.22
217	0.22
218	0.22
219	0.23
220	0.22
221	0.22
222	0.23
223	0.21
224	0.22
225	0.26
226	0.27
227	0.29
228	0.28
229	0.26
230	0.25
231	0.24
232	0.22
233	0.17
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.16
242	0.13
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.09
267	0.1
268	0.17
269	0.26
270	0.28
271	0.31
272	0.33
273	0.4
274	0.4
275	0.46
276	0.5
277	0.48
278	0.52
279	0.52
280	0.5
281	0.43
282	0.44
283	0.38
284	0.3
285	0.23
286	0.2
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.14
291	0.13
292	0.13
293	0.16
294	0.14
295	0.2
296	0.29
297	0.38
298	0.44
299	0.49
300	0.5
301	0.54
302	0.56
303	0.52
304	0.53
305	0.46
306	0.41
307	0.43
308	0.46
309	0.41
310	0.41
311	0.43
312	0.35
313	0.33
314	0.35
315	0.31
316	0.26
317	0.27
318	0.34
319	0.37
320	0.43
321	0.42
322	0.4
323	0.41
324	0.44
325	0.42
326	0.44
327	0.41
328	0.38
329	0.41
330	0.4
331	0.37
332	0.31
333	0.29
334	0.2
335	0.14
336	0.1
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.11
371	0.14
372	0.17
373	0.24
374	0.31
375	0.32
376	0.4
377	0.46
378	0.51
379	0.52
380	0.5
381	0.44
382	0.4
383	0.38
384	0.32
385	0.26
386	0.19
387	0.17
388	0.18
389	0.17
390	0.16
391	0.17
392	0.17
393	0.17
394	0.17
395	0.21
396	0.23
397	0.25
398	0.31
399	0.3
400	0.36
401	0.42
402	0.46
403	0.49
404	0.55
405	0.58
406	0.6
407	0.65
408	0.65
409	0.67
410	0.67
411	0.64
412	0.63
413	0.65
414	0.63
415	0.66
416	0.69
417	0.71
418	0.73
419	0.73
420	0.76
421	0.73
422	0.69
423	0.63
424	0.59
425	0.51
426	0.43
427	0.4
428	0.32
429	0.28
430	0.26
431	0.23
432	0.17
433	0.15
434	0.13
435	0.13
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.13
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.11
444	0.12
445	0.13
446	0.12
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.17
451	0.19
452	0.23
453	0.26
454	0.3
455	0.33
456	0.4
457	0.46
458	0.49
459	0.54
460	0.55
461	0.52
462	0.47
463	0.46
464	0.43
465	0.43
466	0.41
467	0.4
468	0.37
469	0.43
470	0.44
471	0.45
472	0.47
473	0.42
474	0.43
475	0.47
476	0.5
477	0.47
478	0.49
479	0.51
480	0.54
481	0.59
482	0.61
483	0.58
484	0.59
485	0.59
486	0.56
487	0.54
488	0.49
489	0.49
490	0.5
491	0.51
492	0.5
493	0.49
494	0.51
495	0.52
496	0.52
497	0.47
498	0.46
499	0.42
500	0.41
501	0.4
502	0.37
503	0.35
504	0.3
505	0.3
506	0.24
507	0.21
508	0.2
509	0.21
510	0.24
511	0.31
512	0.34
513	0.34
514	0.41
515	0.51
516	0.57
517	0.63
518	0.7
519	0.74
520	0.8
521	0.8
522	0.8
523	0.75
524	0.73
525	0.67
526	0.63
527	0.58
528	0.52
529	0.54
530	0.48
531	0.46
532	0.39
533	0.37
534	0.33
535	0.3
536	0.31
537	0.25
538	0.22
539	0.2
540	0.24
541	0.25
542	0.26
543	0.31
544	0.33
545	0.37
546	0.43
547	0.51
548	0.5
549	0.54
550	0.55
551	0.54
552	0.52
553	0.49
554	0.42
555	0.32
556	0.28
557	0.22
558	0.18
559	0.12
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.04
564	0.04
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.04
573	0.07
574	0.1
575	0.12
576	0.18
577	0.2
578	0.26
579	0.34
580	0.42
581	0.49
582	0.56
583	0.65
584	0.65
585	0.68
586	0.68
587	0.62
588	0.53
589	0.44
590	0.39
591	0.35
592	0.3
593	0.25
594	0.2
595	0.23
596	0.22
597	0.22
598	0.2
599	0.17
600	0.17
601	0.18
602	0.2
603	0.19
604	0.21
605	0.22
606	0.21
607	0.2
608	0.22
609	0.22
610	0.21
611	0.24
612	0.22
613	0.23
614	0.26
615	0.29
616	0.31
617	0.33
618	0.36
619	0.36
620	0.38
621	0.38
622	0.38
623	0.35
624	0.34
625	0.34
626	0.35
627	0.31
628	0.33
629	0.33
630	0.35
631	0.37
632	0.37
633	0.35
634	0.33
635	0.35
636	0.33
637	0.31
638	0.25
639	0.25
640	0.22
641	0.22
642	0.23
643	0.19
644	0.19
645	0.21
646	0.23
647	0.19
648	0.18
649	0.17
650	0.13
651	0.12
652	0.11
653	0.1
654	0.09
655	0.11
656	0.15
657	0.16
658	0.16
659	0.19
660	0.23
661	0.25
662	0.26
663	0.28
664	0.28
665	0.36
666	0.43
667	0.48
668	0.48
669	0.56
670	0.65
671	0.64
672	0.63
673	0.55
674	0.49
675	0.44
676	0.48
677	0.45
678	0.38
679	0.37
680	0.35
681	0.35
682	0.34
683	0.33
684	0.25
685	0.19
686	0.18
687	0.19
688	0.21
689	0.22
690	0.23
691	0.29
692	0.31
693	0.3
694	0.34

A0A5N6ZYP5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer