Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N7A3U4

Protein Details
Accession A0A5N7A3U4    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-109GAKSEVGEKKKRKRAPPDPNAPKRALBasic
247-275ASPADTKKASPEKKRTRTPASREKKVQEEHydrophilic
278-303ASARKAAATENKRGKKKRKSEAAADEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-106EVGEKKKRKRAPPDPNAPK
228-297PPRAGKRRRSEAAKAAKEAASPADTKKASPEKKRTRTPASREKKVQEETPASARKAAATENKRGKKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRKDDTVTVNVDDFTRTRDSVIVSLAQLQAAVSKLSEAYINHANTVLNRGPTVDIGNIASITNSLYESGLLGALGGARATSPGAKSEVGEKKKRKRAPPDPNAPKRALTPFFLYMKHNRAEIGEEMGPNAKPKDVSEEGTRRWAEMPEEEKEHWKKIYADNLAVYKEKMKAYKAGLPYSDDAKAANQLQQEADRAETTPAEEEEEEEEEEEEEEEEEEPEPVREPTPPRAGKRRRSEAAKAAKEAASPADTKKASPEKKRTRTPASREKKVQEETPASARKAAATENKRGKKKRKSEAAADE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.21
4 0.19
5 0.19
6 0.2
7 0.22
8 0.22
9 0.24
10 0.21
11 0.18
12 0.21
13 0.2
14 0.18
15 0.15
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.11
25 0.09
26 0.13
27 0.2
28 0.21
29 0.21
30 0.22
31 0.22
32 0.2
33 0.26
34 0.24
35 0.18
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.19
40 0.2
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.11
47 0.09
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.03
64 0.03
65 0.03
66 0.03
67 0.04
68 0.06
69 0.06
70 0.08
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.2
75 0.28
76 0.34
77 0.43
78 0.5
79 0.58
80 0.67
81 0.75
82 0.75
83 0.77
84 0.82
85 0.84
86 0.85
87 0.87
88 0.88
89 0.89
90 0.85
91 0.76
92 0.66
93 0.58
94 0.54
95 0.45
96 0.36
97 0.31
98 0.31
99 0.31
100 0.31
101 0.31
102 0.3
103 0.32
104 0.31
105 0.27
106 0.23
107 0.21
108 0.23
109 0.2
110 0.19
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.13
117 0.13
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.16
122 0.16
123 0.19
124 0.24
125 0.28
126 0.29
127 0.35
128 0.35
129 0.28
130 0.27
131 0.25
132 0.2
133 0.19
134 0.22
135 0.17
136 0.2
137 0.2
138 0.26
139 0.26
140 0.27
141 0.23
142 0.23
143 0.23
144 0.24
145 0.31
146 0.26
147 0.26
148 0.26
149 0.27
150 0.26
151 0.24
152 0.2
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.2
159 0.22
160 0.28
161 0.29
162 0.28
163 0.27
164 0.27
165 0.27
166 0.26
167 0.23
168 0.17
169 0.14
170 0.13
171 0.15
172 0.13
173 0.15
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.15
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.12
212 0.16
213 0.23
214 0.33
215 0.39
216 0.44
217 0.54
218 0.63
219 0.68
220 0.75
221 0.77
222 0.75
223 0.76
224 0.77
225 0.76
226 0.78
227 0.72
228 0.64
229 0.58
230 0.51
231 0.44
232 0.38
233 0.31
234 0.22
235 0.19
236 0.18
237 0.23
238 0.22
239 0.22
240 0.3
241 0.38
242 0.44
243 0.53
244 0.63
245 0.66
246 0.75
247 0.85
248 0.85
249 0.86
250 0.87
251 0.87
252 0.87
253 0.85
254 0.86
255 0.84
256 0.82
257 0.8
258 0.75
259 0.7
260 0.68
261 0.64
262 0.58
263 0.59
264 0.58
265 0.51
266 0.48
267 0.43
268 0.36
269 0.32
270 0.34
271 0.35
272 0.35
273 0.44
274 0.52
275 0.61
276 0.69
277 0.77
278 0.82
279 0.82
280 0.87
281 0.88
282 0.88
283 0.88