Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MIB6

Protein Details
Accession C5MIB6    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-295KQNLDNNNKEKPKKRKYLFDKPDELAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-284KPKKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_05809  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSSENKYKYRIEIQQMMFVSGESNDPPVETTSLIEDIVRGQVIEILTQSTRTANSRGSRSITPEDVIFLIRHDKAKVNRLRTYLSWKDVRKNAKDQEGGGTESLIENDAATGGAAGGNNPNQGNPNQANDSSKMLSRYKKSKIRLPWELQFMFTEQHLETQDENETIDDEEKAASIQRLKKLKMADDRTKNMTREEYVHWSECRQASFTFRKAKRFREWAQMTQLCDTRPNDDVIDILGFLTFEIVCSLTEEAMNIKNSEDKLHQIQKEKQNLDNNNKEKPKKRKYLFDKPDELASPIMPHHIEEAWRRLQATDFKHKAARSFGGGMIKTRTKLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.57
3 0.52
4 0.43
5 0.34
6 0.27
7 0.18
8 0.17
9 0.11
10 0.12
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.13
15 0.14
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.13
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.11
26 0.08
27 0.07
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.11
37 0.13
38 0.15
39 0.18
40 0.22
41 0.28
42 0.32
43 0.35
44 0.38
45 0.38
46 0.41
47 0.44
48 0.39
49 0.35
50 0.3
51 0.28
52 0.24
53 0.23
54 0.17
55 0.13
56 0.15
57 0.16
58 0.18
59 0.19
60 0.25
61 0.29
62 0.38
63 0.45
64 0.47
65 0.51
66 0.52
67 0.54
68 0.5
69 0.54
70 0.5
71 0.49
72 0.5
73 0.48
74 0.53
75 0.55
76 0.61
77 0.58
78 0.61
79 0.61
80 0.61
81 0.59
82 0.53
83 0.52
84 0.45
85 0.41
86 0.32
87 0.26
88 0.17
89 0.15
90 0.15
91 0.09
92 0.06
93 0.05
94 0.04
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.03
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.06
104 0.06
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.16
111 0.16
112 0.19
113 0.2
114 0.21
115 0.22
116 0.22
117 0.25
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.27
123 0.31
124 0.36
125 0.42
126 0.49
127 0.52
128 0.56
129 0.6
130 0.64
131 0.67
132 0.65
133 0.61
134 0.61
135 0.56
136 0.5
137 0.41
138 0.33
139 0.25
140 0.19
141 0.17
142 0.09
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.1
150 0.11
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.1
163 0.14
164 0.2
165 0.25
166 0.26
167 0.29
168 0.31
169 0.36
170 0.41
171 0.46
172 0.48
173 0.51
174 0.54
175 0.56
176 0.59
177 0.53
178 0.46
179 0.4
180 0.33
181 0.29
182 0.29
183 0.29
184 0.28
185 0.29
186 0.27
187 0.26
188 0.29
189 0.27
190 0.24
191 0.2
192 0.18
193 0.22
194 0.27
195 0.33
196 0.39
197 0.4
198 0.49
199 0.53
200 0.6
201 0.61
202 0.65
203 0.63
204 0.63
205 0.66
206 0.61
207 0.65
208 0.61
209 0.54
210 0.48
211 0.46
212 0.36
213 0.35
214 0.31
215 0.24
216 0.22
217 0.22
218 0.19
219 0.17
220 0.17
221 0.13
222 0.12
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.12
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.16
245 0.16
246 0.19
247 0.19
248 0.2
249 0.27
250 0.35
251 0.39
252 0.44
253 0.52
254 0.58
255 0.65
256 0.64
257 0.63
258 0.64
259 0.68
260 0.7
261 0.71
262 0.67
263 0.67
264 0.72
265 0.73
266 0.74
267 0.76
268 0.77
269 0.78
270 0.81
271 0.82
272 0.84
273 0.87
274 0.88
275 0.86
276 0.83
277 0.74
278 0.72
279 0.63
280 0.55
281 0.44
282 0.35
283 0.27
284 0.2
285 0.22
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.2
291 0.23
292 0.29
293 0.31
294 0.32
295 0.32
296 0.31
297 0.35
298 0.38
299 0.41
300 0.45
301 0.45
302 0.47
303 0.52
304 0.53
305 0.52
306 0.51
307 0.46
308 0.41
309 0.4
310 0.39
311 0.42
312 0.41
313 0.39
314 0.4
315 0.4