Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M3I5

Protein Details
Accession C5M3I5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
209-233VQDSSVTQRRKRPRRSDSIHSNTGEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG ctp:CTRG_00624  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MNLNQPHQGNSLEGEDNISHHQQQIQDQQQLSMSNLPNSSTSSSIQPHIHQPTHPQLTPYQNPPQPQPSPSNSSYVKSMDMNQQYNSPNQQTQPPLPPQGQYQSNNQQTSPSNYYTQPIYNPPLPPLPAPVSYQQQTQQLPTTTITTTTSTSSASQVPQQSSFQFDYSHSYTTQQSHNFPSTSSNTSLSNNFQPFQPIHESSAPQQPQVQDSSVTQRRKRPRRSDSIHSNTGENELKQLALKSSDVPLSDLAHKIKQLENDVISHTSTSTSNSNSDQSKLKENKETQRSLFGMVWLLNSCELSPTAVIPRNRIYARYVQVCADNSLAPVSPASFGKLVKILYPNITTRRLGMRGQSKYHYCGIKLNGDENMQSQLLSLQQQQAEKAQKHLQHRHSRQSSLLSGYSGQIQSPASSPNSTGSFEDTPPAPAPPPQHHHQQTSQPHTPTFTPINSPSILFSATLNDQLPSVSHMKYIPNLFQLLNSNADPNSNPYTPIQLPSIYPYLTQDVDYDIADTLYSLYKVHVNAIFESLRYMQLKKLFSSFNNFNSILTAPVFKLYTTDSVIDWIMRCDLIMYKKMIRMLTKLQLQLLIPQEQLYQLKQISNGYIKSLASSLVNSKVSVNFVIMKLKLAKHFINLLNRLIKVIETGQPASRILTDDAEKNSMIQDWMKLNLSEVINREIPCGDKNIDNLNQILINDVIQLIKPDTSSGNNTEEDSINPTLTMNKFANYVSNLPSRFPDVNARLFLILSSNLLTTCLREISLSGGEGFGAWWIVRCWVDEYLAWSFEVGGFFQDDLQEAMEQQQRQQQQQQQQLQETPNLLQQSVDQQSSSDYQLQQQQQQHQEESGDMIFGNIDLLETSFDLDSKTLSQQYSQQNQAAESLLNFDTNIDNLLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.2
4 0.24
5 0.24
6 0.21
7 0.22
8 0.25
9 0.25
10 0.32
11 0.4
12 0.43
13 0.47
14 0.46
15 0.46
16 0.45
17 0.43
18 0.38
19 0.35
20 0.3
21 0.28
22 0.28
23 0.27
24 0.26
25 0.28
26 0.28
27 0.23
28 0.22
29 0.24
30 0.26
31 0.3
32 0.32
33 0.32
34 0.39
35 0.44
36 0.46
37 0.42
38 0.47
39 0.52
40 0.56
41 0.55
42 0.48
43 0.46
44 0.53
45 0.57
46 0.56
47 0.56
48 0.51
49 0.54
50 0.57
51 0.6
52 0.55
53 0.53
54 0.54
55 0.51
56 0.55
57 0.54
58 0.55
59 0.48
60 0.46
61 0.45
62 0.39
63 0.35
64 0.29
65 0.32
66 0.34
67 0.39
68 0.4
69 0.37
70 0.41
71 0.41
72 0.43
73 0.46
74 0.41
75 0.38
76 0.37
77 0.43
78 0.43
79 0.47
80 0.5
81 0.5
82 0.51
83 0.49
84 0.48
85 0.46
86 0.47
87 0.49
88 0.44
89 0.47
90 0.51
91 0.57
92 0.57
93 0.53
94 0.5
95 0.45
96 0.51
97 0.47
98 0.4
99 0.36
100 0.35
101 0.37
102 0.35
103 0.34
104 0.3
105 0.3
106 0.33
107 0.35
108 0.35
109 0.36
110 0.37
111 0.37
112 0.34
113 0.34
114 0.31
115 0.29
116 0.3
117 0.32
118 0.34
119 0.34
120 0.36
121 0.34
122 0.37
123 0.37
124 0.36
125 0.38
126 0.32
127 0.33
128 0.31
129 0.3
130 0.23
131 0.23
132 0.22
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.17
137 0.16
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.22
143 0.25
144 0.27
145 0.28
146 0.29
147 0.28
148 0.31
149 0.31
150 0.26
151 0.23
152 0.21
153 0.25
154 0.26
155 0.27
156 0.22
157 0.23
158 0.25
159 0.27
160 0.33
161 0.3
162 0.31
163 0.35
164 0.39
165 0.36
166 0.34
167 0.36
168 0.34
169 0.34
170 0.32
171 0.28
172 0.26
173 0.28
174 0.3
175 0.28
176 0.31
177 0.3
178 0.28
179 0.27
180 0.29
181 0.27
182 0.29
183 0.32
184 0.26
185 0.28
186 0.31
187 0.33
188 0.31
189 0.41
190 0.37
191 0.31
192 0.32
193 0.29
194 0.28
195 0.29
196 0.27
197 0.19
198 0.2
199 0.29
200 0.33
201 0.39
202 0.42
203 0.48
204 0.58
205 0.67
206 0.76
207 0.77
208 0.79
209 0.83
210 0.85
211 0.87
212 0.87
213 0.85
214 0.81
215 0.71
216 0.62
217 0.52
218 0.49
219 0.42
220 0.3
221 0.24
222 0.17
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.13
227 0.12
228 0.13
229 0.12
230 0.14
231 0.16
232 0.15
233 0.16
234 0.15
235 0.16
236 0.18
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.21
242 0.23
243 0.24
244 0.26
245 0.26
246 0.25
247 0.25
248 0.26
249 0.25
250 0.22
251 0.19
252 0.15
253 0.12
254 0.11
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.15
259 0.17
260 0.21
261 0.2
262 0.23
263 0.25
264 0.25
265 0.34
266 0.37
267 0.39
268 0.44
269 0.5
270 0.57
271 0.6
272 0.62
273 0.54
274 0.55
275 0.51
276 0.46
277 0.39
278 0.31
279 0.24
280 0.2
281 0.19
282 0.13
283 0.13
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.12
293 0.17
294 0.18
295 0.2
296 0.23
297 0.28
298 0.28
299 0.29
300 0.27
301 0.29
302 0.34
303 0.35
304 0.33
305 0.28
306 0.31
307 0.31
308 0.28
309 0.22
310 0.18
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.11
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.16
327 0.16
328 0.17
329 0.2
330 0.22
331 0.24
332 0.27
333 0.24
334 0.24
335 0.27
336 0.27
337 0.25
338 0.28
339 0.33
340 0.34
341 0.37
342 0.4
343 0.38
344 0.38
345 0.42
346 0.37
347 0.29
348 0.29
349 0.29
350 0.3
351 0.28
352 0.27
353 0.24
354 0.23
355 0.22
356 0.18
357 0.18
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.13
367 0.14
368 0.15
369 0.19
370 0.25
371 0.24
372 0.27
373 0.29
374 0.32
375 0.4
376 0.49
377 0.53
378 0.57
379 0.62
380 0.68
381 0.67
382 0.63
383 0.57
384 0.52
385 0.44
386 0.37
387 0.31
388 0.21
389 0.18
390 0.17
391 0.17
392 0.13
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.11
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.13
406 0.15
407 0.15
408 0.15
409 0.16
410 0.14
411 0.14
412 0.14
413 0.14
414 0.1
415 0.12
416 0.15
417 0.19
418 0.23
419 0.24
420 0.33
421 0.36
422 0.4
423 0.41
424 0.46
425 0.48
426 0.51
427 0.53
428 0.45
429 0.42
430 0.4
431 0.36
432 0.31
433 0.26
434 0.19
435 0.17
436 0.17
437 0.2
438 0.18
439 0.18
440 0.15
441 0.13
442 0.13
443 0.1
444 0.09
445 0.08
446 0.08
447 0.1
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.09
454 0.11
455 0.09
456 0.1
457 0.11
458 0.12
459 0.15
460 0.16
461 0.15
462 0.14
463 0.16
464 0.15
465 0.15
466 0.17
467 0.15
468 0.16
469 0.15
470 0.14
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.13
475 0.16
476 0.14
477 0.15
478 0.15
479 0.19
480 0.19
481 0.21
482 0.18
483 0.15
484 0.15
485 0.16
486 0.18
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.13
491 0.13
492 0.13
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.08
508 0.08
509 0.11
510 0.12
511 0.13
512 0.13
513 0.16
514 0.16
515 0.13
516 0.15
517 0.13
518 0.14
519 0.14
520 0.14
521 0.15
522 0.2
523 0.22
524 0.21
525 0.24
526 0.23
527 0.23
528 0.3
529 0.3
530 0.27
531 0.31
532 0.31
533 0.27
534 0.27
535 0.26
536 0.19
537 0.16
538 0.14
539 0.09
540 0.1
541 0.1
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.11
546 0.12
547 0.12
548 0.11
549 0.12
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.1
554 0.08
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.1
559 0.12
560 0.14
561 0.17
562 0.19
563 0.21
564 0.25
565 0.26
566 0.24
567 0.26
568 0.28
569 0.32
570 0.34
571 0.33
572 0.3
573 0.3
574 0.29
575 0.29
576 0.27
577 0.22
578 0.18
579 0.17
580 0.17
581 0.17
582 0.18
583 0.14
584 0.14
585 0.14
586 0.15
587 0.16
588 0.16
589 0.17
590 0.2
591 0.19
592 0.18
593 0.18
594 0.17
595 0.17
596 0.16
597 0.13
598 0.1
599 0.11
600 0.12
601 0.15
602 0.16
603 0.15
604 0.16
605 0.17
606 0.17
607 0.17
608 0.16
609 0.13
610 0.13
611 0.17
612 0.16
613 0.17
614 0.19
615 0.21
616 0.23
617 0.25
618 0.25
619 0.24
620 0.3
621 0.32
622 0.37
623 0.37
624 0.39
625 0.38
626 0.37
627 0.35
628 0.29
629 0.24
630 0.17
631 0.17
632 0.17
633 0.16
634 0.18
635 0.19
636 0.2
637 0.21
638 0.2
639 0.18
640 0.16
641 0.14
642 0.15
643 0.15
644 0.18
645 0.19
646 0.2
647 0.19
648 0.17
649 0.17
650 0.15
651 0.14
652 0.12
653 0.13
654 0.13
655 0.15
656 0.17
657 0.16
658 0.16
659 0.2
660 0.2
661 0.2
662 0.2
663 0.22
664 0.24
665 0.25
666 0.25
667 0.2
668 0.21
669 0.19
670 0.21
671 0.19
672 0.17
673 0.2
674 0.25
675 0.27
676 0.27
677 0.26
678 0.24
679 0.23
680 0.21
681 0.2
682 0.13
683 0.1
684 0.09
685 0.09
686 0.08
687 0.07
688 0.08
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.09
693 0.11
694 0.14
695 0.17
696 0.19
697 0.22
698 0.22
699 0.23
700 0.24
701 0.23
702 0.21
703 0.22
704 0.2
705 0.17
706 0.16
707 0.15
708 0.18
709 0.18
710 0.22
711 0.18
712 0.18
713 0.19
714 0.19
715 0.23
716 0.21
717 0.23
718 0.22
719 0.28
720 0.27
721 0.27
722 0.29
723 0.3
724 0.28
725 0.27
726 0.32
727 0.31
728 0.36
729 0.36
730 0.36
731 0.31
732 0.3
733 0.27
734 0.2
735 0.15
736 0.11
737 0.11
738 0.1
739 0.09
740 0.11
741 0.11
742 0.1
743 0.12
744 0.11
745 0.11
746 0.1
747 0.11
748 0.13
749 0.15
750 0.14
751 0.12
752 0.11
753 0.11
754 0.11
755 0.1
756 0.07
757 0.06
758 0.05
759 0.06
760 0.06
761 0.1
762 0.1
763 0.11
764 0.14
765 0.15
766 0.17
767 0.17
768 0.21
769 0.21
770 0.21
771 0.19
772 0.16
773 0.15
774 0.15
775 0.15
776 0.11
777 0.09
778 0.09
779 0.09
780 0.1
781 0.1
782 0.09
783 0.09
784 0.1
785 0.09
786 0.09
787 0.14
788 0.19
789 0.19
790 0.21
791 0.27
792 0.31
793 0.36
794 0.44
795 0.47
796 0.51
797 0.61
798 0.66
799 0.66
800 0.66
801 0.66
802 0.6
803 0.56
804 0.49
805 0.4
806 0.36
807 0.32
808 0.26
809 0.21
810 0.2
811 0.24
812 0.26
813 0.26
814 0.21
815 0.2
816 0.23
817 0.25
818 0.27
819 0.24
820 0.21
821 0.25
822 0.33
823 0.38
824 0.42
825 0.46
826 0.52
827 0.55
828 0.59
829 0.57
830 0.5
831 0.46
832 0.39
833 0.36
834 0.28
835 0.19
836 0.14
837 0.12
838 0.1
839 0.09
840 0.09
841 0.05
842 0.05
843 0.05
844 0.05
845 0.06
846 0.07
847 0.08
848 0.08
849 0.09
850 0.09
851 0.09
852 0.11
853 0.12
854 0.17
855 0.19
856 0.2
857 0.22
858 0.29
859 0.39
860 0.46
861 0.48
862 0.47
863 0.45
864 0.45
865 0.44
866 0.38
867 0.28
868 0.21
869 0.2
870 0.17
871 0.15
872 0.15
873 0.14
874 0.14
875 0.13