Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N7A6B1

Protein Details
Accession A0A5N7A6B1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-174FSLAKYMLRKRRKYMKRFTVLPHydrophilic
368-392YTMKSNKRGAYHRKRNRWARVQSVVHydrophilic
546-568QAAGNPSRKKRKVVTQDTPTTAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSYVRPHQFVALRLPSEFTKIQKIEPDSTVFLGKFGSFPANQIIGRPFYLTFEILDDADEKDGSCLRVIPAAELHAETLIAEGEGEGDGEELDMNEDGTPMRTNRETVDDASTQKLTWEEIEALKKESGGAGREIISKLLESHQALDQKTSFSLAKYMLRKRRKYMKRFTVLPLDVSILTNHMMEDQGAARIMELRDEMIGLLGCWGNVHHGGDASLEQAIAAKPNGRYLVVDDTGGLVVAAMAERMGILYPHDGDDYEEQGSSDEPKKNEAEQAQDDEQSATDSSTRRPARPAHMSASGNSITFLHPNKQPNLSLLKYFGYNLDNPDETHPLHKHLKTVSWLQLLDPNADPIYSEEPEIIPESELYTMKSNKRGAYHRKRNRWARVQSVVNEARAGEFDGLIVATAMDPSSVLKYAVPLLAGSAHVAVYSPSIEPLTELMDLYSTQRKTAFINKRQQLKEQKLQQSSDQNDANENDPQDSYLSELMDEFYLDPTLLLAPTLQNSRVRPWQVLPGRTHPLMSMRGGAEGYIFHGIRVIPTQQAIQAAGNPSRKKRKVVTQDTPTTAVDSGSGVDVEMKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.35
4 0.37
5 0.36
6 0.31
7 0.33
8 0.34
9 0.36
10 0.41
11 0.46
12 0.45
13 0.45
14 0.47
15 0.39
16 0.39
17 0.4
18 0.32
19 0.27
20 0.23
21 0.2
22 0.16
23 0.15
24 0.18
25 0.14
26 0.16
27 0.21
28 0.24
29 0.23
30 0.26
31 0.28
32 0.26
33 0.26
34 0.26
35 0.22
36 0.2
37 0.23
38 0.2
39 0.17
40 0.16
41 0.17
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.12
46 0.13
47 0.12
48 0.1
49 0.11
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.16
62 0.16
63 0.12
64 0.11
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.08
87 0.1
88 0.1
89 0.15
90 0.16
91 0.17
92 0.19
93 0.24
94 0.25
95 0.25
96 0.3
97 0.28
98 0.28
99 0.3
100 0.29
101 0.23
102 0.21
103 0.2
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.17
109 0.23
110 0.23
111 0.25
112 0.24
113 0.23
114 0.21
115 0.2
116 0.19
117 0.16
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.19
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.17
129 0.15
130 0.16
131 0.2
132 0.24
133 0.24
134 0.26
135 0.24
136 0.21
137 0.21
138 0.21
139 0.18
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.22
144 0.28
145 0.37
146 0.44
147 0.53
148 0.58
149 0.64
150 0.72
151 0.76
152 0.79
153 0.81
154 0.82
155 0.8
156 0.8
157 0.76
158 0.75
159 0.65
160 0.56
161 0.46
162 0.37
163 0.29
164 0.25
165 0.2
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.18
219 0.16
220 0.15
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.09
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.03
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.14
253 0.16
254 0.16
255 0.19
256 0.21
257 0.21
258 0.25
259 0.24
260 0.24
261 0.22
262 0.26
263 0.24
264 0.23
265 0.23
266 0.19
267 0.17
268 0.13
269 0.11
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.17
275 0.19
276 0.19
277 0.23
278 0.26
279 0.31
280 0.38
281 0.4
282 0.35
283 0.39
284 0.39
285 0.35
286 0.36
287 0.29
288 0.22
289 0.19
290 0.16
291 0.11
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.17
296 0.21
297 0.23
298 0.25
299 0.25
300 0.25
301 0.29
302 0.27
303 0.24
304 0.21
305 0.2
306 0.18
307 0.17
308 0.16
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.14
314 0.15
315 0.17
316 0.17
317 0.16
318 0.2
319 0.19
320 0.22
321 0.28
322 0.28
323 0.29
324 0.28
325 0.31
326 0.29
327 0.33
328 0.33
329 0.29
330 0.28
331 0.25
332 0.28
333 0.26
334 0.25
335 0.2
336 0.16
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.1
341 0.13
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.13
348 0.11
349 0.08
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.13
356 0.17
357 0.2
358 0.26
359 0.28
360 0.3
361 0.35
362 0.42
363 0.5
364 0.57
365 0.65
366 0.69
367 0.76
368 0.83
369 0.88
370 0.89
371 0.88
372 0.84
373 0.8
374 0.78
375 0.72
376 0.64
377 0.64
378 0.56
379 0.46
380 0.39
381 0.31
382 0.24
383 0.19
384 0.18
385 0.09
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.06
403 0.08
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.11
432 0.17
433 0.15
434 0.16
435 0.18
436 0.19
437 0.22
438 0.32
439 0.39
440 0.42
441 0.52
442 0.57
443 0.66
444 0.68
445 0.74
446 0.74
447 0.72
448 0.73
449 0.72
450 0.75
451 0.71
452 0.7
453 0.68
454 0.66
455 0.6
456 0.58
457 0.51
458 0.42
459 0.4
460 0.39
461 0.36
462 0.3
463 0.28
464 0.22
465 0.19
466 0.19
467 0.16
468 0.15
469 0.15
470 0.13
471 0.12
472 0.1
473 0.1
474 0.11
475 0.1
476 0.11
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.07
488 0.1
489 0.13
490 0.16
491 0.2
492 0.22
493 0.28
494 0.36
495 0.38
496 0.38
497 0.38
498 0.45
499 0.48
500 0.53
501 0.53
502 0.52
503 0.55
504 0.52
505 0.5
506 0.41
507 0.39
508 0.36
509 0.32
510 0.29
511 0.23
512 0.24
513 0.23
514 0.21
515 0.17
516 0.13
517 0.14
518 0.15
519 0.14
520 0.12
521 0.15
522 0.15
523 0.16
524 0.19
525 0.19
526 0.15
527 0.17
528 0.18
529 0.18
530 0.2
531 0.2
532 0.17
533 0.2
534 0.23
535 0.28
536 0.35
537 0.38
538 0.46
539 0.55
540 0.59
541 0.63
542 0.66
543 0.71
544 0.74
545 0.8
546 0.81
547 0.8
548 0.84
549 0.81
550 0.76
551 0.66
552 0.57
553 0.46
554 0.35
555 0.26
556 0.17
557 0.14
558 0.11
559 0.1
560 0.08