Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5ME26

Protein Details
Accession C5ME26    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
551-570SNNNNQSKSHKKKGHSPTSAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001660  SAM  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
IPR037635  VTS1_SAM  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0043488  P:regulation of mRNA stability  
KEGG ctp:CTRG_04318  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07647  SAM_2  
CDD cd09556  SAM_VTS1_fungal  
Amino Acid Sequences MDQQQKQPQGSIDKSPSGDYPQRPIVLSPPPLDSTSFNAVDALPTGHANRQQSVGYNLQHEFETLTANLDLDLTSPSRSITQSAPPPQQSVDAQLQQEPKQSLSSGSSAQSSKPALVAPSASRYEPRLRSELLGKTASSLLGETSAGGLSPAQQFTSLNPQLDSLLNKSSSNLVGSPSAGNSFLSGHLAGIPNRPQSVNDFSSIFKRHEQQQQQHQQFFSAPQTSNQSNFYSDLIVFCNWIENLSPQDNITMIDYLCANLPLDILLTFQSKLDLHLQGGAGAGTGVGAGAGAGAGAGAGIGVGGSHYQQNQQTHLLPQFSMSPYNQYNQDLYSEMDQLNINDDRSKPKQPSALRTSQYANLVDKPLRPKSADPFVNNAKYASSPSQQQHMHQGPIDRAKSPTSHLYEKTNFLQLAAANSNSSTPPVNGNGMTSYYNQYMSTPLGQSNSPGNTNQGKDIMDLKLGALATINSRVALDSNRKHPHASNWNQNQSGQQQSQQHNVSRSHAMNYEDSINRTLNSSSVPANMHKTTYNSNSNNNSNVNNNSNTTNSNNNNQSKSHKKKGHSPTSATQMQHNNSSTVSTNTSSGTSSMPIEVSSLELLNNIPAWLKLLRLHKYTEFLKDIPWRDLIELDNDQLEAKGVAALGARRKLLKAFDVVKNNPPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.47
3 0.43
4 0.42
5 0.46
6 0.41
7 0.43
8 0.44
9 0.45
10 0.44
11 0.43
12 0.41
13 0.41
14 0.42
15 0.38
16 0.35
17 0.36
18 0.36
19 0.37
20 0.33
21 0.31
22 0.32
23 0.3
24 0.26
25 0.25
26 0.23
27 0.22
28 0.21
29 0.17
30 0.11
31 0.12
32 0.14
33 0.17
34 0.22
35 0.24
36 0.25
37 0.26
38 0.26
39 0.28
40 0.31
41 0.33
42 0.31
43 0.33
44 0.32
45 0.3
46 0.29
47 0.26
48 0.22
49 0.16
50 0.16
51 0.12
52 0.14
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.08
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.17
68 0.24
69 0.32
70 0.39
71 0.46
72 0.46
73 0.47
74 0.45
75 0.46
76 0.39
77 0.36
78 0.35
79 0.32
80 0.32
81 0.34
82 0.38
83 0.36
84 0.41
85 0.36
86 0.31
87 0.28
88 0.27
89 0.25
90 0.23
91 0.24
92 0.2
93 0.2
94 0.23
95 0.22
96 0.22
97 0.24
98 0.22
99 0.2
100 0.18
101 0.18
102 0.15
103 0.16
104 0.18
105 0.16
106 0.2
107 0.21
108 0.21
109 0.22
110 0.25
111 0.32
112 0.35
113 0.38
114 0.36
115 0.36
116 0.39
117 0.44
118 0.44
119 0.4
120 0.36
121 0.31
122 0.29
123 0.28
124 0.25
125 0.19
126 0.14
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.07
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.13
143 0.24
144 0.24
145 0.22
146 0.22
147 0.22
148 0.23
149 0.25
150 0.25
151 0.17
152 0.18
153 0.19
154 0.18
155 0.19
156 0.19
157 0.18
158 0.18
159 0.16
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.1
175 0.12
176 0.12
177 0.16
178 0.19
179 0.19
180 0.21
181 0.21
182 0.2
183 0.22
184 0.28
185 0.26
186 0.24
187 0.23
188 0.23
189 0.28
190 0.3
191 0.28
192 0.24
193 0.26
194 0.32
195 0.4
196 0.48
197 0.5
198 0.58
199 0.67
200 0.7
201 0.7
202 0.63
203 0.54
204 0.47
205 0.41
206 0.34
207 0.28
208 0.22
209 0.21
210 0.26
211 0.26
212 0.27
213 0.27
214 0.24
215 0.21
216 0.22
217 0.2
218 0.16
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.09
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.14
263 0.14
264 0.12
265 0.12
266 0.1
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.03
271 0.03
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.01
276 0.01
277 0.01
278 0.01
279 0.01
280 0.01
281 0.01
282 0.01
283 0.01
284 0.01
285 0.01
286 0.01
287 0.01
288 0.01
289 0.01
290 0.02
291 0.03
292 0.04
293 0.05
294 0.07
295 0.11
296 0.13
297 0.15
298 0.17
299 0.18
300 0.2
301 0.21
302 0.2
303 0.16
304 0.15
305 0.16
306 0.14
307 0.15
308 0.13
309 0.15
310 0.15
311 0.17
312 0.18
313 0.16
314 0.16
315 0.14
316 0.15
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.17
331 0.2
332 0.25
333 0.24
334 0.27
335 0.34
336 0.36
337 0.44
338 0.45
339 0.49
340 0.45
341 0.46
342 0.45
343 0.4
344 0.39
345 0.32
346 0.26
347 0.2
348 0.21
349 0.2
350 0.21
351 0.24
352 0.24
353 0.25
354 0.25
355 0.26
356 0.29
357 0.37
358 0.38
359 0.35
360 0.37
361 0.4
362 0.41
363 0.39
364 0.33
365 0.25
366 0.21
367 0.22
368 0.19
369 0.15
370 0.19
371 0.19
372 0.26
373 0.26
374 0.27
375 0.34
376 0.33
377 0.33
378 0.29
379 0.31
380 0.27
381 0.33
382 0.33
383 0.25
384 0.23
385 0.23
386 0.23
387 0.23
388 0.27
389 0.25
390 0.29
391 0.29
392 0.35
393 0.36
394 0.38
395 0.37
396 0.34
397 0.29
398 0.25
399 0.25
400 0.18
401 0.19
402 0.17
403 0.15
404 0.11
405 0.11
406 0.12
407 0.1
408 0.11
409 0.08
410 0.08
411 0.1
412 0.11
413 0.13
414 0.12
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.14
419 0.14
420 0.15
421 0.14
422 0.15
423 0.14
424 0.14
425 0.14
426 0.14
427 0.14
428 0.13
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.14
433 0.17
434 0.17
435 0.17
436 0.16
437 0.2
438 0.23
439 0.24
440 0.23
441 0.22
442 0.2
443 0.2
444 0.23
445 0.19
446 0.15
447 0.14
448 0.13
449 0.13
450 0.12
451 0.1
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.1
456 0.1
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.13
462 0.2
463 0.23
464 0.32
465 0.38
466 0.39
467 0.41
468 0.42
469 0.48
470 0.5
471 0.54
472 0.55
473 0.59
474 0.65
475 0.64
476 0.62
477 0.56
478 0.5
479 0.49
480 0.4
481 0.36
482 0.38
483 0.4
484 0.46
485 0.47
486 0.47
487 0.45
488 0.45
489 0.43
490 0.41
491 0.39
492 0.35
493 0.33
494 0.31
495 0.27
496 0.28
497 0.3
498 0.25
499 0.26
500 0.26
501 0.23
502 0.21
503 0.21
504 0.19
505 0.14
506 0.14
507 0.14
508 0.13
509 0.15
510 0.17
511 0.18
512 0.24
513 0.24
514 0.24
515 0.24
516 0.26
517 0.29
518 0.34
519 0.41
520 0.38
521 0.44
522 0.49
523 0.51
524 0.52
525 0.48
526 0.44
527 0.39
528 0.41
529 0.38
530 0.34
531 0.33
532 0.3
533 0.3
534 0.3
535 0.29
536 0.33
537 0.31
538 0.37
539 0.44
540 0.47
541 0.48
542 0.48
543 0.54
544 0.56
545 0.62
546 0.65
547 0.64
548 0.63
549 0.7
550 0.79
551 0.81
552 0.78
553 0.76
554 0.71
555 0.72
556 0.73
557 0.64
558 0.59
559 0.56
560 0.51
561 0.51
562 0.46
563 0.39
564 0.33
565 0.35
566 0.3
567 0.25
568 0.25
569 0.19
570 0.19
571 0.19
572 0.19
573 0.18
574 0.17
575 0.15
576 0.14
577 0.14
578 0.14
579 0.13
580 0.12
581 0.12
582 0.11
583 0.11
584 0.1
585 0.1
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.1
590 0.1
591 0.09
592 0.08
593 0.08
594 0.11
595 0.11
596 0.13
597 0.18
598 0.25
599 0.32
600 0.34
601 0.39
602 0.39
603 0.45
604 0.47
605 0.48
606 0.45
607 0.39
608 0.43
609 0.47
610 0.47
611 0.44
612 0.44
613 0.38
614 0.34
615 0.36
616 0.31
617 0.29
618 0.27
619 0.25
620 0.22
621 0.21
622 0.2
623 0.18
624 0.17
625 0.1
626 0.09
627 0.08
628 0.07
629 0.08
630 0.1
631 0.14
632 0.19
633 0.23
634 0.25
635 0.26
636 0.28
637 0.31
638 0.34
639 0.34
640 0.36
641 0.4
642 0.46
643 0.54
644 0.56