Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M7R3

Protein Details
Accession C5M7R3    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-179QESNVPQRARRRRMQNNFPLNVHydrophilic
297-322GDENESDKNKRRRKRKKVTPIEVGSSBasic
434-465DQKIEIQKHIRNKLRPRYKPGQVKNENNPDVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-313KNKRRRKRKK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ctp:CTRG_01895  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd15489  PHD_SF  
Amino Acid Sequences MNEESSQIEECLICLESILPTNKVGKIPCCPSKRYHDQCVLQWSRTSNSCPTCRNRFHKIEITDNQNILETVSIQDRLLPNPAINDIPSQFIIREQPPTNPVVEDDLNDESCYMCSNFTSRNGISCQQCGCHFHLNCLGVETIDESICWCCPICDYNQESNVPQRARRRRMQNNFPLNVDYTDNSSRMKRRGQEQRNRLVIHNDNDELDVDFLYEDDDVLLEEMNYSQQHFLPYHSPVINGGVISRREQKQRAKLTQEEVQSWEMFDVARKDNEEYASVDAEGGSNFTHPEKRGETGDENESDKNKRRRKRKKVTPIEVGSSSSTSSSNPVNQPVNHSTSRISQLIDQLKTPGRKPITLTNHQTIIQPNNAFPLPSTNIMPSDSPMSISPAANSPMESVSYSSDDNDYTRQVQLQKQQNPMIQSRQSVKELTLDQKIEIQKHIRNKLRPRYKPGQVKNENNPDVITSEENYITINKTISRKIYNHILNQSEPIEEFFKSDDIKLRDIIDKYIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.1
4 0.16
5 0.19
6 0.18
7 0.2
8 0.24
9 0.27
10 0.31
11 0.33
12 0.32
13 0.38
14 0.45
15 0.52
16 0.54
17 0.55
18 0.57
19 0.63
20 0.69
21 0.69
22 0.7
23 0.71
24 0.71
25 0.72
26 0.77
27 0.72
28 0.63
29 0.58
30 0.52
31 0.46
32 0.45
33 0.43
34 0.41
35 0.44
36 0.47
37 0.52
38 0.57
39 0.62
40 0.68
41 0.71
42 0.73
43 0.72
44 0.74
45 0.75
46 0.72
47 0.71
48 0.68
49 0.69
50 0.64
51 0.58
52 0.5
53 0.42
54 0.37
55 0.27
56 0.21
57 0.13
58 0.1
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.16
63 0.17
64 0.18
65 0.22
66 0.21
67 0.19
68 0.2
69 0.22
70 0.19
71 0.18
72 0.2
73 0.16
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.15
78 0.16
79 0.21
80 0.2
81 0.26
82 0.25
83 0.27
84 0.29
85 0.31
86 0.3
87 0.25
88 0.24
89 0.22
90 0.21
91 0.18
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.13
98 0.12
99 0.13
100 0.11
101 0.08
102 0.08
103 0.11
104 0.14
105 0.17
106 0.24
107 0.22
108 0.25
109 0.28
110 0.33
111 0.33
112 0.34
113 0.31
114 0.27
115 0.3
116 0.3
117 0.31
118 0.35
119 0.32
120 0.32
121 0.37
122 0.36
123 0.34
124 0.31
125 0.27
126 0.17
127 0.17
128 0.15
129 0.1
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.08
139 0.1
140 0.12
141 0.19
142 0.25
143 0.3
144 0.33
145 0.35
146 0.35
147 0.39
148 0.43
149 0.37
150 0.36
151 0.41
152 0.47
153 0.53
154 0.6
155 0.65
156 0.69
157 0.77
158 0.83
159 0.83
160 0.83
161 0.77
162 0.71
163 0.62
164 0.52
165 0.44
166 0.35
167 0.24
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.21
173 0.24
174 0.27
175 0.32
176 0.32
177 0.39
178 0.49
179 0.59
180 0.65
181 0.69
182 0.74
183 0.75
184 0.72
185 0.64
186 0.6
187 0.55
188 0.48
189 0.42
190 0.34
191 0.27
192 0.26
193 0.25
194 0.19
195 0.13
196 0.09
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.13
220 0.15
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.15
225 0.17
226 0.15
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.13
232 0.19
233 0.2
234 0.25
235 0.31
236 0.38
237 0.43
238 0.52
239 0.56
240 0.55
241 0.55
242 0.55
243 0.53
244 0.48
245 0.4
246 0.34
247 0.29
248 0.23
249 0.2
250 0.16
251 0.11
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.06
275 0.09
276 0.1
277 0.14
278 0.15
279 0.17
280 0.18
281 0.22
282 0.23
283 0.23
284 0.25
285 0.23
286 0.24
287 0.23
288 0.24
289 0.24
290 0.31
291 0.38
292 0.43
293 0.49
294 0.59
295 0.68
296 0.78
297 0.85
298 0.88
299 0.89
300 0.92
301 0.93
302 0.91
303 0.84
304 0.77
305 0.66
306 0.57
307 0.46
308 0.35
309 0.27
310 0.18
311 0.14
312 0.1
313 0.11
314 0.11
315 0.15
316 0.16
317 0.2
318 0.24
319 0.24
320 0.3
321 0.32
322 0.35
323 0.31
324 0.31
325 0.28
326 0.28
327 0.32
328 0.26
329 0.23
330 0.2
331 0.26
332 0.32
333 0.31
334 0.27
335 0.27
336 0.31
337 0.33
338 0.32
339 0.33
340 0.29
341 0.3
342 0.33
343 0.39
344 0.42
345 0.48
346 0.54
347 0.49
348 0.49
349 0.48
350 0.47
351 0.41
352 0.37
353 0.34
354 0.28
355 0.25
356 0.25
357 0.24
358 0.22
359 0.18
360 0.2
361 0.18
362 0.18
363 0.2
364 0.18
365 0.19
366 0.2
367 0.2
368 0.16
369 0.16
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.16
374 0.17
375 0.17
376 0.17
377 0.16
378 0.18
379 0.17
380 0.17
381 0.15
382 0.13
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.12
387 0.14
388 0.14
389 0.13
390 0.14
391 0.13
392 0.15
393 0.16
394 0.16
395 0.16
396 0.17
397 0.2
398 0.23
399 0.28
400 0.35
401 0.43
402 0.48
403 0.53
404 0.57
405 0.56
406 0.57
407 0.56
408 0.55
409 0.48
410 0.46
411 0.45
412 0.44
413 0.44
414 0.4
415 0.36
416 0.34
417 0.35
418 0.35
419 0.36
420 0.32
421 0.3
422 0.35
423 0.38
424 0.35
425 0.36
426 0.38
427 0.37
428 0.46
429 0.55
430 0.57
431 0.63
432 0.71
433 0.76
434 0.81
435 0.84
436 0.84
437 0.84
438 0.85
439 0.86
440 0.86
441 0.86
442 0.85
443 0.86
444 0.86
445 0.88
446 0.8
447 0.7
448 0.61
449 0.51
450 0.42
451 0.35
452 0.27
453 0.17
454 0.18
455 0.17
456 0.17
457 0.16
458 0.17
459 0.17
460 0.16
461 0.16
462 0.18
463 0.23
464 0.28
465 0.34
466 0.39
467 0.4
468 0.44
469 0.52
470 0.55
471 0.58
472 0.6
473 0.58
474 0.52
475 0.54
476 0.49
477 0.4
478 0.34
479 0.29
480 0.23
481 0.19
482 0.19
483 0.17
484 0.19
485 0.19
486 0.21
487 0.27
488 0.28
489 0.31
490 0.32
491 0.34
492 0.37
493 0.37