FuNGI

A0A5N7B7F7

Protein Details

Accession

A0A5N7B7F7

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-40	GSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKRKP	Basic
134-153	SQFTRPVRLQRRDPRARSHE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-44	PMRIRRPKAADPLVRPKRKPVAKP
411-434	REKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE
492-510	RPKHTDPLKKGTAAAPRKR

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MATPTNDLNARTPTGSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKRKPVAKPGIPISGNGIASKAVSSRPVPSNPLSIPHSEKGKPASLGADFSANGFSGPLLSETYTDYPLVTTKRALREGLKHHIARFASKKTVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARSHEMTSDKSQGVQKMASDSSHQMDEAEREDLEARKAAREKERAENLAQIAPSAGSAQKRANMPKQKTQQVSKTDMTPEEMAKTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLEATGKMRMIPVEKWYRFNAKNQFKALTIEEAEKFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPSGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEEAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKEYEQEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDDESSDDSEVERLKEEERKAEEEKNKKDAITSSSKGNNTPSGRPKHTDPLKKGTAAAPRKRLGSPNMSDASGTDTSRKKAKSKDLSSQPTPQSSSRIMSPVASSQMPLGKKRVRNIPLGSAGSGSDADGGAGSGGEMSESGKTKKLKLNPPVVSQGGTPQGSRAGSPTPLAGRSFSGSRASSPESFRGQTRVSTPVLPGNQSFPTPAEIHAAIPPSGILSSDLLKIFRPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGMLKES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.33
3	0.33
4	0.38
5	0.38
6	0.43
7	0.48
8	0.54
9	0.58
10	0.65
11	0.68
12	0.7
13	0.75
14	0.76
15	0.81
16	0.81
17	0.79
18	0.78
19	0.81
20	0.82
21	0.83
22	0.76
23	0.75
24	0.76
25	0.76
26	0.75
27	0.75
28	0.75
29	0.74
30	0.8
31	0.76
32	0.75
33	0.67
34	0.59
35	0.53
36	0.48
37	0.41
38	0.33
39	0.28
40	0.19
41	0.19
42	0.19
43	0.15
44	0.11
45	0.14
46	0.16
47	0.22
48	0.28
49	0.31
50	0.35
51	0.36
52	0.41
53	0.39
54	0.42
55	0.39
56	0.38
57	0.41
58	0.4
59	0.44
60	0.39
61	0.42
62	0.42
63	0.44
64	0.4
65	0.35
66	0.34
67	0.29
68	0.3
69	0.26
70	0.23
71	0.18
72	0.17
73	0.17
74	0.13
75	0.11
76	0.09
77	0.08
78	0.06
79	0.07
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.09
84	0.13
85	0.15
86	0.16
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.17
91	0.19
92	0.17
93	0.2
94	0.25
95	0.31
96	0.34
97	0.37
98	0.38
99	0.44
100	0.5
101	0.55
102	0.57
103	0.53
104	0.51
105	0.54
106	0.5
107	0.49
108	0.48
109	0.44
110	0.43
111	0.42
112	0.47
113	0.49
114	0.58
115	0.54
116	0.53
117	0.53
118	0.55
119	0.57
120	0.54
121	0.51
122	0.48
123	0.46
124	0.47
125	0.45
126	0.46
127	0.52
128	0.57
129	0.62
130	0.65
131	0.75
132	0.79
133	0.8
134	0.81
135	0.78
136	0.78
137	0.72
138	0.67
139	0.63
140	0.59
141	0.59
142	0.53
143	0.51
144	0.43
145	0.42
146	0.41
147	0.36
148	0.33
149	0.29
150	0.25
151	0.24
152	0.25
153	0.22
154	0.21
155	0.21
156	0.2
157	0.2
158	0.19
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.15
163	0.14
164	0.12
165	0.12
166	0.14
167	0.15
168	0.15
169	0.16
170	0.15
171	0.19
172	0.23
173	0.28
174	0.34
175	0.4
176	0.43
177	0.49
178	0.55
179	0.52
180	0.5
181	0.49
182	0.42
183	0.38
184	0.33
185	0.24
186	0.18
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.11
191	0.09
192	0.12
193	0.13
194	0.17
195	0.22
196	0.28
197	0.36
198	0.43
199	0.48
200	0.55
201	0.62
202	0.66
203	0.68
204	0.69
205	0.67
206	0.64
207	0.65
208	0.57
209	0.52
210	0.47
211	0.41
212	0.37
213	0.31
214	0.26
215	0.22
216	0.22
217	0.22
218	0.22
219	0.23
220	0.22
221	0.22
222	0.23
223	0.21
224	0.22
225	0.26
226	0.27
227	0.29
228	0.28
229	0.26
230	0.25
231	0.24
232	0.22
233	0.17
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.16
242	0.13
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.09
267	0.11
268	0.17
269	0.26
270	0.28
271	0.31
272	0.33
273	0.4
274	0.4
275	0.46
276	0.5
277	0.48
278	0.52
279	0.52
280	0.5
281	0.43
282	0.44
283	0.38
284	0.3
285	0.23
286	0.2
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.14
291	0.13
292	0.13
293	0.16
294	0.14
295	0.2
296	0.29
297	0.38
298	0.44
299	0.49
300	0.5
301	0.54
302	0.56
303	0.52
304	0.53
305	0.46
306	0.41
307	0.43
308	0.46
309	0.41
310	0.41
311	0.43
312	0.35
313	0.33
314	0.35
315	0.31
316	0.26
317	0.27
318	0.34
319	0.37
320	0.43
321	0.42
322	0.4
323	0.41
324	0.45
325	0.42
326	0.44
327	0.41
328	0.38
329	0.41
330	0.4
331	0.37
332	0.31
333	0.29
334	0.2
335	0.14
336	0.1
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.11
371	0.14
372	0.17
373	0.24
374	0.31
375	0.32
376	0.4
377	0.46
378	0.51
379	0.52
380	0.5
381	0.44
382	0.4
383	0.38
384	0.32
385	0.26
386	0.19
387	0.17
388	0.18
389	0.17
390	0.16
391	0.17
392	0.17
393	0.17
394	0.17
395	0.21
396	0.23
397	0.25
398	0.31
399	0.3
400	0.36
401	0.42
402	0.46
403	0.49
404	0.55
405	0.58
406	0.6
407	0.65
408	0.65
409	0.67
410	0.67
411	0.64
412	0.63
413	0.64
414	0.63
415	0.66
416	0.69
417	0.71
418	0.73
419	0.73
420	0.75
421	0.73
422	0.69
423	0.63
424	0.59
425	0.51
426	0.43
427	0.4
428	0.32
429	0.28
430	0.26
431	0.23
432	0.17
433	0.15
434	0.13
435	0.13
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.13
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.11
444	0.12
445	0.13
446	0.12
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.17
451	0.19
452	0.23
453	0.26
454	0.3
455	0.32
456	0.4
457	0.46
458	0.49
459	0.53
460	0.53
461	0.51
462	0.46
463	0.45
464	0.4
465	0.38
466	0.36
467	0.32
468	0.32
469	0.36
470	0.37
471	0.37
472	0.36
473	0.38
474	0.33
475	0.39
476	0.42
477	0.44
478	0.47
479	0.49
480	0.51
481	0.54
482	0.59
483	0.61
484	0.58
485	0.59
486	0.59
487	0.56
488	0.54
489	0.49
490	0.49
491	0.5
492	0.51
493	0.5
494	0.49
495	0.51
496	0.52
497	0.52
498	0.47
499	0.46
500	0.42
501	0.41
502	0.4
503	0.37
504	0.35
505	0.3
506	0.3
507	0.24
508	0.21
509	0.2
510	0.22
511	0.24
512	0.31
513	0.34
514	0.34
515	0.4
516	0.5
517	0.55
518	0.59
519	0.67
520	0.71
521	0.75
522	0.74
523	0.74
524	0.67
525	0.6
526	0.57
527	0.48
528	0.43
529	0.37
530	0.35
531	0.28
532	0.27
533	0.24
534	0.22
535	0.22
536	0.2
537	0.2
538	0.18
539	0.16
540	0.16
541	0.2
542	0.22
543	0.23
544	0.28
545	0.32
546	0.37
547	0.43
548	0.51
549	0.5
550	0.56
551	0.57
552	0.56
553	0.56
554	0.52
555	0.46
556	0.37
557	0.33
558	0.26
559	0.22
560	0.15
561	0.09
562	0.07
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.04
574	0.07
575	0.1
576	0.12
577	0.18
578	0.2
579	0.26
580	0.34
581	0.42
582	0.49
583	0.56
584	0.65
585	0.65
586	0.68
587	0.68
588	0.62
589	0.53
590	0.44
591	0.39
592	0.35
593	0.3
594	0.25
595	0.2
596	0.23
597	0.22
598	0.22
599	0.2
600	0.17
601	0.17
602	0.18
603	0.2
604	0.19
605	0.21
606	0.22
607	0.21
608	0.2
609	0.22
610	0.22
611	0.21
612	0.24
613	0.22
614	0.23
615	0.26
616	0.29
617	0.31
618	0.33
619	0.36
620	0.36
621	0.38
622	0.38
623	0.38
624	0.35
625	0.34
626	0.34
627	0.33
628	0.3
629	0.3
630	0.3
631	0.32
632	0.33
633	0.32
634	0.3
635	0.29
636	0.29
637	0.27
638	0.27
639	0.21
640	0.22
641	0.21
642	0.21
643	0.21
644	0.2
645	0.21
646	0.22
647	0.24
648	0.19
649	0.18
650	0.17
651	0.13
652	0.12
653	0.11
654	0.1
655	0.09
656	0.11
657	0.15
658	0.16
659	0.16
660	0.19
661	0.23
662	0.25
663	0.26
664	0.28
665	0.28
666	0.36
667	0.43
668	0.48
669	0.48
670	0.56
671	0.65
672	0.64
673	0.63
674	0.55
675	0.49
676	0.44
677	0.48
678	0.45
679	0.38
680	0.37
681	0.35
682	0.35
683	0.34
684	0.33
685	0.25
686	0.19
687	0.18
688	0.19
689	0.21
690	0.22
691	0.23
692	0.27
693	0.3
694	0.28
695	0.32

A0A5N7B7F7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer