Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDZ8

Protein Details
Accession C5MDZ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MAKSSKVDKKLSKKKEEKEVKKVEESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-18KKLSKKKEEK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005635  C:nuclear envelope  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0008139  F:nuclear localization sequence binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043047  F:single-stranded telomeric DNA binding  
KEGG ctp:CTRG_04290  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MAKSSKVDKKLSKKKEEKEVKKVEESSTEESSSTDSSSEEESSSDDSSSSDSSSDEESSSDEEEEEEEKKVKKVAKKEESSDSSSSDSSSSDSSSSESDSDSDSSSDEEEEEKEVKKESSSSSDSDSSSSDSEDDNEEEEEDKKKESSSSSDSDSDSDSSSSSSSSSSESDSDSDSESESEDEKDSKKRKIEETEEEEESAPVKKAKAATDEEPATLFVGRLSWNIDDDWLKREFEHIGGVIGARVIMERATGKSRGYGYVDFEGKSFAEKALAEMQGKEIDGRPINLDMSTGKPHASKSNDRAKQFGDSQSPPSDTLFIGNLSFNANRDGLFNTFGEYGNVISCRIPTHPDTQQPKGFGYVQFSSVDEAKAALEALNGQYIEGRPCRLDFSAPRDNNNNNNNNNRRGGFGGRERSATPRSGPSTPRPNRNTEFKGTKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.89
3 0.9
4 0.89
5 0.89
6 0.9
7 0.85
8 0.83
9 0.78
10 0.71
11 0.67
12 0.63
13 0.57
14 0.5
15 0.44
16 0.36
17 0.33
18 0.32
19 0.26
20 0.2
21 0.15
22 0.11
23 0.12
24 0.15
25 0.15
26 0.13
27 0.12
28 0.13
29 0.16
30 0.17
31 0.15
32 0.13
33 0.12
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.14
41 0.15
42 0.13
43 0.12
44 0.13
45 0.14
46 0.16
47 0.14
48 0.12
49 0.11
50 0.12
51 0.14
52 0.14
53 0.14
54 0.16
55 0.18
56 0.2
57 0.24
58 0.29
59 0.34
60 0.42
61 0.51
62 0.58
63 0.63
64 0.66
65 0.71
66 0.7
67 0.69
68 0.61
69 0.52
70 0.44
71 0.38
72 0.33
73 0.24
74 0.19
75 0.15
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.17
105 0.18
106 0.22
107 0.24
108 0.25
109 0.27
110 0.29
111 0.29
112 0.27
113 0.25
114 0.21
115 0.18
116 0.17
117 0.13
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.13
127 0.15
128 0.13
129 0.14
130 0.13
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.21
135 0.23
136 0.25
137 0.28
138 0.29
139 0.29
140 0.28
141 0.27
142 0.22
143 0.18
144 0.15
145 0.11
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.12
171 0.2
172 0.24
173 0.29
174 0.33
175 0.36
176 0.42
177 0.48
178 0.53
179 0.54
180 0.57
181 0.56
182 0.52
183 0.48
184 0.42
185 0.33
186 0.27
187 0.2
188 0.13
189 0.1
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.14
194 0.18
195 0.21
196 0.22
197 0.26
198 0.27
199 0.25
200 0.23
201 0.21
202 0.16
203 0.13
204 0.1
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.09
239 0.11
240 0.11
241 0.14
242 0.15
243 0.16
244 0.19
245 0.18
246 0.19
247 0.22
248 0.23
249 0.2
250 0.19
251 0.18
252 0.15
253 0.15
254 0.12
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.14
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.14
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.1
277 0.12
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.22
284 0.27
285 0.32
286 0.37
287 0.47
288 0.52
289 0.52
290 0.53
291 0.48
292 0.47
293 0.44
294 0.41
295 0.37
296 0.33
297 0.37
298 0.37
299 0.37
300 0.33
301 0.29
302 0.25
303 0.19
304 0.18
305 0.15
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.15
318 0.13
319 0.15
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.16
335 0.17
336 0.23
337 0.28
338 0.38
339 0.44
340 0.49
341 0.52
342 0.5
343 0.48
344 0.45
345 0.42
346 0.35
347 0.34
348 0.29
349 0.26
350 0.25
351 0.25
352 0.23
353 0.21
354 0.2
355 0.13
356 0.12
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.08
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.12
368 0.13
369 0.18
370 0.18
371 0.2
372 0.19
373 0.2
374 0.24
375 0.23
376 0.29
377 0.29
378 0.36
379 0.45
380 0.45
381 0.49
382 0.52
383 0.56
384 0.58
385 0.62
386 0.62
387 0.59
388 0.68
389 0.7
390 0.69
391 0.69
392 0.61
393 0.54
394 0.5
395 0.48
396 0.45
397 0.47
398 0.5
399 0.46
400 0.48
401 0.46
402 0.49
403 0.48
404 0.43
405 0.38
406 0.37
407 0.41
408 0.44
409 0.49
410 0.52
411 0.59
412 0.64
413 0.71
414 0.67
415 0.71
416 0.72
417 0.76
418 0.73
419 0.72
420 0.74
421 0.71
422 0.77