Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M8C0

Protein Details
Accession C5M8C0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-60LKIAKFPKARRTRILEKDVQHydrophilic
154-178STATSTVPKKRGRPKRPTLSATPSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-169KKRGRPKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002110  Ankyrin_rpt  
IPR036770  Ankyrin_rpt-contain_sf  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR018004  KilA/APSES_HTH  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:0090575  C:RNA polymerase II transcription regulator complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000083  P:regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle  
KEGG ctp:CTRG_02642  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13606  Ank_3  
PF13637  Ank_4  
PF04383  KilA-N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MSNTQIYSATYSNVPVFEFVTSEGPIMRRKSDSWINATHILKIAKFPKARRTRILEKDVQTGVHEKVQGGYGKYQGTYVPLELGATIAKNFGVYDVLRPIFEFKYIEGETEVPPPAPKHNHASALNIAKRQASLLKKQKDKQVSVSASSDDSTSTATSTVPKKRGRPKRPTLSATPSLLKSDTTPIEQSFNSASARPSYAGHLPSTLSRQDTEQDALQIMTNNMNLRQEDLASVGTDDEEDDKGVLGNANGNGGALSNKRRKYPLSMTNGNGLESQAELLTSKELFGVSRTSFEKRSNQQHNIYSPLQPYHQPSITLSQENQIYSEYFQGLLNYFLDDNNRVRSQLPERLISPPLPLSKIHINQAIDTEGNTIFHWACSMGNLSIIEFLMRTFTHEINPDVRNNCGETPLMFMVKFNNSFQLRNFPQILEVLGDSMLLVDSNGKTVLHHIVDADNKHKREKFARYYMECLFKKLVDGVKPEPSNDNKKANRGNIGDNDEGRLGVGMKDGGGEDNALEEEDDEDLPSTQVDEEAKNELVSKFINHQDSNGNTAFHIAAYNLNKKCIKVFILYHRFINFGLRNLVSCTVEDYLASHNYVLRLDPTENDDQHNGNDDEDTIEDTTNENQSFETQLHNSKTAINLQNSTANQLTEKMTQLAYAIDSELSEKDEIILSYFKILNEINETKLASQRNILSFFKLDHLIDELEQNRESSQDPNDDANNNNLYLDFKRDHILQEEIYRLMNDLTYQALHEKDELDTLAKRYKNTREILQSKILKSLEINGNSEASVDKREEFELARELQAEIIKRKQLMEKILAKTKDVPVEQRESPKSIINRYSMDDKLYKYCKLISLSCGMQIEEIEGSIDAIEESLVKNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.16
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.16
11 0.17
12 0.23
13 0.26
14 0.28
15 0.28
16 0.29
17 0.37
18 0.44
19 0.48
20 0.48
21 0.5
22 0.51
23 0.56
24 0.55
25 0.49
26 0.45
27 0.41
28 0.35
29 0.37
30 0.38
31 0.38
32 0.44
33 0.47
34 0.53
35 0.61
36 0.68
37 0.69
38 0.73
39 0.75
40 0.78
41 0.82
42 0.8
43 0.73
44 0.73
45 0.65
46 0.57
47 0.49
48 0.43
49 0.36
50 0.32
51 0.29
52 0.23
53 0.22
54 0.26
55 0.28
56 0.27
57 0.27
58 0.27
59 0.27
60 0.27
61 0.26
62 0.22
63 0.22
64 0.21
65 0.19
66 0.16
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.11
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.1
80 0.09
81 0.13
82 0.19
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.23
87 0.21
88 0.23
89 0.21
90 0.15
91 0.22
92 0.22
93 0.22
94 0.2
95 0.22
96 0.21
97 0.24
98 0.24
99 0.17
100 0.19
101 0.19
102 0.25
103 0.29
104 0.32
105 0.35
106 0.4
107 0.47
108 0.46
109 0.49
110 0.48
111 0.52
112 0.52
113 0.46
114 0.42
115 0.36
116 0.35
117 0.32
118 0.32
119 0.29
120 0.36
121 0.44
122 0.52
123 0.6
124 0.65
125 0.72
126 0.74
127 0.73
128 0.7
129 0.7
130 0.65
131 0.6
132 0.56
133 0.48
134 0.4
135 0.36
136 0.28
137 0.18
138 0.14
139 0.12
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.09
144 0.14
145 0.21
146 0.28
147 0.35
148 0.41
149 0.5
150 0.6
151 0.71
152 0.76
153 0.79
154 0.82
155 0.86
156 0.89
157 0.86
158 0.84
159 0.81
160 0.77
161 0.7
162 0.63
163 0.53
164 0.46
165 0.4
166 0.32
167 0.25
168 0.25
169 0.23
170 0.22
171 0.23
172 0.22
173 0.25
174 0.24
175 0.25
176 0.2
177 0.2
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.16
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.18
186 0.21
187 0.22
188 0.21
189 0.2
190 0.19
191 0.2
192 0.23
193 0.22
194 0.19
195 0.17
196 0.18
197 0.19
198 0.21
199 0.22
200 0.19
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.16
244 0.23
245 0.26
246 0.29
247 0.33
248 0.35
249 0.42
250 0.48
251 0.5
252 0.51
253 0.55
254 0.54
255 0.57
256 0.55
257 0.47
258 0.38
259 0.29
260 0.2
261 0.15
262 0.13
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.11
275 0.1
276 0.14
277 0.16
278 0.18
279 0.21
280 0.25
281 0.32
282 0.36
283 0.45
284 0.51
285 0.55
286 0.58
287 0.61
288 0.59
289 0.57
290 0.52
291 0.45
292 0.38
293 0.33
294 0.28
295 0.26
296 0.28
297 0.27
298 0.27
299 0.24
300 0.23
301 0.28
302 0.29
303 0.28
304 0.24
305 0.22
306 0.22
307 0.22
308 0.21
309 0.16
310 0.14
311 0.12
312 0.14
313 0.11
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.11
325 0.12
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.21
331 0.25
332 0.29
333 0.3
334 0.28
335 0.29
336 0.31
337 0.32
338 0.28
339 0.24
340 0.2
341 0.19
342 0.19
343 0.17
344 0.18
345 0.23
346 0.25
347 0.26
348 0.27
349 0.26
350 0.25
351 0.26
352 0.23
353 0.16
354 0.14
355 0.13
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.08
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.14
383 0.16
384 0.19
385 0.21
386 0.22
387 0.2
388 0.21
389 0.2
390 0.2
391 0.18
392 0.15
393 0.13
394 0.1
395 0.13
396 0.13
397 0.12
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.14
402 0.15
403 0.12
404 0.17
405 0.18
406 0.19
407 0.19
408 0.26
409 0.24
410 0.27
411 0.27
412 0.21
413 0.2
414 0.2
415 0.19
416 0.11
417 0.1
418 0.07
419 0.06
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.02
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.07
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.11
438 0.13
439 0.15
440 0.19
441 0.21
442 0.22
443 0.27
444 0.28
445 0.3
446 0.35
447 0.42
448 0.45
449 0.48
450 0.55
451 0.53
452 0.55
453 0.55
454 0.57
455 0.48
456 0.43
457 0.35
458 0.27
459 0.25
460 0.24
461 0.24
462 0.17
463 0.21
464 0.22
465 0.27
466 0.28
467 0.28
468 0.29
469 0.31
470 0.36
471 0.37
472 0.43
473 0.39
474 0.45
475 0.5
476 0.48
477 0.5
478 0.44
479 0.44
480 0.39
481 0.43
482 0.38
483 0.32
484 0.31
485 0.24
486 0.21
487 0.16
488 0.12
489 0.07
490 0.05
491 0.06
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.04
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.11
520 0.11
521 0.11
522 0.13
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.13
528 0.17
529 0.21
530 0.2
531 0.21
532 0.25
533 0.26
534 0.3
535 0.26
536 0.22
537 0.17
538 0.19
539 0.17
540 0.12
541 0.11
542 0.07
543 0.11
544 0.14
545 0.22
546 0.22
547 0.27
548 0.28
549 0.28
550 0.29
551 0.27
552 0.26
553 0.22
554 0.27
555 0.33
556 0.41
557 0.42
558 0.42
559 0.4
560 0.38
561 0.34
562 0.36
563 0.27
564 0.2
565 0.22
566 0.2
567 0.2
568 0.21
569 0.23
570 0.16
571 0.15
572 0.15
573 0.12
574 0.12
575 0.11
576 0.11
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.12
584 0.11
585 0.1
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.16
590 0.21
591 0.22
592 0.24
593 0.24
594 0.22
595 0.22
596 0.27
597 0.22
598 0.17
599 0.16
600 0.14
601 0.13
602 0.12
603 0.14
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.09
608 0.11
609 0.14
610 0.14
611 0.12
612 0.12
613 0.13
614 0.14
615 0.14
616 0.15
617 0.14
618 0.19
619 0.22
620 0.23
621 0.23
622 0.22
623 0.24
624 0.29
625 0.32
626 0.29
627 0.28
628 0.28
629 0.33
630 0.32
631 0.34
632 0.26
633 0.21
634 0.19
635 0.19
636 0.21
637 0.17
638 0.18
639 0.16
640 0.15
641 0.15
642 0.15
643 0.13
644 0.11
645 0.09
646 0.08
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.09
652 0.09
653 0.08
654 0.08
655 0.1
656 0.1
657 0.1
658 0.11
659 0.09
660 0.12
661 0.14
662 0.13
663 0.15
664 0.15
665 0.14
666 0.21
667 0.22
668 0.21
669 0.21
670 0.22
671 0.21
672 0.25
673 0.26
674 0.2
675 0.22
676 0.25
677 0.27
678 0.32
679 0.31
680 0.29
681 0.28
682 0.28
683 0.27
684 0.25
685 0.21
686 0.17
687 0.19
688 0.17
689 0.16
690 0.2
691 0.19
692 0.19
693 0.19
694 0.19
695 0.16
696 0.17
697 0.18
698 0.16
699 0.18
700 0.2
701 0.22
702 0.25
703 0.28
704 0.29
705 0.29
706 0.31
707 0.29
708 0.24
709 0.22
710 0.19
711 0.19
712 0.18
713 0.22
714 0.18
715 0.17
716 0.2
717 0.22
718 0.24
719 0.25
720 0.27
721 0.23
722 0.26
723 0.27
724 0.25
725 0.24
726 0.22
727 0.18
728 0.16
729 0.14
730 0.1
731 0.09
732 0.09
733 0.09
734 0.1
735 0.12
736 0.12
737 0.13
738 0.14
739 0.14
740 0.13
741 0.14
742 0.14
743 0.14
744 0.16
745 0.19
746 0.25
747 0.26
748 0.28
749 0.34
750 0.42
751 0.47
752 0.49
753 0.54
754 0.57
755 0.59
756 0.62
757 0.65
758 0.62
759 0.55
760 0.58
761 0.5
762 0.4
763 0.37
764 0.4
765 0.38
766 0.35
767 0.36
768 0.3
769 0.31
770 0.3
771 0.29
772 0.22
773 0.15
774 0.15
775 0.14
776 0.14
777 0.16
778 0.17
779 0.19
780 0.19
781 0.21
782 0.23
783 0.23
784 0.23
785 0.22
786 0.22
787 0.22
788 0.23
789 0.25
790 0.24
791 0.28
792 0.31
793 0.32
794 0.35
795 0.39
796 0.42
797 0.44
798 0.48
799 0.51
800 0.55
801 0.62
802 0.6
803 0.55
804 0.55
805 0.54
806 0.52
807 0.47
808 0.47
809 0.44
810 0.49
811 0.52
812 0.55
813 0.54
814 0.5
815 0.49
816 0.5
817 0.49
818 0.51
819 0.51
820 0.47
821 0.46
822 0.46
823 0.5
824 0.45
825 0.44
826 0.41
827 0.38
828 0.42
829 0.44
830 0.42
831 0.38
832 0.4
833 0.41
834 0.42
835 0.42
836 0.37
837 0.39
838 0.38
839 0.4
840 0.37
841 0.32
842 0.27
843 0.23
844 0.21
845 0.15
846 0.14
847 0.1
848 0.09
849 0.09
850 0.08
851 0.08
852 0.05
853 0.05
854 0.05
855 0.05