Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M2P9

Protein Details
Accession C5M2P9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-378QEAEKKGYPVEKPKEKKKKVKKIGTRYPGAVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-373PVEKPKEKKKKVKKIGTRY
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 12.5, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR023617  Tyr-tRNA-ligase_arc/euk-type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
KEGG ctp:CTRG_00338  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MTVIKDPVEQYNLITKGLQETLNGQIIKDVLEKENRPVKIYWGTAPTGKPHCGYFVPMIKLAHFLKAGCEVTVLLADLHAFLDNMKAPLEVVNYRAKYYEFVVKAILRSINVPIERLKFVVGSSYQQGGDYIMDLFKLSNIVSQNDAKRAGADVVKQVANPLLSGLIYPLMQAIDEEHLGVDAQFGGVDQRKIFVLAEENLPSIGYKKRAHLMNPMVPGLGQGGKMSASDPNSKIDIVEEPKVVKKKVNSAYCAPGEIQDNGLIAFIEYVIQPINELKTGVEGSFNLYIDRPEKFGGPIQYDSVETLKNDFVEGKLAPPDLKSGVADKINELLAPIRAEFETNEEFQEAEKKGYPVEKPKEKKKKVKKIGTRYPGAVAKEETKEEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.23
3 0.24
4 0.26
5 0.25
6 0.17
7 0.19
8 0.23
9 0.29
10 0.28
11 0.24
12 0.22
13 0.22
14 0.23
15 0.23
16 0.21
17 0.19
18 0.27
19 0.29
20 0.35
21 0.43
22 0.42
23 0.42
24 0.4
25 0.42
26 0.41
27 0.43
28 0.39
29 0.36
30 0.37
31 0.38
32 0.39
33 0.4
34 0.38
35 0.38
36 0.34
37 0.31
38 0.32
39 0.29
40 0.32
41 0.31
42 0.33
43 0.34
44 0.36
45 0.36
46 0.32
47 0.37
48 0.33
49 0.3
50 0.24
51 0.21
52 0.19
53 0.25
54 0.25
55 0.19
56 0.19
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.13
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.07
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.11
76 0.14
77 0.13
78 0.14
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.23
83 0.22
84 0.21
85 0.23
86 0.28
87 0.21
88 0.21
89 0.24
90 0.24
91 0.24
92 0.25
93 0.24
94 0.16
95 0.16
96 0.18
97 0.2
98 0.19
99 0.19
100 0.2
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.2
105 0.15
106 0.14
107 0.17
108 0.14
109 0.13
110 0.15
111 0.16
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.08
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.06
125 0.05
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.13
130 0.18
131 0.19
132 0.21
133 0.22
134 0.19
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.11
148 0.09
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.03
170 0.03
171 0.02
172 0.03
173 0.04
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.14
193 0.15
194 0.17
195 0.23
196 0.25
197 0.27
198 0.33
199 0.38
200 0.37
201 0.37
202 0.36
203 0.3
204 0.27
205 0.26
206 0.19
207 0.13
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.1
216 0.14
217 0.16
218 0.17
219 0.18
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.18
224 0.16
225 0.18
226 0.17
227 0.17
228 0.22
229 0.26
230 0.26
231 0.25
232 0.24
233 0.32
234 0.39
235 0.44
236 0.44
237 0.44
238 0.49
239 0.46
240 0.45
241 0.35
242 0.29
243 0.25
244 0.21
245 0.18
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.08
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.12
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.14
276 0.15
277 0.16
278 0.15
279 0.13
280 0.14
281 0.15
282 0.2
283 0.23
284 0.25
285 0.25
286 0.25
287 0.25
288 0.24
289 0.24
290 0.21
291 0.18
292 0.14
293 0.15
294 0.15
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.12
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.15
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.18
307 0.16
308 0.17
309 0.16
310 0.16
311 0.19
312 0.22
313 0.22
314 0.2
315 0.21
316 0.2
317 0.19
318 0.17
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.18
328 0.19
329 0.19
330 0.2
331 0.18
332 0.18
333 0.18
334 0.25
335 0.2
336 0.2
337 0.23
338 0.22
339 0.25
340 0.3
341 0.36
342 0.39
343 0.48
344 0.56
345 0.61
346 0.72
347 0.81
348 0.86
349 0.9
350 0.91
351 0.92
352 0.93
353 0.95
354 0.94
355 0.94
356 0.95
357 0.93
358 0.89
359 0.8
360 0.76
361 0.71
362 0.62
363 0.55
364 0.48
365 0.44
366 0.42