Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6W5

Protein Details
Accession C5M6W5    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MNDRPTPNKKKKKSEKKNSATLAYTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-17NKKKKKSEKK
52-67KKAAGNARKAEQAAKK
87-111SKKGNKKKEEEQFKKEEAARKKAER
124-140SKPVKAKNRGAEKVAQR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010422  Ccdc124/Oxs1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0034599  P:cellular response to oxidative stress  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_01596  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06244  Ccdc124  
Amino Acid Sequences MNDRPTPNKKKKKSEKKNSATLAYTTFSSSTHHVTSNYITTMAKKNSGENSKKAAGNARKAEQAAKKKQEALDQLENEEASKWEQGSKKGNKKKEEEQFKKEEAARKKAERDALLAAEEASMPSKPVKAKNRGAEKVAQRRAGKIDDFLDFNKDIPELSASGLDSALEALALTSTGGGVSNKDIDRHPERRVKAAYNAYEEKRLPEMRKENPGLRLNQIKNLLFKEFQKSPENPMNQDTNIHYNATRDDVESKKQEARASREKKFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.95
2 0.95
3 0.94
4 0.94
5 0.89
6 0.83
7 0.75
8 0.65
9 0.57
10 0.47
11 0.39
12 0.3
13 0.24
14 0.18
15 0.18
16 0.18
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.2
21 0.23
22 0.25
23 0.26
24 0.24
25 0.21
26 0.19
27 0.21
28 0.28
29 0.28
30 0.3
31 0.28
32 0.32
33 0.39
34 0.49
35 0.5
36 0.47
37 0.51
38 0.51
39 0.52
40 0.49
41 0.5
42 0.47
43 0.51
44 0.52
45 0.48
46 0.46
47 0.45
48 0.51
49 0.49
50 0.52
51 0.53
52 0.54
53 0.55
54 0.56
55 0.58
56 0.57
57 0.55
58 0.52
59 0.51
60 0.44
61 0.42
62 0.39
63 0.36
64 0.29
65 0.24
66 0.17
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.14
71 0.16
72 0.21
73 0.31
74 0.4
75 0.49
76 0.56
77 0.63
78 0.65
79 0.69
80 0.73
81 0.73
82 0.75
83 0.72
84 0.71
85 0.7
86 0.64
87 0.63
88 0.57
89 0.55
90 0.51
91 0.51
92 0.5
93 0.48
94 0.5
95 0.49
96 0.5
97 0.43
98 0.39
99 0.33
100 0.27
101 0.24
102 0.19
103 0.15
104 0.11
105 0.1
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.08
112 0.1
113 0.18
114 0.26
115 0.34
116 0.41
117 0.48
118 0.56
119 0.56
120 0.55
121 0.54
122 0.54
123 0.56
124 0.54
125 0.52
126 0.44
127 0.44
128 0.44
129 0.4
130 0.33
131 0.25
132 0.22
133 0.17
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.15
138 0.14
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.06
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.19
172 0.27
173 0.31
174 0.37
175 0.41
176 0.42
177 0.48
178 0.52
179 0.48
180 0.48
181 0.52
182 0.48
183 0.47
184 0.51
185 0.46
186 0.47
187 0.44
188 0.38
189 0.36
190 0.38
191 0.34
192 0.38
193 0.44
194 0.45
195 0.53
196 0.56
197 0.55
198 0.58
199 0.61
200 0.55
201 0.53
202 0.57
203 0.49
204 0.51
205 0.52
206 0.46
207 0.45
208 0.44
209 0.42
210 0.35
211 0.36
212 0.37
213 0.35
214 0.38
215 0.41
216 0.4
217 0.44
218 0.5
219 0.52
220 0.47
221 0.47
222 0.47
223 0.41
224 0.42
225 0.39
226 0.36
227 0.33
228 0.32
229 0.28
230 0.25
231 0.26
232 0.27
233 0.24
234 0.2
235 0.25
236 0.27
237 0.34
238 0.36
239 0.39
240 0.41
241 0.44
242 0.47
243 0.49
244 0.54
245 0.57
246 0.61