Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MI26

Protein Details
Accession C5MI26    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-203DDEENRRKSAKRRKKDEKHTTLVSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-195RRKSAKRRKKD
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR037850  RBBP5/Swd1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
KEGG ctp:CTRG_05719  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MNLSLQDPFSVAKEFPETLNNTLNYGHSVCIQFNHKGDYLASGLSDGSIAIYDMVSSGVIAHLKENSHIRPITSISWSKCGRYLLTSSQDWWVKLWDLQYVNNNNDESGDIQSPVIRQIKFDGPIWSASMHPENHFIFTASLFEDSPVYVDLNQKGNSPKVITLETIPLEENNQEVVDDDDEENRRKSAKRRKKDEKHTTLVSIFTHEGNYIFSGTSKGWLNIFDVNDNCKQVQSIKLSNSNIKNLMISSNGRKLAINSSDRVIRQINLPPDLINIDDISELEFEIEHKYQDVVNRLQWNSVTFNHNGDFLVASTHGQSSHDLYIWETSMGSLVKILEGSNEELIDVKWDYSRCTIGSIGLDSGEVYLWSVSFPQKWSALAPDFVEIEENIEYVEKEDEFDIIDEDELHKKRLEEEDFLVDVISKEVTDARGFDITQESFLIPINYEKNLYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.27
4 0.28
5 0.29
6 0.36
7 0.34
8 0.31
9 0.31
10 0.3
11 0.27
12 0.25
13 0.22
14 0.19
15 0.2
16 0.2
17 0.23
18 0.27
19 0.28
20 0.29
21 0.34
22 0.3
23 0.3
24 0.29
25 0.28
26 0.25
27 0.2
28 0.18
29 0.13
30 0.12
31 0.1
32 0.1
33 0.06
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.04
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.04
44 0.04
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.11
50 0.12
51 0.16
52 0.21
53 0.22
54 0.28
55 0.28
56 0.28
57 0.28
58 0.31
59 0.3
60 0.31
61 0.35
62 0.31
63 0.38
64 0.39
65 0.38
66 0.39
67 0.38
68 0.33
69 0.31
70 0.33
71 0.32
72 0.36
73 0.36
74 0.33
75 0.38
76 0.39
77 0.35
78 0.31
79 0.27
80 0.22
81 0.23
82 0.23
83 0.22
84 0.21
85 0.23
86 0.31
87 0.34
88 0.34
89 0.35
90 0.34
91 0.28
92 0.27
93 0.25
94 0.18
95 0.16
96 0.15
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.18
102 0.22
103 0.19
104 0.19
105 0.23
106 0.28
107 0.29
108 0.3
109 0.28
110 0.24
111 0.25
112 0.25
113 0.22
114 0.17
115 0.18
116 0.2
117 0.18
118 0.18
119 0.22
120 0.21
121 0.22
122 0.22
123 0.2
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.1
128 0.11
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.11
138 0.14
139 0.18
140 0.19
141 0.21
142 0.23
143 0.24
144 0.25
145 0.23
146 0.21
147 0.19
148 0.2
149 0.18
150 0.17
151 0.18
152 0.17
153 0.16
154 0.14
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.11
168 0.13
169 0.16
170 0.16
171 0.15
172 0.18
173 0.2
174 0.29
175 0.37
176 0.46
177 0.54
178 0.65
179 0.75
180 0.83
181 0.91
182 0.93
183 0.9
184 0.86
185 0.77
186 0.69
187 0.59
188 0.5
189 0.39
190 0.3
191 0.22
192 0.16
193 0.14
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.17
221 0.18
222 0.21
223 0.23
224 0.28
225 0.3
226 0.36
227 0.36
228 0.33
229 0.3
230 0.26
231 0.24
232 0.18
233 0.18
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.19
238 0.19
239 0.19
240 0.19
241 0.19
242 0.23
243 0.26
244 0.25
245 0.21
246 0.22
247 0.25
248 0.25
249 0.26
250 0.22
251 0.16
252 0.18
253 0.22
254 0.23
255 0.22
256 0.22
257 0.2
258 0.19
259 0.19
260 0.16
261 0.11
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.11
278 0.14
279 0.19
280 0.18
281 0.22
282 0.28
283 0.28
284 0.28
285 0.28
286 0.27
287 0.25
288 0.26
289 0.25
290 0.2
291 0.22
292 0.21
293 0.21
294 0.19
295 0.16
296 0.13
297 0.09
298 0.1
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.14
313 0.13
314 0.09
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.09
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.12
333 0.1
334 0.09
335 0.11
336 0.12
337 0.15
338 0.16
339 0.19
340 0.16
341 0.18
342 0.18
343 0.17
344 0.18
345 0.17
346 0.15
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.1
351 0.08
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.07
358 0.09
359 0.12
360 0.14
361 0.17
362 0.18
363 0.19
364 0.2
365 0.25
366 0.25
367 0.25
368 0.24
369 0.23
370 0.22
371 0.21
372 0.21
373 0.14
374 0.14
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.11
382 0.08
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.11
393 0.19
394 0.2
395 0.21
396 0.22
397 0.22
398 0.27
399 0.35
400 0.37
401 0.34
402 0.36
403 0.4
404 0.39
405 0.38
406 0.33
407 0.25
408 0.21
409 0.17
410 0.13
411 0.07
412 0.07
413 0.09
414 0.12
415 0.12
416 0.13
417 0.16
418 0.18
419 0.18
420 0.19
421 0.23
422 0.21
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.16
427 0.18
428 0.17
429 0.12
430 0.17
431 0.19
432 0.19