FuNGI

C5MGL1

Protein Details

Accession

C5MGL1

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
167-194	GNSSNSKSNRNRKKSGHNQNKSSPKKRE	Hydrophilic
339-358	NNGNRPYRNGQYRNNRNNNN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
174-202	SNRNRKKSGHNQNKSSPKKREEKVEGKEA

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	ctp:CTRG_05204 -
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MTSPISYANVAANASSANTAPATAATATATATATTSSDSVKPKSEEQQPEQQTPTSSTTTESLGKESEDQSSKSTDSTATSTPASKTKKTLAPAPVPTKSAWGEVTSGVSQLSVDDKKWASPEKTPLLGEQPAVKPQQQKFMKPITNKWVPVQAKVILPSLRSSSNGNSSNSKSNRNRKKSGHNQNKSSPKKREEKVEGKEAKSAPAGEEVSSGEKTDAVEKKQTQPKETTEEQTSDVSSSSASTQQQEHQEQPSQQQPNQQQHQHQPRFNNGQQKKRFNNQHQQNGNVNGQYQKRYNNHNSNNANANPQQPMQPQPFTPQGYFNPQQQQQYPNTYQYNNGNRPYRNGQYRNNRNNNNQAYRNGGYRHNNNHHNNHAANGAGIIPGPIQFIPYPQQMPIPIPPPISPKQDPQEALIQQIDYYFSLENLIKDLYLRKNMDAEGWVDLKLIMDFKRVKIIVNGLINSLDEGVVGDDVILESIKSCKNLEISGEKLEDVKLRVKDNYQQWLLN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.09
4	0.09
5	0.09
6	0.09
7	0.09
8	0.09
9	0.1
10	0.1
11	0.1
12	0.09
13	0.09
14	0.09
15	0.1
16	0.1
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.08
21	0.09
22	0.1
23	0.11
24	0.16
25	0.21
26	0.23
27	0.29
28	0.32
29	0.36
30	0.43
31	0.51
32	0.54
33	0.56
34	0.63
35	0.63
36	0.65
37	0.62
38	0.57
39	0.49
40	0.44
41	0.42
42	0.34
43	0.29
44	0.26
45	0.25
46	0.26
47	0.29
48	0.25
49	0.23
50	0.21
51	0.22
52	0.23
53	0.23
54	0.27
55	0.25
56	0.25
57	0.25
58	0.28
59	0.27
60	0.24
61	0.24
62	0.18
63	0.18
64	0.2
65	0.2
66	0.19
67	0.2
68	0.22
69	0.23
70	0.3
71	0.32
72	0.31
73	0.34
74	0.39
75	0.43
76	0.45
77	0.51
78	0.51
79	0.54
80	0.6
81	0.62
82	0.57
83	0.54
84	0.5
85	0.46
86	0.39
87	0.34
88	0.26
89	0.2
90	0.19
91	0.18
92	0.2
93	0.16
94	0.15
95	0.13
96	0.11
97	0.1
98	0.09
99	0.13
100	0.12
101	0.12
102	0.16
103	0.17
104	0.19
105	0.23
106	0.29
107	0.27
108	0.31
109	0.38
110	0.39
111	0.42
112	0.41
113	0.39
114	0.37
115	0.35
116	0.31
117	0.29
118	0.25
119	0.26
120	0.28
121	0.3
122	0.33
123	0.34
124	0.43
125	0.41
126	0.43
127	0.45
128	0.52
129	0.55
130	0.51
131	0.56
132	0.55
133	0.57
134	0.55
135	0.51
136	0.51
137	0.46
138	0.44
139	0.41
140	0.35
141	0.3
142	0.3
143	0.32
144	0.24
145	0.23
146	0.22
147	0.21
148	0.19
149	0.18
150	0.19
151	0.18
152	0.25
153	0.28
154	0.29
155	0.3
156	0.32
157	0.4
158	0.41
159	0.47
160	0.49
161	0.55
162	0.64
163	0.68
164	0.73
165	0.71
166	0.79
167	0.8
168	0.83
169	0.84
170	0.82
171	0.8
172	0.8
173	0.85
174	0.83
175	0.81
176	0.78
177	0.75
178	0.75
179	0.72
180	0.73
181	0.72
182	0.72
183	0.68
184	0.7
185	0.68
186	0.6
187	0.62
188	0.52
189	0.44
190	0.36
191	0.31
192	0.21
193	0.19
194	0.19
195	0.13
196	0.13
197	0.12
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.15
205	0.17
206	0.17
207	0.22
208	0.24
209	0.33
210	0.38
211	0.4
212	0.37
213	0.38
214	0.4
215	0.41
216	0.42
217	0.37
218	0.33
219	0.32
220	0.31
221	0.27
222	0.24
223	0.18
224	0.15
225	0.11
226	0.08
227	0.07
228	0.07
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.11
233	0.15
234	0.21
235	0.22
236	0.24
237	0.23
238	0.26
239	0.26
240	0.27
241	0.31
242	0.28
243	0.28
244	0.32
245	0.36
246	0.41
247	0.46
248	0.47
249	0.45
250	0.51
251	0.61
252	0.6
253	0.57
254	0.52
255	0.53
256	0.57
257	0.56
258	0.57
259	0.52
260	0.55
261	0.6
262	0.66
263	0.64
264	0.65
265	0.71
266	0.69
267	0.74
268	0.73
269	0.75
270	0.69
271	0.69
272	0.64
273	0.58
274	0.51
275	0.41
276	0.33
277	0.28
278	0.27
279	0.26
280	0.24
281	0.27
282	0.29
283	0.37
284	0.45
285	0.51
286	0.54
287	0.61
288	0.6
289	0.57
290	0.59
291	0.51
292	0.46
293	0.37
294	0.34
295	0.26
296	0.25
297	0.25
298	0.21
299	0.26
300	0.26
301	0.26
302	0.24
303	0.27
304	0.32
305	0.31
306	0.3
307	0.28
308	0.26
309	0.33
310	0.34
311	0.35
312	0.36
313	0.37
314	0.4
315	0.39
316	0.42
317	0.38
318	0.43
319	0.41
320	0.39
321	0.39
322	0.36
323	0.37
324	0.4
325	0.46
326	0.44
327	0.48
328	0.48
329	0.46
330	0.51
331	0.53
332	0.52
333	0.52
334	0.53
335	0.56
336	0.61
337	0.72
338	0.77
339	0.8
340	0.79
341	0.76
342	0.8
343	0.79
344	0.75
345	0.68
346	0.59
347	0.56
348	0.51
349	0.49
350	0.42
351	0.4
352	0.4
353	0.43
354	0.51
355	0.52
356	0.6
357	0.63
358	0.67
359	0.64
360	0.63
361	0.56
362	0.48
363	0.41
364	0.31
365	0.24
366	0.18
367	0.13
368	0.08
369	0.07
370	0.06
371	0.05
372	0.05
373	0.07
374	0.06
375	0.08
376	0.08
377	0.1
378	0.14
379	0.17
380	0.18
381	0.18
382	0.2
383	0.2
384	0.23
385	0.25
386	0.24
387	0.23
388	0.24
389	0.25
390	0.3
391	0.34
392	0.38
393	0.37
394	0.41
395	0.44
396	0.48
397	0.48
398	0.44
399	0.48
400	0.4
401	0.41
402	0.35
403	0.29
404	0.22
405	0.22
406	0.2
407	0.12
408	0.13
409	0.1
410	0.09
411	0.12
412	0.13
413	0.13
414	0.13
415	0.13
416	0.11
417	0.13
418	0.19
419	0.21
420	0.28
421	0.3
422	0.29
423	0.32
424	0.33
425	0.34
426	0.29
427	0.25
428	0.21
429	0.2
430	0.19
431	0.16
432	0.15
433	0.14
434	0.13
435	0.15
436	0.11
437	0.17
438	0.2
439	0.21
440	0.3
441	0.3
442	0.3
443	0.31
444	0.36
445	0.35
446	0.38
447	0.38
448	0.3
449	0.3
450	0.29
451	0.25
452	0.2
453	0.13
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.04
465	0.05
466	0.1
467	0.12
468	0.14
469	0.15
470	0.18
471	0.21
472	0.23
473	0.29
474	0.3
475	0.31
476	0.35
477	0.35
478	0.32
479	0.3
480	0.31
481	0.29
482	0.26
483	0.3
484	0.29
485	0.32
486	0.36
487	0.4
488	0.46
489	0.5
490	0.57

C5MGL1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer