Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MF06

Protein Details
Accession C5MF06    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
527-556PVEKESKAAAKNRKKREAKKQQEKTASPSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
530-547KESKAAAKNRKKREAKKQ
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0022627  C:cytosolic small ribosomal subunit  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
KEGG ctp:CTRG_04649  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MPFSNDQQILTDSMSIGRLPKTVELIQDFNDITPEPKANGECRAALYSSNGQFFAFTQPNEVVILDTSAEAKLYHRIEIPEVFDIYFSPEGTFLCLWCKPVQINKENGTWNNNLKIFNVKTKTVIAEWSAKHQSGWRPQFTAQETVFARSINQKEIHFFEISSTSDAVINLSQPTFKYKIADPKATFQSFQVSPGKNTSVAVFIPEKGGKPANVSIYNFPNFSQPICSKNFFKAEKCQLKWNSLGTALLALASTDHDTTNKSYYGESNLYLMGIAGSYDSRIDLKREGPIHDITWSPTAREFAVSYGYMPSETTFFDARGNAIHSLPTAPRNTILYSPHAKFVLVAGFGNLQGTVDVYDRQNKFSRVVTFEASNTSVCEWSPCGRFILTATTSPRLRVDNGCKIWHASGKLVYLKEYPELYSIGWKPQALDQFPPIKALEPAPEAHTSAKEYLAKREASASAAAKKPTGAYRPPHARGSGASAPASSLYQKELQNNMRNNGTPPPPGLSRNGLNTPRVRTVVGAAPPVEKESKAAAKNRKKREAKKQQEKTASPSPASATSPAPAAATSGVIGGVASLEEKKIRSLLKKLRAIEQLKMKQAAGETLEDTQVVKISKEDEIRAELQTLGWNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.17
7 0.19
8 0.23
9 0.24
10 0.29
11 0.31
12 0.32
13 0.32
14 0.35
15 0.33
16 0.27
17 0.26
18 0.21
19 0.18
20 0.19
21 0.19
22 0.16
23 0.2
24 0.23
25 0.25
26 0.3
27 0.31
28 0.3
29 0.31
30 0.32
31 0.29
32 0.26
33 0.28
34 0.3
35 0.31
36 0.31
37 0.29
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.28
42 0.25
43 0.21
44 0.23
45 0.23
46 0.24
47 0.24
48 0.23
49 0.16
50 0.12
51 0.13
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.16
60 0.16
61 0.18
62 0.21
63 0.23
64 0.26
65 0.28
66 0.31
67 0.26
68 0.26
69 0.24
70 0.2
71 0.19
72 0.2
73 0.18
74 0.15
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.16
79 0.16
80 0.12
81 0.15
82 0.16
83 0.18
84 0.19
85 0.22
86 0.23
87 0.3
88 0.39
89 0.41
90 0.48
91 0.49
92 0.53
93 0.55
94 0.54
95 0.52
96 0.48
97 0.46
98 0.45
99 0.44
100 0.39
101 0.35
102 0.4
103 0.38
104 0.41
105 0.41
106 0.35
107 0.35
108 0.36
109 0.37
110 0.3
111 0.3
112 0.24
113 0.27
114 0.27
115 0.32
116 0.33
117 0.31
118 0.31
119 0.34
120 0.38
121 0.42
122 0.49
123 0.45
124 0.45
125 0.47
126 0.53
127 0.51
128 0.5
129 0.4
130 0.38
131 0.35
132 0.35
133 0.34
134 0.26
135 0.25
136 0.25
137 0.27
138 0.26
139 0.29
140 0.26
141 0.29
142 0.33
143 0.34
144 0.27
145 0.25
146 0.21
147 0.21
148 0.21
149 0.19
150 0.16
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.15
162 0.16
163 0.17
164 0.19
165 0.22
166 0.32
167 0.38
168 0.46
169 0.43
170 0.47
171 0.54
172 0.52
173 0.48
174 0.38
175 0.39
176 0.3
177 0.33
178 0.34
179 0.28
180 0.28
181 0.3
182 0.31
183 0.25
184 0.26
185 0.21
186 0.16
187 0.14
188 0.16
189 0.14
190 0.12
191 0.15
192 0.16
193 0.16
194 0.16
195 0.18
196 0.16
197 0.18
198 0.21
199 0.22
200 0.25
201 0.26
202 0.27
203 0.3
204 0.31
205 0.28
206 0.26
207 0.24
208 0.21
209 0.2
210 0.22
211 0.18
212 0.21
213 0.25
214 0.28
215 0.27
216 0.31
217 0.38
218 0.35
219 0.37
220 0.42
221 0.48
222 0.54
223 0.54
224 0.58
225 0.53
226 0.54
227 0.53
228 0.46
229 0.37
230 0.28
231 0.27
232 0.18
233 0.15
234 0.11
235 0.09
236 0.06
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.1
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.18
252 0.17
253 0.16
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.1
259 0.06
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.08
270 0.1
271 0.11
272 0.16
273 0.18
274 0.2
275 0.21
276 0.22
277 0.21
278 0.21
279 0.2
280 0.16
281 0.19
282 0.17
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.08
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.12
318 0.14
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.18
323 0.22
324 0.22
325 0.23
326 0.22
327 0.21
328 0.18
329 0.18
330 0.15
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.15
346 0.16
347 0.19
348 0.23
349 0.23
350 0.25
351 0.28
352 0.3
353 0.27
354 0.28
355 0.26
356 0.24
357 0.23
358 0.23
359 0.2
360 0.16
361 0.13
362 0.12
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.12
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.14
372 0.15
373 0.15
374 0.18
375 0.16
376 0.18
377 0.19
378 0.23
379 0.23
380 0.24
381 0.25
382 0.21
383 0.22
384 0.25
385 0.3
386 0.35
387 0.38
388 0.39
389 0.37
390 0.37
391 0.36
392 0.33
393 0.27
394 0.2
395 0.19
396 0.21
397 0.24
398 0.23
399 0.23
400 0.21
401 0.2
402 0.2
403 0.19
404 0.16
405 0.14
406 0.14
407 0.13
408 0.18
409 0.18
410 0.19
411 0.2
412 0.19
413 0.19
414 0.22
415 0.27
416 0.23
417 0.24
418 0.26
419 0.3
420 0.3
421 0.31
422 0.28
423 0.23
424 0.23
425 0.22
426 0.2
427 0.16
428 0.17
429 0.18
430 0.18
431 0.18
432 0.18
433 0.18
434 0.17
435 0.17
436 0.19
437 0.21
438 0.22
439 0.26
440 0.3
441 0.3
442 0.28
443 0.3
444 0.27
445 0.23
446 0.26
447 0.22
448 0.23
449 0.26
450 0.26
451 0.23
452 0.23
453 0.24
454 0.25
455 0.28
456 0.29
457 0.3
458 0.39
459 0.48
460 0.52
461 0.53
462 0.49
463 0.44
464 0.39
465 0.42
466 0.37
467 0.3
468 0.26
469 0.23
470 0.22
471 0.22
472 0.21
473 0.14
474 0.1
475 0.11
476 0.16
477 0.19
478 0.24
479 0.31
480 0.38
481 0.46
482 0.5
483 0.5
484 0.49
485 0.47
486 0.45
487 0.43
488 0.39
489 0.33
490 0.3
491 0.31
492 0.3
493 0.31
494 0.32
495 0.31
496 0.3
497 0.34
498 0.4
499 0.39
500 0.42
501 0.44
502 0.45
503 0.45
504 0.43
505 0.38
506 0.31
507 0.31
508 0.32
509 0.3
510 0.27
511 0.24
512 0.24
513 0.24
514 0.26
515 0.24
516 0.18
517 0.17
518 0.2
519 0.26
520 0.31
521 0.39
522 0.47
523 0.56
524 0.65
525 0.74
526 0.79
527 0.82
528 0.86
529 0.89
530 0.9
531 0.91
532 0.93
533 0.93
534 0.92
535 0.92
536 0.85
537 0.81
538 0.79
539 0.73
540 0.62
541 0.54
542 0.46
543 0.39
544 0.38
545 0.33
546 0.25
547 0.21
548 0.21
549 0.2
550 0.17
551 0.13
552 0.12
553 0.1
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.05
564 0.05
565 0.07
566 0.09
567 0.1
568 0.12
569 0.17
570 0.23
571 0.29
572 0.39
573 0.47
574 0.55
575 0.62
576 0.63
577 0.67
578 0.71
579 0.68
580 0.65
581 0.66
582 0.63
583 0.62
584 0.62
585 0.54
586 0.46
587 0.44
588 0.4
589 0.32
590 0.27
591 0.22
592 0.21
593 0.22
594 0.19
595 0.19
596 0.15
597 0.16
598 0.15
599 0.14
600 0.14
601 0.16
602 0.21
603 0.25
604 0.27
605 0.26
606 0.31
607 0.33
608 0.33
609 0.32
610 0.26
611 0.23