Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6K4

Protein Details
Accession C5M6K4    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-58IMIRTVKPKNARSKRALVKKEAKLVEHydrophilic
83-104MAFKKPFIKKFSKKNEIRPFENHydrophilic
277-297EKEANKKPKQLEPKVKKNVSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-51PKNARSKRALVK
282-285KKPK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 9.5, cyto 5, E.R. 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG ctp:CTRG_01485  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MENQYNLCPLFSFFLYSPYHHLFILLYYCFIVIMIRTVKPKNARSKRALVKKEAKLVENTKTALFVPGSTGNKFLHDAMCDLMAFKKPFIKKFSKKNEIRPFENYEELEFFSEKNDCSLMVFSSSNKKRPNNLTFIRFFNYKVYDMIEFSIQKNHKLLQDFKKLTFTIGLKPMFSFNGPLFDSHPVYQHVKSLFLDFFRGEETDLQDVAGLQYVISLSTGEIEDLNDDKILPNVYFRVYKLKSYKSGQKLPRIELDEIGPRLDFKIGRRISPSPEIEKEANKKPKQLEPKVKKNVSTDFMGDKVAQIHVGKQDLSKLQTRKMKGLKEKYDQISEDEDEDEEGSDVYVSDEEYGSAADEEEDDEEQQPPSKKQRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.25
4 0.31
5 0.31
6 0.32
7 0.28
8 0.28
9 0.22
10 0.22
11 0.25
12 0.19
13 0.15
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.13
18 0.11
19 0.06
20 0.11
21 0.14
22 0.17
23 0.22
24 0.24
25 0.31
26 0.39
27 0.48
28 0.54
29 0.61
30 0.67
31 0.7
32 0.78
33 0.81
34 0.83
35 0.82
36 0.81
37 0.81
38 0.78
39 0.8
40 0.74
41 0.66
42 0.64
43 0.61
44 0.57
45 0.51
46 0.46
47 0.37
48 0.34
49 0.32
50 0.27
51 0.22
52 0.16
53 0.16
54 0.21
55 0.24
56 0.23
57 0.26
58 0.23
59 0.24
60 0.26
61 0.23
62 0.19
63 0.17
64 0.17
65 0.15
66 0.16
67 0.14
68 0.13
69 0.13
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.23
74 0.27
75 0.33
76 0.4
77 0.48
78 0.51
79 0.61
80 0.71
81 0.74
82 0.77
83 0.82
84 0.85
85 0.82
86 0.78
87 0.73
88 0.7
89 0.62
90 0.6
91 0.49
92 0.41
93 0.35
94 0.31
95 0.27
96 0.2
97 0.16
98 0.13
99 0.14
100 0.12
101 0.12
102 0.11
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.22
111 0.26
112 0.32
113 0.38
114 0.41
115 0.46
116 0.55
117 0.6
118 0.59
119 0.61
120 0.61
121 0.57
122 0.56
123 0.52
124 0.43
125 0.38
126 0.33
127 0.3
128 0.24
129 0.21
130 0.2
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.14
136 0.13
137 0.2
138 0.19
139 0.2
140 0.21
141 0.22
142 0.23
143 0.26
144 0.33
145 0.34
146 0.44
147 0.45
148 0.44
149 0.46
150 0.43
151 0.39
152 0.35
153 0.28
154 0.22
155 0.26
156 0.26
157 0.21
158 0.22
159 0.22
160 0.18
161 0.17
162 0.15
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.15
169 0.16
170 0.15
171 0.16
172 0.15
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.17
177 0.17
178 0.17
179 0.18
180 0.16
181 0.14
182 0.15
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.05
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.1
222 0.12
223 0.12
224 0.21
225 0.21
226 0.28
227 0.33
228 0.37
229 0.41
230 0.45
231 0.53
232 0.52
233 0.6
234 0.6
235 0.64
236 0.63
237 0.6
238 0.62
239 0.57
240 0.5
241 0.42
242 0.38
243 0.34
244 0.3
245 0.27
246 0.2
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.13
252 0.23
253 0.23
254 0.26
255 0.3
256 0.32
257 0.35
258 0.41
259 0.43
260 0.39
261 0.4
262 0.43
263 0.41
264 0.45
265 0.46
266 0.48
267 0.54
268 0.5
269 0.54
270 0.54
271 0.6
272 0.64
273 0.69
274 0.7
275 0.7
276 0.79
277 0.83
278 0.82
279 0.79
280 0.73
281 0.69
282 0.62
283 0.55
284 0.47
285 0.39
286 0.35
287 0.32
288 0.26
289 0.2
290 0.18
291 0.16
292 0.15
293 0.13
294 0.15
295 0.17
296 0.19
297 0.19
298 0.18
299 0.23
300 0.24
301 0.28
302 0.32
303 0.32
304 0.38
305 0.45
306 0.48
307 0.52
308 0.56
309 0.62
310 0.64
311 0.71
312 0.73
313 0.73
314 0.79
315 0.75
316 0.74
317 0.65
318 0.58
319 0.53
320 0.45
321 0.38
322 0.3
323 0.25
324 0.19
325 0.19
326 0.16
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.14
352 0.2
353 0.23
354 0.28