Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MH00

Protein Details
Accession C5MH00    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-70FSPTNSPVKRKPSYKRSKVIVHSDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 11.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG ctp:CTRG_05354  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSSKSKKYESLNRYKRLPNTGSSPVTIGKPIDPQPITSSPTKHSIFSPTNSPVKRKPSYKRSKVIVHSDDSHLFESNSPKKHGSYLEMSSPVKASKAFDLIDVKALEKSTPSPEKTRKPAMSKSDEFKIEGLIEVSDDDDDDDGGKSSKTTGLSSFVEKLDPKNLLHSLEEHNKDKYKDVLQKYKRYNIPKPIKYKSKLLERADKHMKVIRKILEQKQEPSSYYYLARKQCYKSKHETMSAQEKWSIEWESYFGGYYGFQRQSIIGSYILEKYENKLLKFSNGNKTVSYWTVPQFSTYVLANEIIIRMIMEDMNMDFKEAETFCQKTTDYGTMVADAIEVVNEEYHESESETNPDDSDVILVPSKKRKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.77
3 0.76
4 0.7
5 0.64
6 0.61
7 0.63
8 0.58
9 0.51
10 0.47
11 0.4
12 0.37
13 0.34
14 0.29
15 0.22
16 0.26
17 0.29
18 0.35
19 0.33
20 0.33
21 0.37
22 0.4
23 0.42
24 0.4
25 0.39
26 0.34
27 0.42
28 0.41
29 0.36
30 0.34
31 0.39
32 0.39
33 0.39
34 0.43
35 0.41
36 0.48
37 0.49
38 0.53
39 0.52
40 0.56
41 0.61
42 0.63
43 0.67
44 0.7
45 0.78
46 0.82
47 0.84
48 0.82
49 0.83
50 0.82
51 0.82
52 0.75
53 0.69
54 0.63
55 0.58
56 0.54
57 0.47
58 0.4
59 0.31
60 0.26
61 0.24
62 0.3
63 0.32
64 0.34
65 0.34
66 0.35
67 0.35
68 0.39
69 0.39
70 0.35
71 0.34
72 0.33
73 0.34
74 0.37
75 0.36
76 0.33
77 0.31
78 0.26
79 0.21
80 0.19
81 0.16
82 0.14
83 0.17
84 0.17
85 0.19
86 0.22
87 0.21
88 0.24
89 0.23
90 0.21
91 0.19
92 0.19
93 0.16
94 0.13
95 0.15
96 0.18
97 0.24
98 0.27
99 0.34
100 0.42
101 0.5
102 0.56
103 0.63
104 0.62
105 0.62
106 0.67
107 0.67
108 0.68
109 0.64
110 0.61
111 0.57
112 0.51
113 0.46
114 0.38
115 0.31
116 0.22
117 0.18
118 0.15
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.15
140 0.16
141 0.18
142 0.2
143 0.17
144 0.18
145 0.18
146 0.18
147 0.17
148 0.18
149 0.16
150 0.18
151 0.19
152 0.18
153 0.18
154 0.19
155 0.21
156 0.26
157 0.3
158 0.28
159 0.29
160 0.31
161 0.31
162 0.3
163 0.29
164 0.28
165 0.33
166 0.37
167 0.45
168 0.48
169 0.56
170 0.59
171 0.63
172 0.63
173 0.62
174 0.63
175 0.63
176 0.66
177 0.65
178 0.68
179 0.68
180 0.7
181 0.66
182 0.66
183 0.62
184 0.62
185 0.64
186 0.61
187 0.63
188 0.56
189 0.62
190 0.63
191 0.57
192 0.49
193 0.45
194 0.44
195 0.38
196 0.41
197 0.36
198 0.36
199 0.43
200 0.47
201 0.52
202 0.51
203 0.52
204 0.51
205 0.49
206 0.43
207 0.39
208 0.33
209 0.26
210 0.26
211 0.27
212 0.28
213 0.31
214 0.34
215 0.36
216 0.39
217 0.44
218 0.47
219 0.49
220 0.52
221 0.55
222 0.57
223 0.56
224 0.55
225 0.55
226 0.59
227 0.54
228 0.47
229 0.41
230 0.35
231 0.31
232 0.3
233 0.25
234 0.15
235 0.13
236 0.13
237 0.11
238 0.12
239 0.11
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.1
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.17
252 0.11
253 0.11
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.13
259 0.14
260 0.21
261 0.24
262 0.23
263 0.25
264 0.26
265 0.3
266 0.37
267 0.41
268 0.43
269 0.45
270 0.46
271 0.43
272 0.44
273 0.42
274 0.37
275 0.32
276 0.26
277 0.24
278 0.27
279 0.26
280 0.25
281 0.22
282 0.21
283 0.2
284 0.17
285 0.15
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.15
306 0.15
307 0.17
308 0.19
309 0.21
310 0.21
311 0.24
312 0.24
313 0.22
314 0.27
315 0.27
316 0.23
317 0.24
318 0.24
319 0.21
320 0.21
321 0.19
322 0.13
323 0.1
324 0.08
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.15
337 0.18
338 0.21
339 0.2
340 0.19
341 0.19
342 0.18
343 0.16
344 0.16
345 0.13
346 0.12
347 0.15
348 0.18
349 0.23