FuNGI

C5MG95

Protein Details

Accession

C5MG95

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
91-118	NNDVARKLKSTEKRTRRQRVSQYYLTTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	ctp:CTRG_05088 -
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MKGNMGDPDYIPENNSDLKFKPSSQQIDKELKSLQENDSIIEQKVLSDYLQSNDNNSSGEESKDQEEQNSKLQKHPDFVIQESRNDIATENNDVARKLKSTEKRTRRQRVSQYYLTTADKNKLLEKIHDKMQITLEAKDLLGLSPEFRSYINKRTKAILVDPLKLNNRLESNLVLTEETEGTEQENLLELASFDICEEGQDDNESETDDESEYKLESFNASLTREDEEISKPLIKFKVQIKSKELTALYDPGSMANLISRNVVEELKLKTQPFSAVISGINPGQGKIKDLVKTWIKIGCHELPITLLVHDSLPSDRLIIGMAFKDKTHFEVVYADAKSDEKNIQFTYNQVPITYKLLDENLGILESYNSEVIDIDEKLKSILDKSIFDDEEKAYFMEKVQEVKEVFQLHENDIGKFKGDGFEPIKIPIGEHKPWMLKGYPVGSKRAEMIDLLRTMLKTDQIEFAENSKYRNPVFCIRKSNGSLRLLLDLRILNEYIPLEANIPPNIHDIISNLAEGEIFSKFDISNAYYQLEISESSRDLTTFNSPIGCLRMKRLPQGFRNSVSIFSGIMNKMLQPMAKEVFSFLDDICIPGNKRKKSDPNANFEHIDKIIRLFTILKDHGLKLNANKIEIGKSSTSFLGFQVSEQGVRPLKSRLQALEELPPPTDIKQLDRIIGVSNYYRSFLPGLSEILKPLYQLLNKCRKEGIKTIKLTDEELLNFNFLKKSLLHGPHISSMKNDRKLQLYTDASISTWACVLQQEDKEGNKYLIDCISGGFKNAESRYTIYEKEIFSIYLGLTHLQYHFLDYPGKIEVFCDNQSAVKLINGRLDNQHQVNRLWRWLNTIRNFDIELKHIPTDLNILADTFTRVHNPNKSILLSEDFYQAIDDFRSKLEIQVNISEITNDCFKYKNYSLNAIKHYLQHLQVPEEYQTSKKIRQQFIYRAMEFYIADGKLYKLGSKGQFSRLVVMNDTELFKIFEVAHDQGGHMKIHTLFDKLNLQFYIPNLYQKLLAYISSCETCQKYDSPTKTRDSLRITRPGGLFQTVICDSVHIGDYYLVIARDEFSFWAEATVLDSLEAEKIADFLYKDILCRYGMVSRFKSDNGSEFNNKIIDRLLNYYNVEHAKSIQFHPMGNAISERGHVAIISFLKKLPKELDWRKYLPTALKTDRNTVKSTTGFTPQYLLYGYMGYTSLDLLCEKIPDDKLYTQEELFKFRFQQLQFRESQYQSAYISTERNRSRYKQIVDNKNESNKKIEPGDWVLVYDRPLKNPFASHAKKLEEKWAGPYKVASRGDRIYWLEELDGTLMGRPYSREMIKPFISRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.27
3	0.26
4	0.24
5	0.3
6	0.33
7	0.33
8	0.38
9	0.41
10	0.49
11	0.53
12	0.59
13	0.61
14	0.68
15	0.67
16	0.63
17	0.57
18	0.51
19	0.49
20	0.45
21	0.4
22	0.37
23	0.36
24	0.35
25	0.36
26	0.35
27	0.3
28	0.28
29	0.25
30	0.18
31	0.19
32	0.18
33	0.13
34	0.16
35	0.17
36	0.17
37	0.23
38	0.23
39	0.24
40	0.26
41	0.27
42	0.22
43	0.21
44	0.24
45	0.2
46	0.22
47	0.22
48	0.22
49	0.24
50	0.29
51	0.29
52	0.3
53	0.34
54	0.34
55	0.41
56	0.47
57	0.46
58	0.46
59	0.54
60	0.52
61	0.51
62	0.51
63	0.5
64	0.46
65	0.48
66	0.52
67	0.47
68	0.45
69	0.44
70	0.42
71	0.35
72	0.31
73	0.27
74	0.22
75	0.22
76	0.24
77	0.23
78	0.25
79	0.25
80	0.26
81	0.27
82	0.25
83	0.24
84	0.22
85	0.3
86	0.37
87	0.46
88	0.56
89	0.65
90	0.72
91	0.81
92	0.89
93	0.9
94	0.9
95	0.91
96	0.91
97	0.89
98	0.87
99	0.81
100	0.74
101	0.69
102	0.62
103	0.55
104	0.48
105	0.44
106	0.4
107	0.36
108	0.36
109	0.37
110	0.37
111	0.41
112	0.44
113	0.44
114	0.48
115	0.53
116	0.5
117	0.47
118	0.48
119	0.47
120	0.42
121	0.38
122	0.33
123	0.27
124	0.26
125	0.23
126	0.2
127	0.12
128	0.13
129	0.12
130	0.11
131	0.12
132	0.12
133	0.12
134	0.13
135	0.2
136	0.22
137	0.32
138	0.41
139	0.44
140	0.46
141	0.5
142	0.54
143	0.51
144	0.51
145	0.51
146	0.45
147	0.46
148	0.47
149	0.49
150	0.49
151	0.48
152	0.45
153	0.39
154	0.37
155	0.33
156	0.33
157	0.28
158	0.26
159	0.24
160	0.23
161	0.19
162	0.16
163	0.17
164	0.15
165	0.14
166	0.11
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.08
172	0.09
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.07
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.08
185	0.07
186	0.08
187	0.1
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.12
192	0.11
193	0.1
194	0.11
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.12
206	0.14
207	0.15
208	0.16
209	0.17
210	0.18
211	0.18
212	0.18
213	0.17
214	0.17
215	0.18
216	0.19
217	0.23
218	0.21
219	0.26
220	0.28
221	0.28
222	0.31
223	0.36
224	0.43
225	0.45
226	0.51
227	0.51
228	0.51
229	0.51
230	0.52
231	0.45
232	0.38
233	0.34
234	0.31
235	0.27
236	0.25
237	0.24
238	0.17
239	0.18
240	0.14
241	0.11
242	0.11
243	0.11
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.13
249	0.14
250	0.12
251	0.15
252	0.19
253	0.23
254	0.28
255	0.26
256	0.26
257	0.27
258	0.28
259	0.26
260	0.25
261	0.2
262	0.17
263	0.17
264	0.16
265	0.16
266	0.14
267	0.15
268	0.12
269	0.11
270	0.15
271	0.16
272	0.17
273	0.2
274	0.24
275	0.24
276	0.26
277	0.34
278	0.34
279	0.35
280	0.35
281	0.36
282	0.32
283	0.31
284	0.36
285	0.32
286	0.29
287	0.28
288	0.25
289	0.22
290	0.23
291	0.21
292	0.14
293	0.11
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.09
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.14
312	0.14
313	0.17
314	0.19
315	0.17
316	0.15
317	0.17
318	0.2
319	0.24
320	0.23
321	0.2
322	0.17
323	0.18
324	0.18
325	0.18
326	0.2
327	0.15
328	0.18
329	0.19
330	0.22
331	0.21
332	0.23
333	0.26
334	0.26
335	0.25
336	0.22
337	0.22
338	0.21
339	0.25
340	0.23
341	0.17
342	0.14
343	0.15
344	0.16
345	0.14
346	0.13
347	0.1
348	0.09
349	0.08
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.09
360	0.09
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.1
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.14
369	0.15
370	0.16
371	0.19
372	0.24
373	0.24
374	0.24
375	0.26
376	0.21
377	0.2
378	0.19
379	0.16
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.14
384	0.15
385	0.17
386	0.17
387	0.21
388	0.21
389	0.22
390	0.25
391	0.22
392	0.21
393	0.23
394	0.24
395	0.2
396	0.26
397	0.26
398	0.23
399	0.23
400	0.23
401	0.18
402	0.17
403	0.16
404	0.12
405	0.11
406	0.17
407	0.17
408	0.21
409	0.21
410	0.21
411	0.24
412	0.21
413	0.21
414	0.22
415	0.26
416	0.23
417	0.24
418	0.27
419	0.26
420	0.27
421	0.3
422	0.24
423	0.19
424	0.2
425	0.23
426	0.26
427	0.25
428	0.29
429	0.27
430	0.26
431	0.27
432	0.25
433	0.21
434	0.15
435	0.15
436	0.15
437	0.15
438	0.15
439	0.14
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.15
444	0.12
445	0.13
446	0.16
447	0.16
448	0.18
449	0.18
450	0.19
451	0.22
452	0.22
453	0.22
454	0.21
455	0.23
456	0.22
457	0.25
458	0.27
459	0.3
460	0.36
461	0.4
462	0.45
463	0.45
464	0.5
465	0.51
466	0.53
467	0.51
468	0.46
469	0.42
470	0.35
471	0.37
472	0.31
473	0.28
474	0.24
475	0.17
476	0.16
477	0.15
478	0.15
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.08
483	0.08
484	0.07
485	0.08
486	0.1
487	0.12
488	0.12
489	0.12
490	0.12
491	0.14
492	0.14
493	0.13
494	0.11
495	0.1
496	0.11
497	0.11
498	0.1
499	0.08
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.08
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.06
508	0.06
509	0.06
510	0.08
511	0.09
512	0.1
513	0.11
514	0.12
515	0.11
516	0.11
517	0.11
518	0.1
519	0.09
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.12
529	0.11
530	0.12
531	0.11
532	0.11
533	0.12
534	0.15
535	0.15
536	0.12
537	0.15
538	0.21
539	0.23
540	0.29
541	0.35
542	0.39
543	0.43
544	0.52
545	0.52
546	0.47
547	0.5
548	0.44
549	0.38
550	0.32
551	0.26
552	0.17
553	0.14
554	0.16
555	0.11
556	0.12
557	0.11
558	0.1
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.08
563	0.11
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.11
568	0.11
569	0.11
570	0.11
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.09
575	0.08
576	0.09
577	0.1
578	0.15
579	0.23
580	0.24
581	0.28
582	0.34
583	0.44
584	0.5
585	0.6
586	0.61
587	0.61
588	0.64
589	0.63
590	0.57
591	0.49
592	0.43
593	0.32
594	0.26
595	0.18
596	0.14
597	0.11
598	0.1
599	0.1
600	0.08
601	0.09
602	0.14
603	0.14
604	0.15
605	0.16
606	0.17
607	0.18
608	0.19
609	0.2
610	0.16
611	0.22
612	0.21
613	0.2
614	0.2
615	0.18
616	0.18
617	0.17
618	0.18
619	0.12
620	0.12
621	0.13
622	0.12
623	0.12
624	0.11
625	0.1
626	0.11
627	0.1
628	0.09
629	0.11
630	0.11
631	0.11
632	0.11
633	0.14
634	0.13
635	0.13
636	0.15
637	0.14
638	0.16
639	0.19
640	0.2
641	0.18
642	0.2
643	0.22
644	0.22
645	0.25
646	0.25
647	0.23
648	0.21
649	0.21
650	0.17
651	0.15
652	0.18
653	0.12
654	0.13
655	0.19
656	0.2
657	0.2
658	0.2
659	0.19
660	0.17
661	0.17
662	0.16
663	0.09
664	0.1
665	0.1
666	0.11
667	0.1
668	0.1
669	0.1
670	0.09
671	0.1
672	0.09
673	0.1
674	0.11
675	0.11
676	0.11
677	0.11
678	0.11
679	0.1
680	0.1
681	0.12
682	0.12
683	0.15
684	0.23
685	0.33
686	0.34
687	0.35
688	0.37
689	0.36
690	0.38
691	0.43
692	0.44
693	0.42
694	0.43
695	0.44
696	0.44
697	0.43
698	0.4
699	0.32
700	0.24
701	0.17
702	0.16
703	0.14
704	0.11
705	0.11
706	0.1
707	0.1
708	0.08
709	0.09
710	0.07
711	0.11
712	0.17
713	0.21
714	0.23
715	0.24
716	0.26
717	0.29
718	0.31
719	0.28
720	0.22
721	0.28
722	0.32
723	0.37
724	0.37
725	0.34
726	0.37
727	0.38
728	0.38
729	0.37
730	0.31
731	0.25
732	0.24
733	0.23
734	0.19
735	0.19
736	0.17
737	0.1
738	0.08
739	0.07
740	0.06
741	0.06
742	0.08
743	0.1
744	0.11
745	0.14
746	0.16
747	0.17
748	0.19
749	0.19
750	0.18
751	0.15
752	0.15
753	0.13
754	0.11
755	0.11
756	0.09
757	0.08
758	0.11
759	0.1
760	0.11
761	0.1
762	0.1
763	0.14
764	0.14
765	0.15
766	0.13
767	0.15
768	0.18
769	0.2
770	0.2
771	0.18
772	0.22
773	0.21
774	0.21
775	0.2
776	0.16
777	0.13
778	0.14
779	0.11
780	0.08
781	0.09
782	0.08
783	0.07
784	0.08
785	0.08
786	0.09
787	0.09
788	0.11
789	0.11
790	0.12
791	0.13
792	0.12
793	0.14
794	0.13
795	0.14
796	0.11
797	0.11
798	0.12
799	0.13
800	0.14
801	0.14
802	0.13
803	0.13
804	0.14
805	0.13
806	0.11
807	0.1
808	0.12
809	0.12
810	0.17
811	0.17
812	0.18
813	0.21
814	0.23
815	0.26
816	0.27
817	0.29
818	0.26
819	0.28
820	0.32
821	0.31
822	0.33
823	0.3
824	0.27
825	0.31
826	0.35
827	0.41
828	0.4
829	0.44
830	0.4
831	0.39
832	0.41
833	0.36
834	0.31
835	0.26
836	0.24
837	0.21
838	0.2
839	0.19
840	0.17
841	0.15
842	0.17
843	0.14
844	0.12
845	0.09
846	0.09
847	0.09
848	0.09
849	0.1
850	0.08
851	0.08
852	0.11
853	0.14
854	0.18
855	0.24
856	0.26
857	0.28
858	0.3
859	0.3
860	0.27
861	0.26
862	0.25
863	0.2
864	0.19
865	0.18
866	0.15
867	0.14
868	0.14
869	0.12
870	0.09
871	0.09
872	0.09
873	0.08
874	0.08
875	0.11
876	0.11
877	0.14
878	0.18
879	0.19
880	0.21
881	0.22
882	0.24
883	0.21
884	0.21
885	0.18
886	0.14
887	0.14
888	0.14
889	0.12
890	0.11
891	0.12
892	0.13
893	0.2
894	0.23
895	0.28
896	0.29
897	0.37
898	0.43
899	0.47
900	0.5
901	0.46
902	0.44
903	0.4
904	0.4
905	0.34
906	0.3
907	0.28
908	0.26
909	0.25
910	0.24
911	0.23
912	0.22
913	0.2
914	0.2
915	0.17
916	0.22
917	0.24
918	0.29
919	0.33
920	0.41
921	0.44
922	0.5
923	0.57
924	0.59
925	0.64
926	0.66
927	0.61
928	0.53
929	0.48
930	0.42
931	0.34
932	0.26
933	0.21
934	0.13
935	0.13
936	0.13
937	0.12
938	0.14
939	0.14
940	0.14
941	0.11
942	0.18
943	0.22
944	0.27
945	0.3
946	0.32
947	0.38
948	0.37
949	0.4
950	0.37
951	0.35
952	0.3
953	0.27
954	0.23
955	0.19
956	0.2
957	0.16
958	0.12
959	0.12
960	0.1
961	0.12
962	0.1
963	0.1
964	0.13
965	0.14
966	0.15
967	0.15
968	0.15
969	0.17
970	0.19
971	0.18
972	0.13
973	0.15
974	0.15
975	0.17
976	0.18
977	0.17
978	0.15
979	0.18
980	0.26
981	0.24
982	0.26
983	0.24
984	0.23
985	0.23
986	0.23
987	0.27
988	0.19
989	0.23
990	0.2
991	0.21
992	0.21
993	0.2
994	0.22
995	0.16
996	0.16
997	0.13
998	0.13
999	0.15
1000	0.15
1001	0.15
1002	0.16
1003	0.17
1004	0.17
1005	0.18
1006	0.19
1007	0.23
1008	0.32
1009	0.39
1010	0.42
1011	0.47
1012	0.5
1013	0.54
1014	0.55
1015	0.56
1016	0.55
1017	0.56
1018	0.56
1019	0.6
1020	0.57
1021	0.57
1022	0.54
1023	0.5
1024	0.44
1025	0.37
1026	0.3
1027	0.21
1028	0.24
1029	0.18
1030	0.18
1031	0.15
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.13
1035	0.14
1036	0.09
1037	0.09
1038	0.08
1039	0.09
1040	0.09
1041	0.1
1042	0.09
1043	0.08
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.09
1047	0.09
1048	0.09
1049	0.09
1050	0.1
1051	0.09
1052	0.1
1053	0.09
1054	0.08
1055	0.09
1056	0.09
1057	0.08
1058	0.07
1059	0.07
1060	0.07
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.06
1064	0.05
1065	0.06
1066	0.06
1067	0.08
1068	0.08
1069	0.08
1070	0.13
1071	0.13
1072	0.14
1073	0.15
1074	0.17
1075	0.15
1076	0.16
1077	0.17
1078	0.18
1079	0.23
1080	0.3
1081	0.31
1082	0.33
1083	0.35
1084	0.35
1085	0.37
1086	0.33
1087	0.33
1088	0.31
1089	0.34
1090	0.35
1091	0.34
1092	0.36
1093	0.35
1094	0.33
1095	0.28
1096	0.26
1097	0.22
1098	0.2
1099	0.24
1100	0.23
1101	0.23
1102	0.25
1103	0.25
1104	0.28
1105	0.28
1106	0.26
1107	0.22
1108	0.22
1109	0.23
1110	0.25
1111	0.27
1112	0.29
1113	0.28
1114	0.27
1115	0.28
1116	0.3
1117	0.26
1118	0.23
1119	0.22
1120	0.16
1121	0.16
1122	0.16
1123	0.15
1124	0.11
1125	0.11
1126	0.09
1127	0.08
1128	0.11
1129	0.14
1130	0.16
1131	0.16
1132	0.17
1133	0.23
1134	0.24
1135	0.27
1136	0.27
1137	0.3
1138	0.39
1139	0.48
1140	0.55
1141	0.57
1142	0.6
1143	0.6
1144	0.59
1145	0.57
1146	0.54
1147	0.5
1148	0.5
1149	0.49
1150	0.55
1151	0.54
1152	0.6
1153	0.63
1154	0.59
1155	0.56
1156	0.5
1157	0.49
1158	0.43
1159	0.45
1160	0.39
1161	0.38
1162	0.36
1163	0.34
1164	0.34
1165	0.27
1166	0.27
1167	0.23
1168	0.21
1169	0.14
1170	0.13
1171	0.12
1172	0.1
1173	0.11
1174	0.09
1175	0.09
1176	0.08
1177	0.08
1178	0.08
1179	0.08
1180	0.09
1181	0.09
1182	0.1
1183	0.11
1184	0.15
1185	0.18
1186	0.19
1187	0.24
1188	0.26
1189	0.29
1190	0.34
1191	0.35
1192	0.31
1193	0.37
1194	0.36
1195	0.38
1196	0.37
1197	0.36
1198	0.34
1199	0.36
1200	0.42
1201	0.36
1202	0.44
1203	0.43
1204	0.47
1205	0.48
1206	0.51
1207	0.54
1208	0.48
1209	0.51
1210	0.43
1211	0.39
1212	0.34
1213	0.31
1214	0.27
1215	0.22
1216	0.27
1217	0.27
1218	0.34
1219	0.36
1220	0.43
1221	0.48
1222	0.52
1223	0.59
1224	0.62
1225	0.64
1226	0.65
1227	0.7
1228	0.74
1229	0.76
1230	0.78
1231	0.76
1232	0.77
1233	0.77
1234	0.69
1235	0.66
1236	0.59
1237	0.56
1238	0.53
1239	0.47
1240	0.43
1241	0.44
1242	0.46
1243	0.4
1244	0.37
1245	0.33
1246	0.31
1247	0.31
1248	0.33
1249	0.29
1250	0.3
1251	0.33
1252	0.35
1253	0.36
1254	0.37
1255	0.4
1256	0.43
1257	0.46
1258	0.47
1259	0.51
1260	0.54
1261	0.57
1262	0.57
1263	0.6
1264	0.57
1265	0.53
1266	0.55
1267	0.58
1268	0.54
1269	0.49
1270	0.52
1271	0.46
1272	0.48
1273	0.52
1274	0.46
1275	0.43
1276	0.45
1277	0.46
1278	0.48
1279	0.46
1280	0.4
1281	0.36
1282	0.34
1283	0.28
1284	0.24
1285	0.23
1286	0.17
1287	0.15
1288	0.11
1289	0.12
1290	0.12
1291	0.12
1292	0.12
1293	0.13
1294	0.17
1295	0.24
1296	0.27
1297	0.31
1298	0.34
1299	0.42
1300	0.47

C5MG95

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer