Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MG16

Protein Details
Accession C5MG16    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-38ANRKRALERLQQKNGKRPAQHydrophilic
46-66QQPAVKKNKFQPPPIRKQDYIHydrophilic
214-244QEWERRELNKAKRKEKKYQDQLREMRKRTRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-26ANRKRALE
221-243LNKAKRKEKKYQDQLREMRKRTR
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 1, cyto 1, pero 1, vacu 1, cyto_mito 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0000110  C:nucleotide-excision repair factor 1 complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:1901255  P:nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair  
GO:0000715  P:nucleotide-excision repair, DNA damage recognition  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
KEGG ctp:CTRG_05009  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MSTPARPALTDEQRKRIEANRKRALERLQQKNGKRPAQSEPSEHQQQPAVKKNKFQPPPIRKQDYIEYDFATMKDTKGGFIYDGPEPGEEDAKTLNDWKKEQQSKELPPPMDLSAMPRCFECDSVDIDKNLFTNFDVRACRKCIKAKPDKYSLLTKTEAKEDYLLTEPEIADKDLLKRIEKPNPHGYSNMQLFVRFQVEEFAWKKWGGPEQLDQEWERRELNKAKRKEKKYQDQLREMRKRTRAEEYTRKLRDGKSLGEKHEHDWSAPVTIDKNTIKRRCIDCGIETEEVVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.6
3 0.59
4 0.6
5 0.59
6 0.64
7 0.64
8 0.67
9 0.69
10 0.72
11 0.71
12 0.7
13 0.71
14 0.7
15 0.71
16 0.73
17 0.76
18 0.79
19 0.81
20 0.77
21 0.71
22 0.65
23 0.64
24 0.65
25 0.63
26 0.6
27 0.56
28 0.57
29 0.61
30 0.57
31 0.5
32 0.46
33 0.47
34 0.49
35 0.53
36 0.54
37 0.49
38 0.56
39 0.62
40 0.67
41 0.68
42 0.69
43 0.7
44 0.71
45 0.8
46 0.83
47 0.81
48 0.73
49 0.71
50 0.7
51 0.67
52 0.61
53 0.52
54 0.43
55 0.37
56 0.37
57 0.32
58 0.27
59 0.19
60 0.15
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.13
67 0.14
68 0.16
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.16
82 0.19
83 0.2
84 0.23
85 0.27
86 0.36
87 0.43
88 0.44
89 0.48
90 0.52
91 0.55
92 0.62
93 0.63
94 0.54
95 0.48
96 0.48
97 0.4
98 0.33
99 0.26
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.21
104 0.19
105 0.2
106 0.19
107 0.2
108 0.17
109 0.12
110 0.15
111 0.19
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.18
116 0.16
117 0.15
118 0.11
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.12
123 0.14
124 0.16
125 0.19
126 0.23
127 0.25
128 0.27
129 0.34
130 0.37
131 0.44
132 0.52
133 0.58
134 0.6
135 0.65
136 0.64
137 0.6
138 0.61
139 0.53
140 0.46
141 0.4
142 0.37
143 0.31
144 0.31
145 0.28
146 0.22
147 0.21
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.15
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.21
165 0.27
166 0.34
167 0.37
168 0.42
169 0.48
170 0.5
171 0.5
172 0.46
173 0.42
174 0.42
175 0.4
176 0.36
177 0.26
178 0.22
179 0.22
180 0.21
181 0.21
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.18
187 0.19
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.2
192 0.21
193 0.26
194 0.23
195 0.24
196 0.28
197 0.31
198 0.33
199 0.35
200 0.32
201 0.31
202 0.3
203 0.28
204 0.25
205 0.21
206 0.26
207 0.32
208 0.42
209 0.47
210 0.55
211 0.64
212 0.72
213 0.78
214 0.82
215 0.84
216 0.84
217 0.86
218 0.88
219 0.87
220 0.87
221 0.88
222 0.89
223 0.88
224 0.82
225 0.8
226 0.77
227 0.73
228 0.67
229 0.69
230 0.66
231 0.65
232 0.71
233 0.7
234 0.73
235 0.71
236 0.7
237 0.65
238 0.59
239 0.59
240 0.52
241 0.51
242 0.51
243 0.54
244 0.55
245 0.58
246 0.58
247 0.52
248 0.56
249 0.49
250 0.39
251 0.36
252 0.33
253 0.27
254 0.26
255 0.25
256 0.18
257 0.19
258 0.25
259 0.27
260 0.35
261 0.42
262 0.48
263 0.51
264 0.57
265 0.61
266 0.61
267 0.63
268 0.6
269 0.54
270 0.54
271 0.56
272 0.48