Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDM0

Protein Details
Accession C5MDM0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
566-587DPKSRGGHSKPPKRQSYQESLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043154  Sec-1-like_dom1  
IPR043127  Sec-1-like_dom3a  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
Gene Ontology GO:0030134  C:COPII-coated ER to Golgi transport vesicle  
GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0019905  F:syntaxin binding  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
GO:0035543  P:positive regulation of SNARE complex assembly  
GO:0046578  P:regulation of Ras protein signal transduction  
GO:0006890  P:retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum  
GO:0048280  P:vesicle fusion with Golgi apparatus  
KEGG ctp:CTRG_03772  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00995  Sec1  
Amino Acid Sequences MSLDLSLRDRQISVLQKMLHLNKEGSADLTLASKSEEIIWKVLVLDTKSRAILSSVLRVNDLLKCGITVHALITSNRASLPDVPVIYFIEPTIENILVVIDDLNQDKYDSFYINFTSSINRELLEEFAKKVSISGKSQKIKQVFDQYLDYIVTEPNLFSLNLPQIFTQFNSSNTSEDKIHGLVDVIANGLLSTIISMDIVPVIRAQQNGPAEFVAQQLDLKLREYLSNTRGSTTATSSIQQRPVLILLDRNFDLTSMFSHSWIYQCMVSDVFQLQRNTIKLVKYDGEQSTIKNYDVDPKDFFWNKYSQLPFPDVVENADAELNAYKNDAKEVTNKTGISSLDDIDPNANATANIQQAVEKLPELTARKATLDMHMDILSSLINELQAKNLDKYFEIEQNAMDPKVLNEFLELLVVESERDNSEDKLRTFVILTLLVDLTPEYISKVKSIFQSKYPQVDLSSFDYIVKFKENSKLANLSSLNGTSNNFTNQASQMNSTALLSGLSSKLYGLTEGKISEGLTSIATKIKNFIPEKKLLPITTIVEAIMDPTNASQQSVQLTDEYLFLDPKSRGGHSKPPKRQSYQESLVFIVGGGNYLEYQNLEQWASDPNKVAKKVIYGSTDIISATDFLQECSILGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.38
4 0.45
5 0.49
6 0.46
7 0.41
8 0.39
9 0.36
10 0.38
11 0.34
12 0.28
13 0.23
14 0.19
15 0.16
16 0.17
17 0.14
18 0.11
19 0.12
20 0.1
21 0.1
22 0.14
23 0.19
24 0.19
25 0.21
26 0.21
27 0.21
28 0.21
29 0.23
30 0.22
31 0.19
32 0.22
33 0.24
34 0.26
35 0.27
36 0.26
37 0.25
38 0.22
39 0.25
40 0.23
41 0.28
42 0.29
43 0.28
44 0.29
45 0.29
46 0.3
47 0.27
48 0.26
49 0.19
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.15
55 0.13
56 0.11
57 0.14
58 0.16
59 0.16
60 0.19
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.16
66 0.17
67 0.21
68 0.22
69 0.22
70 0.21
71 0.22
72 0.23
73 0.21
74 0.18
75 0.14
76 0.12
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.05
88 0.06
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.13
98 0.14
99 0.16
100 0.17
101 0.17
102 0.15
103 0.18
104 0.17
105 0.19
106 0.18
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.18
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.18
116 0.16
117 0.17
118 0.2
119 0.2
120 0.25
121 0.32
122 0.41
123 0.46
124 0.51
125 0.57
126 0.57
127 0.56
128 0.56
129 0.58
130 0.51
131 0.48
132 0.46
133 0.4
134 0.36
135 0.32
136 0.26
137 0.16
138 0.14
139 0.12
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.12
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.21
155 0.17
156 0.18
157 0.22
158 0.23
159 0.23
160 0.23
161 0.25
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.16
166 0.15
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.15
194 0.18
195 0.18
196 0.19
197 0.17
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.12
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.15
212 0.2
213 0.21
214 0.27
215 0.26
216 0.26
217 0.25
218 0.25
219 0.23
220 0.2
221 0.2
222 0.15
223 0.16
224 0.2
225 0.24
226 0.26
227 0.25
228 0.23
229 0.21
230 0.21
231 0.21
232 0.16
233 0.17
234 0.14
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.15
239 0.14
240 0.14
241 0.09
242 0.09
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.12
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.18
263 0.18
264 0.2
265 0.22
266 0.2
267 0.17
268 0.19
269 0.19
270 0.17
271 0.22
272 0.2
273 0.21
274 0.2
275 0.2
276 0.21
277 0.22
278 0.21
279 0.16
280 0.16
281 0.21
282 0.23
283 0.24
284 0.22
285 0.22
286 0.28
287 0.29
288 0.3
289 0.24
290 0.24
291 0.24
292 0.29
293 0.29
294 0.25
295 0.25
296 0.27
297 0.24
298 0.23
299 0.22
300 0.16
301 0.15
302 0.13
303 0.11
304 0.09
305 0.08
306 0.06
307 0.05
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.15
318 0.19
319 0.22
320 0.25
321 0.25
322 0.24
323 0.26
324 0.25
325 0.21
326 0.18
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.1
332 0.1
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.05
337 0.05
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.11
345 0.1
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.15
354 0.16
355 0.17
356 0.17
357 0.17
358 0.17
359 0.16
360 0.16
361 0.15
362 0.14
363 0.13
364 0.12
365 0.09
366 0.06
367 0.05
368 0.03
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.07
373 0.1
374 0.12
375 0.13
376 0.14
377 0.14
378 0.14
379 0.16
380 0.17
381 0.19
382 0.19
383 0.18
384 0.17
385 0.19
386 0.2
387 0.17
388 0.15
389 0.11
390 0.09
391 0.12
392 0.13
393 0.1
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.08
407 0.09
408 0.1
409 0.16
410 0.2
411 0.2
412 0.23
413 0.22
414 0.22
415 0.21
416 0.21
417 0.18
418 0.14
419 0.14
420 0.12
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.08
430 0.09
431 0.1
432 0.12
433 0.14
434 0.2
435 0.26
436 0.27
437 0.3
438 0.39
439 0.41
440 0.46
441 0.44
442 0.4
443 0.35
444 0.34
445 0.32
446 0.28
447 0.26
448 0.21
449 0.2
450 0.2
451 0.19
452 0.18
453 0.19
454 0.15
455 0.15
456 0.23
457 0.25
458 0.26
459 0.3
460 0.34
461 0.3
462 0.36
463 0.34
464 0.27
465 0.26
466 0.25
467 0.21
468 0.18
469 0.19
470 0.14
471 0.15
472 0.16
473 0.16
474 0.15
475 0.16
476 0.17
477 0.19
478 0.19
479 0.19
480 0.18
481 0.17
482 0.17
483 0.15
484 0.13
485 0.1
486 0.08
487 0.07
488 0.08
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.1
496 0.1
497 0.11
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.13
503 0.11
504 0.1
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.13
510 0.14
511 0.14
512 0.16
513 0.19
514 0.27
515 0.3
516 0.38
517 0.4
518 0.45
519 0.48
520 0.52
521 0.54
522 0.45
523 0.44
524 0.39
525 0.35
526 0.31
527 0.28
528 0.21
529 0.16
530 0.16
531 0.15
532 0.13
533 0.1
534 0.08
535 0.08
536 0.13
537 0.12
538 0.14
539 0.12
540 0.13
541 0.16
542 0.18
543 0.18
544 0.14
545 0.15
546 0.15
547 0.15
548 0.14
549 0.12
550 0.12
551 0.11
552 0.16
553 0.15
554 0.18
555 0.21
556 0.22
557 0.27
558 0.32
559 0.43
560 0.49
561 0.6
562 0.66
563 0.72
564 0.79
565 0.8
566 0.83
567 0.81
568 0.8
569 0.78
570 0.73
571 0.66
572 0.58
573 0.52
574 0.42
575 0.33
576 0.24
577 0.16
578 0.11
579 0.08
580 0.07
581 0.07
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.1
586 0.12
587 0.14
588 0.14
589 0.13
590 0.14
591 0.21
592 0.24
593 0.25
594 0.27
595 0.32
596 0.4
597 0.41
598 0.44
599 0.38
600 0.41
601 0.44
602 0.45
603 0.42
604 0.38
605 0.38
606 0.36
607 0.34
608 0.28
609 0.22
610 0.17
611 0.14
612 0.11
613 0.14
614 0.13
615 0.13
616 0.14
617 0.14