Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M9T5

Protein Details
Accession C5M9T5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-320RLPTNQTKKSFKEKQRDLRNQFAGEHydrophilic
334-354GTSRKRKAGTVWDRVKKKKSYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-352RKRKAGTVWDRVKKKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ctp:CTRG_02247  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MSNIDTLLKDIITSTKSTKSSVDELVSYIQESASSHPELVENLIKKSSHTSKLEGVSLLSLKNESLVSYINNLILIVLSQLERLESNNDVDVEEKKLEVVKRSIVQRVTLEKGVKPLEKKINYQLDKMVRAYGRMEQDELKAEQKLNEDKESEGEGEDDDEDEEESEDDDEDDNLQYRPDASALAKLAPTSTKSKKSSSSSTTTEESNEKYKPPKISAMAPPTAISQKDIDAKSNNGKNRKVQSMEEYLQEQSDMPSVDASIGSTIIDHGRGGVKTAHDRRKEKEIQDYEENNFVRLPTNQTKKSFKEKQRDLRNQFAGEDWSMFNNKDVTKEGTSRKRKAGTVWDRVKKKKSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.26
3 0.27
4 0.29
5 0.31
6 0.33
7 0.35
8 0.37
9 0.36
10 0.3
11 0.3
12 0.31
13 0.28
14 0.24
15 0.19
16 0.14
17 0.12
18 0.12
19 0.14
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.2
27 0.23
28 0.21
29 0.22
30 0.25
31 0.24
32 0.25
33 0.32
34 0.36
35 0.37
36 0.39
37 0.41
38 0.44
39 0.47
40 0.48
41 0.41
42 0.34
43 0.28
44 0.26
45 0.22
46 0.16
47 0.13
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.1
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.13
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.15
84 0.17
85 0.2
86 0.21
87 0.22
88 0.26
89 0.3
90 0.35
91 0.32
92 0.33
93 0.33
94 0.35
95 0.35
96 0.34
97 0.33
98 0.28
99 0.32
100 0.33
101 0.33
102 0.3
103 0.34
104 0.39
105 0.41
106 0.43
107 0.47
108 0.53
109 0.52
110 0.51
111 0.5
112 0.45
113 0.45
114 0.42
115 0.38
116 0.27
117 0.27
118 0.26
119 0.25
120 0.24
121 0.22
122 0.23
123 0.19
124 0.2
125 0.22
126 0.22
127 0.19
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.19
132 0.23
133 0.23
134 0.24
135 0.23
136 0.22
137 0.23
138 0.22
139 0.18
140 0.13
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.15
178 0.2
179 0.27
180 0.3
181 0.33
182 0.39
183 0.43
184 0.47
185 0.45
186 0.46
187 0.42
188 0.42
189 0.41
190 0.35
191 0.32
192 0.28
193 0.25
194 0.23
195 0.21
196 0.2
197 0.23
198 0.27
199 0.29
200 0.29
201 0.33
202 0.31
203 0.36
204 0.41
205 0.43
206 0.4
207 0.36
208 0.34
209 0.3
210 0.3
211 0.24
212 0.18
213 0.13
214 0.14
215 0.2
216 0.2
217 0.22
218 0.22
219 0.25
220 0.31
221 0.36
222 0.4
223 0.4
224 0.43
225 0.47
226 0.51
227 0.54
228 0.5
229 0.47
230 0.47
231 0.48
232 0.46
233 0.41
234 0.36
235 0.3
236 0.27
237 0.24
238 0.18
239 0.11
240 0.12
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.14
261 0.16
262 0.26
263 0.35
264 0.43
265 0.49
266 0.53
267 0.56
268 0.63
269 0.68
270 0.63
271 0.64
272 0.62
273 0.6
274 0.64
275 0.64
276 0.56
277 0.56
278 0.52
279 0.41
280 0.35
281 0.29
282 0.23
283 0.21
284 0.27
285 0.29
286 0.38
287 0.44
288 0.5
289 0.58
290 0.61
291 0.7
292 0.72
293 0.72
294 0.74
295 0.78
296 0.82
297 0.85
298 0.9
299 0.87
300 0.87
301 0.84
302 0.75
303 0.65
304 0.56
305 0.49
306 0.39
307 0.34
308 0.25
309 0.21
310 0.22
311 0.21
312 0.21
313 0.22
314 0.22
315 0.22
316 0.26
317 0.28
318 0.31
319 0.38
320 0.46
321 0.51
322 0.6
323 0.64
324 0.69
325 0.7
326 0.67
327 0.68
328 0.69
329 0.69
330 0.7
331 0.74
332 0.75
333 0.78
334 0.84