Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6X4

Protein Details
Accession C5M6X4    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-93LTSAQIKKSKKSKKNDDGDYKSDVLSKKEQRKLKKLQSKAEIEEHydrophilic
286-305SEDAKKQRQLKKFGKQVQNAHydrophilic
344-389EEATRENDNRDNKRRKPNSKRLAKDAKYGFGGKKRGKRENDAQSSAHydrophilic
393-415GFSTRKMKGKSSSRPGKSKRRRNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-63KSKKSKK
325-327KKK
355-382NKRRKPNSKRLAKDAKYGFGGKKRGKRE
397-415RKMKGKSSSRPGKSKRRRN
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008610  Ebp2  
Gene Ontology GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0000280  P:nuclear division  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ctp:CTRG_01605  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05890  Ebp2  
Amino Acid Sequences MAKGTLKKQLKNQQLLDAIDKAKTKPVAKKVIEQEQSEDEEEEENEPVVLTSAQIKKSKKSKKNDDGDYKSDVLSKKEQRKLKKLQSKAEIEEEEQESEDDDEEEEEEEEELDLERLAASDSESDLNDDDDEEEDEDDEEEEEGEEKENDKEEEQEDIPLSDVEVDSDADIVPHTKLTINNMAALRESLARIELPWSKHSFIEHQSIISADKIETQIKDIYDDTERELAFYKQGLDAVKQARTTLLKLKVPFSRPMDYFAEMVKSDEHMDKLKNKLLTEAANKKASEDAKKQRQLKKFGKQVQNATLQERAKQKRETLEKINSLKKKRGANEISNDDDFQIALEEATRENDNRDNKRRKPNSKRLAKDAKYGFGGKKRGKRENDAQSSADISGFSTRKMKGKSSSRPGKSKRRRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.66
3 0.6
4 0.55
5 0.46
6 0.41
7 0.4
8 0.33
9 0.34
10 0.37
11 0.4
12 0.43
13 0.51
14 0.58
15 0.59
16 0.67
17 0.69
18 0.73
19 0.72
20 0.65
21 0.6
22 0.54
23 0.54
24 0.46
25 0.38
26 0.28
27 0.24
28 0.23
29 0.2
30 0.16
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.14
39 0.19
40 0.24
41 0.31
42 0.34
43 0.41
44 0.52
45 0.62
46 0.64
47 0.7
48 0.75
49 0.8
50 0.87
51 0.89
52 0.9
53 0.86
54 0.81
55 0.76
56 0.66
57 0.56
58 0.5
59 0.42
60 0.36
61 0.38
62 0.43
63 0.47
64 0.54
65 0.6
66 0.65
67 0.73
68 0.8
69 0.81
70 0.82
71 0.8
72 0.82
73 0.84
74 0.8
75 0.74
76 0.71
77 0.62
78 0.53
79 0.5
80 0.42
81 0.33
82 0.27
83 0.23
84 0.17
85 0.15
86 0.14
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.12
139 0.12
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.1
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.07
163 0.08
164 0.12
165 0.18
166 0.17
167 0.21
168 0.21
169 0.21
170 0.19
171 0.19
172 0.16
173 0.11
174 0.1
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.09
180 0.12
181 0.13
182 0.17
183 0.19
184 0.2
185 0.21
186 0.22
187 0.22
188 0.22
189 0.25
190 0.22
191 0.19
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.14
196 0.11
197 0.06
198 0.07
199 0.09
200 0.11
201 0.1
202 0.12
203 0.14
204 0.13
205 0.15
206 0.13
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.08
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.15
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.17
228 0.18
229 0.18
230 0.2
231 0.22
232 0.25
233 0.27
234 0.28
235 0.33
236 0.36
237 0.38
238 0.42
239 0.39
240 0.39
241 0.36
242 0.39
243 0.38
244 0.34
245 0.31
246 0.25
247 0.23
248 0.18
249 0.18
250 0.13
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.17
257 0.21
258 0.25
259 0.29
260 0.29
261 0.28
262 0.29
263 0.29
264 0.31
265 0.35
266 0.38
267 0.39
268 0.41
269 0.41
270 0.39
271 0.41
272 0.4
273 0.39
274 0.4
275 0.45
276 0.51
277 0.59
278 0.67
279 0.71
280 0.75
281 0.78
282 0.78
283 0.78
284 0.78
285 0.8
286 0.81
287 0.79
288 0.77
289 0.74
290 0.73
291 0.65
292 0.58
293 0.54
294 0.45
295 0.44
296 0.47
297 0.47
298 0.45
299 0.47
300 0.49
301 0.52
302 0.6
303 0.61
304 0.6
305 0.63
306 0.64
307 0.67
308 0.72
309 0.7
310 0.67
311 0.68
312 0.65
313 0.65
314 0.61
315 0.65
316 0.64
317 0.65
318 0.68
319 0.66
320 0.65
321 0.59
322 0.54
323 0.44
324 0.35
325 0.27
326 0.18
327 0.13
328 0.08
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.1
334 0.12
335 0.11
336 0.15
337 0.21
338 0.3
339 0.39
340 0.49
341 0.57
342 0.64
343 0.75
344 0.83
345 0.87
346 0.9
347 0.91
348 0.91
349 0.92
350 0.9
351 0.89
352 0.9
353 0.82
354 0.8
355 0.74
356 0.68
357 0.61
358 0.59
359 0.55
360 0.52
361 0.58
362 0.57
363 0.61
364 0.65
365 0.71
366 0.73
367 0.75
368 0.78
369 0.79
370 0.8
371 0.76
372 0.68
373 0.6
374 0.55
375 0.47
376 0.37
377 0.25
378 0.17
379 0.2
380 0.19
381 0.2
382 0.24
383 0.26
384 0.34
385 0.38
386 0.44
387 0.46
388 0.56
389 0.64
390 0.7
391 0.77
392 0.78
393 0.85
394 0.88
395 0.89