Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M2U1

Protein Details
Accession C5M2U1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-174KTIFSQQKYLKRKQQKFLRRFTVDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.333, nucl 14, mito_nucl 10.331, cyto 7.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
KEGG ctp:CTRG_00380  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSSTEFKKSKSIIQSGQHVLIRLPSEGLRIVHLQDTGVIGLGKFGQFEVSNILGYPLGTSFEILEDQKVKPIKSISTLDLQDSDESTQRQELTKIFSNSAENNQNIIDIGGKIQKLSKSDIDELKKSGAGSSIGQLIIEKIIAGHEGFDKKTIFSQQKYLKRKQQKFLRRFTVDYLGGSELLEYYIEKDLSKVLDLSIESLGLILTYANVRPGGKYLVIDETGGILTYAMMERMNCEGTIVSIHENEHPNLISLKYADYSDETESKVIKNINWLQFLEPENERIQWTDMTEEELKAVKNKPQYFKRRERALQINGVIDMVVNGNFDALITVSTLHIPGILDHVLPKIGGSRPVVIYNQYKETLLEIQQHLGPDKRVLAPAIYETRVRPYQTIPGRMHPVMSNRGGGGYILWGTRVIPHHEITAVGKGFAKRRKTETSTVEGDETPEVESESIQDTPAETTPEIVST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.61
3 0.64
4 0.58
5 0.49
6 0.42
7 0.38
8 0.33
9 0.26
10 0.23
11 0.18
12 0.18
13 0.21
14 0.21
15 0.2
16 0.2
17 0.21
18 0.22
19 0.21
20 0.19
21 0.16
22 0.17
23 0.14
24 0.13
25 0.11
26 0.08
27 0.09
28 0.11
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.15
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.09
49 0.12
50 0.12
51 0.15
52 0.16
53 0.16
54 0.22
55 0.26
56 0.25
57 0.27
58 0.3
59 0.29
60 0.32
61 0.36
62 0.32
63 0.36
64 0.37
65 0.34
66 0.32
67 0.31
68 0.25
69 0.23
70 0.22
71 0.18
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.19
77 0.2
78 0.21
79 0.24
80 0.31
81 0.32
82 0.31
83 0.31
84 0.34
85 0.33
86 0.38
87 0.37
88 0.3
89 0.29
90 0.28
91 0.26
92 0.22
93 0.2
94 0.14
95 0.08
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.16
101 0.18
102 0.19
103 0.23
104 0.26
105 0.27
106 0.33
107 0.4
108 0.42
109 0.42
110 0.41
111 0.38
112 0.35
113 0.3
114 0.25
115 0.19
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.08
126 0.06
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.09
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.15
137 0.14
138 0.17
139 0.24
140 0.26
141 0.25
142 0.34
143 0.4
144 0.5
145 0.57
146 0.63
147 0.65
148 0.71
149 0.78
150 0.79
151 0.8
152 0.81
153 0.82
154 0.83
155 0.83
156 0.76
157 0.7
158 0.63
159 0.6
160 0.5
161 0.41
162 0.34
163 0.24
164 0.2
165 0.18
166 0.15
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.04
171 0.05
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.09
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.04
190 0.04
191 0.02
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.04
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.03
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.11
232 0.13
233 0.13
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.14
255 0.12
256 0.19
257 0.25
258 0.29
259 0.3
260 0.31
261 0.29
262 0.31
263 0.32
264 0.28
265 0.22
266 0.2
267 0.18
268 0.19
269 0.18
270 0.15
271 0.15
272 0.12
273 0.13
274 0.11
275 0.1
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.16
283 0.18
284 0.18
285 0.25
286 0.31
287 0.39
288 0.47
289 0.58
290 0.64
291 0.72
292 0.77
293 0.79
294 0.77
295 0.77
296 0.76
297 0.71
298 0.68
299 0.59
300 0.51
301 0.41
302 0.37
303 0.28
304 0.19
305 0.13
306 0.07
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.08
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.15
336 0.16
337 0.19
338 0.2
339 0.23
340 0.24
341 0.25
342 0.28
343 0.28
344 0.3
345 0.28
346 0.26
347 0.24
348 0.26
349 0.25
350 0.22
351 0.25
352 0.22
353 0.24
354 0.25
355 0.26
356 0.25
357 0.24
358 0.23
359 0.18
360 0.21
361 0.21
362 0.21
363 0.21
364 0.19
365 0.18
366 0.22
367 0.24
368 0.22
369 0.22
370 0.21
371 0.27
372 0.3
373 0.31
374 0.28
375 0.26
376 0.34
377 0.4
378 0.48
379 0.44
380 0.47
381 0.52
382 0.5
383 0.49
384 0.44
385 0.42
386 0.4
387 0.39
388 0.34
389 0.27
390 0.27
391 0.25
392 0.22
393 0.16
394 0.11
395 0.11
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.14
401 0.18
402 0.21
403 0.23
404 0.24
405 0.26
406 0.26
407 0.27
408 0.25
409 0.28
410 0.23
411 0.21
412 0.23
413 0.26
414 0.33
415 0.39
416 0.45
417 0.43
418 0.5
419 0.59
420 0.62
421 0.67
422 0.66
423 0.66
424 0.63
425 0.6
426 0.55
427 0.46
428 0.41
429 0.33
430 0.27
431 0.2
432 0.15
433 0.13
434 0.11
435 0.11
436 0.1
437 0.13
438 0.12
439 0.12
440 0.12
441 0.12
442 0.15
443 0.17
444 0.18
445 0.15
446 0.17