Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N7BI23

Protein Details
Accession A0A5N7BI23    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-43IIAERPQKQNQNRGGRRPPQGRRREGVRKSYRDERPBasic
55-80EDDRDSRPSRAPRRPRGDRYSPPPDHBasic
244-263RSPARRPTNGRRQGENRRAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-36RGGRRPPQGRRREGVRK
67-68RR
209-232GARRRRGRRGGGGRYRRSDVSKPA
241-268PGQRSPARRPTNGRRQGENRRAPTTRPK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MDRSLDEIIAERPQKQNQNRGGRRPPQGRRREGVRKSYRDERPDLDLDWVHDKYEDDRDSRPSRAPRRPRGDRYSPPPDHAPTGAKLRVENLHYDITESDLEDLFTRIGPISNLSLVYDRAGRSEGVAYVTYARASDARTAISEFDGANAKGQPIRVTLVSMGGGRRDRNPFDNVEKPKGSLFDRVERPRARDSRSLSPGSGHESGDDGARRRRGRRGGGGRYRRSDVSKPAPDHIDRYVPGQRSPARRPTNGRRQGENRRAPTTRPKKTQEELDQEMDDYWGTANTGSGTVDKETVAAEPQQVASATTAAPGDDDIDMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.51
3 0.59
4 0.62
5 0.71
6 0.76
7 0.8
8 0.83
9 0.82
10 0.84
11 0.85
12 0.85
13 0.85
14 0.87
15 0.85
16 0.81
17 0.82
18 0.83
19 0.81
20 0.82
21 0.82
22 0.79
23 0.78
24 0.81
25 0.8
26 0.75
27 0.72
28 0.65
29 0.61
30 0.56
31 0.5
32 0.44
33 0.37
34 0.33
35 0.34
36 0.31
37 0.24
38 0.22
39 0.22
40 0.21
41 0.28
42 0.28
43 0.25
44 0.27
45 0.35
46 0.38
47 0.4
48 0.45
49 0.46
50 0.53
51 0.61
52 0.68
53 0.71
54 0.78
55 0.85
56 0.87
57 0.86
58 0.86
59 0.84
60 0.82
61 0.82
62 0.74
63 0.68
64 0.64
65 0.57
66 0.5
67 0.44
68 0.38
69 0.3
70 0.35
71 0.33
72 0.28
73 0.26
74 0.26
75 0.28
76 0.26
77 0.26
78 0.23
79 0.23
80 0.22
81 0.22
82 0.19
83 0.17
84 0.16
85 0.14
86 0.12
87 0.09
88 0.1
89 0.09
90 0.1
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.07
132 0.08
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.11
152 0.11
153 0.15
154 0.18
155 0.19
156 0.22
157 0.24
158 0.25
159 0.29
160 0.37
161 0.37
162 0.39
163 0.37
164 0.35
165 0.33
166 0.32
167 0.28
168 0.27
169 0.26
170 0.28
171 0.36
172 0.39
173 0.46
174 0.45
175 0.48
176 0.49
177 0.51
178 0.48
179 0.47
180 0.49
181 0.5
182 0.53
183 0.51
184 0.43
185 0.4
186 0.36
187 0.35
188 0.31
189 0.21
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.17
195 0.14
196 0.18
197 0.25
198 0.28
199 0.31
200 0.38
201 0.43
202 0.48
203 0.56
204 0.62
205 0.65
206 0.72
207 0.79
208 0.77
209 0.74
210 0.7
211 0.63
212 0.58
213 0.52
214 0.5
215 0.5
216 0.52
217 0.5
218 0.5
219 0.52
220 0.48
221 0.47
222 0.41
223 0.36
224 0.28
225 0.31
226 0.33
227 0.3
228 0.3
229 0.34
230 0.37
231 0.41
232 0.47
233 0.52
234 0.53
235 0.57
236 0.64
237 0.68
238 0.73
239 0.75
240 0.74
241 0.72
242 0.74
243 0.79
244 0.81
245 0.8
246 0.74
247 0.72
248 0.69
249 0.66
250 0.68
251 0.68
252 0.67
253 0.67
254 0.68
255 0.69
256 0.72
257 0.78
258 0.76
259 0.74
260 0.69
261 0.64
262 0.58
263 0.5
264 0.45
265 0.35
266 0.25
267 0.16
268 0.11
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.11
278 0.12
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.15
290 0.15
291 0.15
292 0.14
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.11
297 0.09
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.08