Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MB77

Protein Details
Accession C5MB77    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-57RRGSSRSSRHHHPYRSSRRDQDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-215PRSRGPRDRRRDLSPSRRREGPRDGGDRRRGGGDRRGGRHSGRTRPAKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.833, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
KEGG ctp:CTRG_03319  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
Amino Acid Sequences MSDILEQSLDDIIGQKKSNSSSSSNRRFQSRNNRRGSSRSSRHHHPYRSSRRDQDDEDLFSSRSSSRSSSSGIPEKVRLLANNRPTLRIKNIHPDLNGEDLSKLFSNVDDVDFVKFDDDNDTIAYICFQRNCDINNKNSIEKFNGKKAMGNILVVENTVSLFDRINPRSRGPRDRRRDLSPSRRREGPRDGGDRRRGGGDRRGGRHSGRTRPAKKTAEDLDKELNEYMGKTSDSLDAELDDYMKKGNQEEQPEPAANTATTTTTTEGDVMNVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.22
4 0.25
5 0.3
6 0.3
7 0.34
8 0.4
9 0.5
10 0.59
11 0.63
12 0.62
13 0.65
14 0.64
15 0.68
16 0.69
17 0.7
18 0.7
19 0.71
20 0.74
21 0.71
22 0.74
23 0.73
24 0.73
25 0.71
26 0.71
27 0.69
28 0.71
29 0.77
30 0.8
31 0.79
32 0.78
33 0.79
34 0.81
35 0.84
36 0.84
37 0.82
38 0.81
39 0.78
40 0.72
41 0.69
42 0.62
43 0.56
44 0.5
45 0.43
46 0.35
47 0.3
48 0.27
49 0.21
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.16
54 0.18
55 0.2
56 0.23
57 0.28
58 0.34
59 0.35
60 0.35
61 0.35
62 0.34
63 0.34
64 0.31
65 0.27
66 0.25
67 0.3
68 0.35
69 0.41
70 0.4
71 0.41
72 0.42
73 0.44
74 0.45
75 0.44
76 0.4
77 0.42
78 0.46
79 0.45
80 0.43
81 0.42
82 0.38
83 0.35
84 0.32
85 0.22
86 0.18
87 0.14
88 0.16
89 0.13
90 0.11
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.1
117 0.12
118 0.13
119 0.21
120 0.23
121 0.24
122 0.31
123 0.32
124 0.32
125 0.32
126 0.32
127 0.28
128 0.31
129 0.32
130 0.3
131 0.34
132 0.32
133 0.33
134 0.32
135 0.34
136 0.28
137 0.26
138 0.2
139 0.16
140 0.15
141 0.13
142 0.12
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.07
150 0.15
151 0.17
152 0.24
153 0.26
154 0.29
155 0.37
156 0.44
157 0.52
158 0.55
159 0.63
160 0.66
161 0.73
162 0.75
163 0.73
164 0.76
165 0.75
166 0.76
167 0.76
168 0.75
169 0.7
170 0.72
171 0.69
172 0.67
173 0.65
174 0.63
175 0.62
176 0.62
177 0.64
178 0.65
179 0.69
180 0.64
181 0.56
182 0.51
183 0.46
184 0.42
185 0.43
186 0.44
187 0.44
188 0.47
189 0.5
190 0.48
191 0.48
192 0.53
193 0.53
194 0.53
195 0.55
196 0.61
197 0.64
198 0.68
199 0.76
200 0.71
201 0.66
202 0.64
203 0.63
204 0.63
205 0.58
206 0.54
207 0.52
208 0.47
209 0.46
210 0.39
211 0.31
212 0.22
213 0.2
214 0.18
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.13
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.1
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.2
234 0.25
235 0.33
236 0.35
237 0.39
238 0.42
239 0.43
240 0.41
241 0.35
242 0.31
243 0.23
244 0.22
245 0.18
246 0.14
247 0.14
248 0.16
249 0.16
250 0.15
251 0.16
252 0.16
253 0.15