Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M9H6

Protein Details
Accession C5M9H6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
865-884EASRNKEKFSKKKVIENQATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
KEGG ctp:CTRG_02138  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18008  DEXDc_SHPRH-like  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MSNYMSTYAKVVEISNNLDNLIPIGTINVYNLPFETCDLGGGLEAPDGWKWLDLKLLPPNDGNYHHIITLLDFLQSYGFFKLTYRIIKFNEDPMFQICKIRLYSIPSDIEGARFFRDWRQMLKASLKIDKNYIINLDILLKYVDFSSSGWKSNSKMSISEFLHNHDSIFIIDAQKLVKLSIPPIEESKFYIQRWCSGGSVGRYSISTESLDRSFGQRVKDIYNEIRSPNLSKYVHDDIDMKEVTQISSIELRLSKLAMDATKDSVKIPGVKSLVYPYQARSLGVMLERESTVRRSLVPNFIKLKSPISMTEFYFDLYTKQICTKPSLVTLPKGGILAENMGLGKTLICLGLICLTKFEISKIPLDLLLYHEIEIQDSVKSLTKLCREKVAQSSIPWQYYNLPESLKQDLKENPGYFCMQHDIDESFNSAVQPRKRSNNNKNSATLRKLYMCSTSLVVVPDNLFSQWSDEIAKHVDEGYLKVLCLANHIKNKDDTDNVTSIYFSNTVPQDIPFLISYDVILFAQSALSRSINDKQSPIQNIYWKRLIIDEGHSMHSKSSKAAQMCRLLFAERRWAVSGTPTSGLTKLYMEEDNNIDIHLVENEFNAKTDLSKLGTIVSNFLKMEPYYSNPKLWSQEIILPLNKSVYGSELTFKNLLNSIMIRHQPRDINVKLPRFHHEKVVLQPSFHDALSMNLFASVLAVNAVTSERTGVDYMFHPYNRQQLRRLLSNVQRATFYWTGFQQEDVQTLIDICDKALEDDKYNETDIELLKKSKKVALTALRNPRWKMSQMIHELNYYVSNCSMFTSTYGIGTIESKGVGIFGAPQLLSLKEFWTKNEHLTFNSETEFQDKLELNSKEFWARYWQDEASRNKEKFSKKKVIENQATILGMMTKSEPTRDEPTNSEPLQTIVSPPKKKRKVMFADATIPEEEEEEDPFPHEKNSFQMNVDSIKLLGTSSIKLTYLANNLYENQKNKIKSIVFFEFEDSAYYLTELLEIIDVKYILYANFISPIERSKNLKDFSNYDNEKNGGIVLIMNIAHSSHGLNIIAASCIFFINPVKKESIEAQAIKRAHRIGQDKEVTIKTLTLDHVDELKIFGTANTDDNEEVNGDDKLLEFLDLKLDDEGNEFASFAEPIVLFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.26
4 0.25
5 0.24
6 0.23
7 0.19
8 0.16
9 0.1
10 0.07
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.16
22 0.17
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.07
34 0.09
35 0.09
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.18
40 0.18
41 0.24
42 0.32
43 0.35
44 0.34
45 0.36
46 0.39
47 0.37
48 0.4
49 0.38
50 0.34
51 0.33
52 0.3
53 0.29
54 0.25
55 0.22
56 0.22
57 0.18
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.16
69 0.21
70 0.29
71 0.31
72 0.35
73 0.38
74 0.45
75 0.47
76 0.51
77 0.51
78 0.44
79 0.42
80 0.4
81 0.43
82 0.36
83 0.39
84 0.31
85 0.31
86 0.31
87 0.32
88 0.31
89 0.31
90 0.35
91 0.36
92 0.37
93 0.33
94 0.34
95 0.31
96 0.3
97 0.26
98 0.23
99 0.2
100 0.19
101 0.19
102 0.23
103 0.31
104 0.32
105 0.35
106 0.41
107 0.42
108 0.46
109 0.52
110 0.51
111 0.47
112 0.52
113 0.51
114 0.46
115 0.46
116 0.45
117 0.4
118 0.37
119 0.35
120 0.28
121 0.23
122 0.22
123 0.22
124 0.17
125 0.16
126 0.14
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.08
132 0.08
133 0.16
134 0.18
135 0.22
136 0.23
137 0.25
138 0.27
139 0.33
140 0.38
141 0.32
142 0.32
143 0.32
144 0.39
145 0.4
146 0.45
147 0.39
148 0.37
149 0.4
150 0.38
151 0.34
152 0.25
153 0.23
154 0.17
155 0.18
156 0.15
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.19
168 0.21
169 0.21
170 0.25
171 0.26
172 0.24
173 0.27
174 0.32
175 0.33
176 0.32
177 0.37
178 0.34
179 0.37
180 0.39
181 0.37
182 0.3
183 0.27
184 0.32
185 0.28
186 0.3
187 0.26
188 0.24
189 0.22
190 0.23
191 0.22
192 0.19
193 0.16
194 0.14
195 0.17
196 0.17
197 0.18
198 0.17
199 0.19
200 0.24
201 0.25
202 0.27
203 0.27
204 0.29
205 0.31
206 0.33
207 0.35
208 0.35
209 0.39
210 0.39
211 0.36
212 0.37
213 0.36
214 0.36
215 0.33
216 0.35
217 0.29
218 0.27
219 0.33
220 0.36
221 0.34
222 0.33
223 0.33
224 0.26
225 0.32
226 0.31
227 0.24
228 0.2
229 0.2
230 0.19
231 0.18
232 0.16
233 0.11
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.13
242 0.11
243 0.13
244 0.12
245 0.14
246 0.15
247 0.18
248 0.2
249 0.2
250 0.19
251 0.19
252 0.21
253 0.23
254 0.22
255 0.25
256 0.24
257 0.24
258 0.24
259 0.26
260 0.27
261 0.25
262 0.25
263 0.21
264 0.26
265 0.27
266 0.26
267 0.22
268 0.2
269 0.19
270 0.19
271 0.18
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.14
278 0.15
279 0.15
280 0.16
281 0.18
282 0.23
283 0.32
284 0.33
285 0.38
286 0.41
287 0.41
288 0.43
289 0.4
290 0.39
291 0.31
292 0.3
293 0.26
294 0.27
295 0.28
296 0.25
297 0.25
298 0.22
299 0.21
300 0.19
301 0.17
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.16
307 0.18
308 0.19
309 0.24
310 0.25
311 0.25
312 0.28
313 0.34
314 0.32
315 0.32
316 0.32
317 0.28
318 0.26
319 0.24
320 0.2
321 0.14
322 0.12
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.13
346 0.14
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.11
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.12
368 0.17
369 0.24
370 0.29
371 0.3
372 0.37
373 0.36
374 0.4
375 0.45
376 0.47
377 0.41
378 0.38
379 0.44
380 0.4
381 0.4
382 0.35
383 0.29
384 0.25
385 0.26
386 0.26
387 0.2
388 0.17
389 0.18
390 0.21
391 0.25
392 0.25
393 0.22
394 0.25
395 0.27
396 0.32
397 0.37
398 0.35
399 0.3
400 0.3
401 0.3
402 0.26
403 0.24
404 0.22
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.14
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.15
417 0.19
418 0.25
419 0.28
420 0.36
421 0.45
422 0.56
423 0.64
424 0.69
425 0.74
426 0.72
427 0.73
428 0.71
429 0.67
430 0.6
431 0.52
432 0.44
433 0.38
434 0.35
435 0.32
436 0.28
437 0.23
438 0.2
439 0.18
440 0.17
441 0.15
442 0.14
443 0.13
444 0.1
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.06
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.09
467 0.1
468 0.11
469 0.1
470 0.14
471 0.17
472 0.21
473 0.26
474 0.27
475 0.27
476 0.28
477 0.31
478 0.29
479 0.27
480 0.23
481 0.22
482 0.22
483 0.21
484 0.19
485 0.16
486 0.14
487 0.14
488 0.12
489 0.08
490 0.11
491 0.11
492 0.12
493 0.12
494 0.12
495 0.12
496 0.11
497 0.12
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.05
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.09
516 0.15
517 0.18
518 0.19
519 0.2
520 0.21
521 0.26
522 0.28
523 0.29
524 0.26
525 0.29
526 0.31
527 0.34
528 0.34
529 0.29
530 0.27
531 0.24
532 0.22
533 0.17
534 0.17
535 0.18
536 0.17
537 0.19
538 0.19
539 0.18
540 0.18
541 0.18
542 0.16
543 0.12
544 0.15
545 0.17
546 0.18
547 0.22
548 0.26
549 0.3
550 0.3
551 0.31
552 0.27
553 0.25
554 0.25
555 0.22
556 0.26
557 0.2
558 0.21
559 0.2
560 0.2
561 0.19
562 0.2
563 0.2
564 0.13
565 0.14
566 0.13
567 0.12
568 0.12
569 0.13
570 0.1
571 0.09
572 0.08
573 0.09
574 0.1
575 0.09
576 0.1
577 0.11
578 0.11
579 0.11
580 0.1
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.06
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.08
595 0.09
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.1
600 0.12
601 0.11
602 0.12
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.12
607 0.11
608 0.1
609 0.12
610 0.11
611 0.13
612 0.2
613 0.21
614 0.22
615 0.22
616 0.25
617 0.25
618 0.25
619 0.23
620 0.17
621 0.2
622 0.21
623 0.23
624 0.22
625 0.2
626 0.19
627 0.18
628 0.16
629 0.12
630 0.09
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.11
635 0.11
636 0.13
637 0.14
638 0.13
639 0.13
640 0.13
641 0.12
642 0.11
643 0.1
644 0.1
645 0.13
646 0.18
647 0.18
648 0.18
649 0.21
650 0.22
651 0.25
652 0.31
653 0.27
654 0.32
655 0.36
656 0.4
657 0.4
658 0.41
659 0.44
660 0.43
661 0.43
662 0.41
663 0.38
664 0.37
665 0.4
666 0.47
667 0.42
668 0.35
669 0.35
670 0.32
671 0.3
672 0.26
673 0.2
674 0.11
675 0.12
676 0.14
677 0.13
678 0.1
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.06
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.03
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.07
698 0.08
699 0.12
700 0.14
701 0.14
702 0.15
703 0.17
704 0.25
705 0.3
706 0.32
707 0.33
708 0.38
709 0.42
710 0.45
711 0.47
712 0.46
713 0.47
714 0.53
715 0.5
716 0.44
717 0.41
718 0.36
719 0.39
720 0.33
721 0.27
722 0.2
723 0.19
724 0.21
725 0.2
726 0.21
727 0.18
728 0.16
729 0.17
730 0.15
731 0.15
732 0.11
733 0.11
734 0.1
735 0.09
736 0.08
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.08
741 0.12
742 0.13
743 0.13
744 0.16
745 0.18
746 0.18
747 0.19
748 0.18
749 0.14
750 0.15
751 0.14
752 0.16
753 0.16
754 0.17
755 0.2
756 0.22
757 0.24
758 0.25
759 0.26
760 0.24
761 0.31
762 0.37
763 0.42
764 0.49
765 0.58
766 0.6
767 0.63
768 0.62
769 0.58
770 0.52
771 0.46
772 0.42
773 0.36
774 0.39
775 0.41
776 0.45
777 0.42
778 0.39
779 0.37
780 0.32
781 0.3
782 0.22
783 0.15
784 0.11
785 0.1
786 0.1
787 0.11
788 0.11
789 0.09
790 0.09
791 0.11
792 0.11
793 0.11
794 0.11
795 0.1
796 0.1
797 0.11
798 0.1
799 0.08
800 0.07
801 0.07
802 0.06
803 0.06
804 0.05
805 0.04
806 0.05
807 0.05
808 0.07
809 0.06
810 0.07
811 0.08
812 0.09
813 0.1
814 0.09
815 0.11
816 0.15
817 0.16
818 0.17
819 0.23
820 0.25
821 0.3
822 0.35
823 0.35
824 0.3
825 0.35
826 0.36
827 0.3
828 0.29
829 0.25
830 0.19
831 0.21
832 0.2
833 0.15
834 0.17
835 0.17
836 0.17
837 0.24
838 0.25
839 0.24
840 0.26
841 0.27
842 0.27
843 0.26
844 0.25
845 0.25
846 0.26
847 0.27
848 0.29
849 0.3
850 0.32
851 0.4
852 0.44
853 0.44
854 0.51
855 0.48
856 0.48
857 0.53
858 0.57
859 0.59
860 0.63
861 0.65
862 0.61
863 0.71
864 0.77
865 0.8
866 0.78
867 0.71
868 0.65
869 0.57
870 0.52
871 0.42
872 0.32
873 0.23
874 0.15
875 0.12
876 0.1
877 0.1
878 0.1
879 0.12
880 0.14
881 0.18
882 0.24
883 0.27
884 0.29
885 0.31
886 0.36
887 0.42
888 0.41
889 0.37
890 0.31
891 0.29
892 0.27
893 0.23
894 0.22
895 0.23
896 0.32
897 0.39
898 0.47
899 0.57
900 0.64
901 0.71
902 0.74
903 0.75
904 0.76
905 0.78
906 0.78
907 0.72
908 0.72
909 0.65
910 0.61
911 0.5
912 0.41
913 0.31
914 0.23
915 0.19
916 0.12
917 0.12
918 0.11
919 0.11
920 0.13
921 0.14
922 0.14
923 0.15
924 0.15
925 0.14
926 0.17
927 0.23
928 0.24
929 0.24
930 0.26
931 0.26
932 0.27
933 0.27
934 0.23
935 0.17
936 0.14
937 0.13
938 0.11
939 0.11
940 0.1
941 0.1
942 0.12
943 0.13
944 0.13
945 0.14
946 0.15
947 0.17
948 0.2
949 0.21
950 0.2
951 0.21
952 0.22
953 0.28
954 0.33
955 0.31
956 0.33
957 0.38
958 0.38
959 0.38
960 0.44
961 0.41
962 0.38
963 0.43
964 0.43
965 0.39
966 0.39
967 0.4
968 0.33
969 0.3
970 0.29
971 0.21
972 0.16
973 0.13
974 0.12
975 0.1
976 0.08
977 0.08
978 0.06
979 0.06
980 0.07
981 0.07
982 0.07
983 0.09
984 0.09
985 0.08
986 0.09
987 0.09
988 0.08
989 0.1
990 0.1
991 0.09
992 0.13
993 0.13
994 0.13
995 0.14
996 0.19
997 0.22
998 0.27
999 0.31
1000 0.35
1001 0.43
1002 0.45
1003 0.5
1004 0.49
1005 0.49
1006 0.49
1007 0.55
1008 0.51
1009 0.46
1010 0.48
1011 0.43
1012 0.38
1013 0.34
1014 0.29
1015 0.18
1016 0.14
1017 0.12
1018 0.07
1019 0.09
1020 0.08
1021 0.08
1022 0.08
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.07
1028 0.1
1029 0.1
1030 0.1
1031 0.1
1032 0.11
1033 0.11
1034 0.1
1035 0.1
1036 0.08
1037 0.08
1038 0.07
1039 0.08
1040 0.13
1041 0.2
1042 0.23
1043 0.26
1044 0.28
1045 0.28
1046 0.31
1047 0.33
1048 0.35
1049 0.36
1050 0.37
1051 0.38
1052 0.43
1053 0.45
1054 0.44
1055 0.46
1056 0.41
1057 0.37
1058 0.41
1059 0.45
1060 0.44
1061 0.52
1062 0.55
1063 0.52
1064 0.56
1065 0.53
1066 0.47
1067 0.41
1068 0.35
1069 0.26
1070 0.24
1071 0.23
1072 0.2
1073 0.2
1074 0.2
1075 0.22
1076 0.21
1077 0.21
1078 0.18
1079 0.17
1080 0.14
1081 0.12
1082 0.11
1083 0.11
1084 0.12
1085 0.15
1086 0.15
1087 0.17
1088 0.17
1089 0.17
1090 0.18
1091 0.15
1092 0.14
1093 0.13
1094 0.12
1095 0.1
1096 0.1
1097 0.1
1098 0.1
1099 0.1
1100 0.11
1101 0.1
1102 0.1
1103 0.15
1104 0.16
1105 0.16
1106 0.17
1107 0.17
1108 0.16
1109 0.18
1110 0.18
1111 0.15
1112 0.14
1113 0.13
1114 0.12
1115 0.13
1116 0.12
1117 0.1
1118 0.12