Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M9F6

Protein Details
Accession C5M9F6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
679-701TNYFDKDKKPTPRRLALKPEHEAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 3, vacu 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040458  Vid27  
IPR013863  VID27_C  
IPR040979  Vid27_N  
IPR040768  Vid27_PH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG ctp:CTRG_03028  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08553  VID27  
PF17748  VID27_N  
PF17747  VID27_PH  
Amino Acid Sequences MNFLRKFIGTTTTDEVASIPSGKLFLTRSKQSPKGALECLYNDAYASIKQTTSPYYFQLCVTRVYQEGESEFSRFDDSEEEDDLDDSIPTSDSKSQSKDEWVFSISEELKIYKLDKPDGTRAIAWKDLNGDLGDNFEFVIDEEVRNSEVESFMLTIYKCLYESKYHASALGINDMSQLKEFVYNPKMELLTFEDLKDLDDSEEEDEEDEEEEEDDDEEERDTKKDGSEDDEDYDGGSAGAGSGGGKANDSKSFNSQESDVEPKGETKYATKDFDLHLYDADSGTFVLQASKPDVELKLIDLSKWEYTLYIHAKEIRINGAISKNMNPTFNYEHLSFIFNYYTLEKGEIAAYSWLLKFPSFKDLADFQNKFLSLMYETLNKDKWGKNKEQDYFVDAFSKLKVDEETIEEGTELEEEEEDDDDEEEEEEDSDDSRDDTIKWETKDQREKNSNLAIGYSKDRSYVVRGDKVGVFSESDDGQLQFQTAINNLTDLHGKTFNPEKMLLHQQDQFMIMSNPQFNDKSLYKMDLNRGKIVEEWQVSKEVPVKSYAPNSKFAQLTNEQTLTGISSNGLFTIDPRLSGNKLVNDNTYKAYKTTNNQFQTLATTDKGYIALGSGKGDIRLFDRLGVNAKTALPSLGDPIIGIDISKDGRWLLATCKTYLLLIDNKISEGQKNAGKLGFTNYFDKDKKPTPRRLALKPEHEAYIVRENGGKPMTFTPAYFNTGLDSKETTIVTSSGKYVISWSIGKVLLNKPDPYVVKRYTQNVIADNFKFGSNNEVIMALQDDVSMVNRRSLANPKIVFTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.22
4 0.21
5 0.17
6 0.12
7 0.11
8 0.12
9 0.12
10 0.15
11 0.16
12 0.23
13 0.29
14 0.36
15 0.44
16 0.52
17 0.59
18 0.62
19 0.67
20 0.65
21 0.64
22 0.61
23 0.56
24 0.51
25 0.46
26 0.45
27 0.38
28 0.31
29 0.25
30 0.2
31 0.19
32 0.16
33 0.17
34 0.14
35 0.13
36 0.15
37 0.18
38 0.23
39 0.26
40 0.27
41 0.28
42 0.31
43 0.32
44 0.33
45 0.36
46 0.32
47 0.31
48 0.3
49 0.29
50 0.26
51 0.28
52 0.27
53 0.23
54 0.24
55 0.24
56 0.24
57 0.22
58 0.21
59 0.18
60 0.19
61 0.17
62 0.16
63 0.16
64 0.18
65 0.2
66 0.21
67 0.21
68 0.19
69 0.19
70 0.19
71 0.16
72 0.12
73 0.1
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.11
78 0.16
79 0.19
80 0.24
81 0.28
82 0.31
83 0.33
84 0.42
85 0.43
86 0.41
87 0.39
88 0.36
89 0.32
90 0.3
91 0.34
92 0.26
93 0.23
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.2
98 0.22
99 0.19
100 0.23
101 0.27
102 0.31
103 0.36
104 0.43
105 0.45
106 0.46
107 0.44
108 0.44
109 0.42
110 0.42
111 0.37
112 0.3
113 0.29
114 0.27
115 0.26
116 0.22
117 0.19
118 0.13
119 0.16
120 0.14
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.11
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.15
148 0.17
149 0.22
150 0.28
151 0.3
152 0.3
153 0.3
154 0.28
155 0.29
156 0.26
157 0.27
158 0.2
159 0.17
160 0.19
161 0.19
162 0.19
163 0.15
164 0.14
165 0.1
166 0.13
167 0.14
168 0.18
169 0.22
170 0.23
171 0.23
172 0.26
173 0.26
174 0.22
175 0.23
176 0.21
177 0.22
178 0.21
179 0.21
180 0.18
181 0.18
182 0.19
183 0.17
184 0.13
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.19
214 0.22
215 0.23
216 0.23
217 0.23
218 0.21
219 0.19
220 0.18
221 0.12
222 0.08
223 0.06
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.09
235 0.14
236 0.16
237 0.17
238 0.21
239 0.25
240 0.26
241 0.26
242 0.25
243 0.22
244 0.23
245 0.27
246 0.22
247 0.19
248 0.19
249 0.19
250 0.2
251 0.2
252 0.18
253 0.15
254 0.22
255 0.25
256 0.27
257 0.26
258 0.27
259 0.26
260 0.3
261 0.3
262 0.23
263 0.19
264 0.17
265 0.17
266 0.15
267 0.13
268 0.09
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.16
289 0.15
290 0.15
291 0.13
292 0.09
293 0.09
294 0.16
295 0.18
296 0.17
297 0.18
298 0.2
299 0.21
300 0.22
301 0.23
302 0.19
303 0.17
304 0.15
305 0.17
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.21
311 0.21
312 0.22
313 0.2
314 0.22
315 0.25
316 0.25
317 0.26
318 0.21
319 0.21
320 0.21
321 0.23
322 0.18
323 0.15
324 0.14
325 0.1
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.08
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.16
349 0.19
350 0.23
351 0.31
352 0.3
353 0.25
354 0.27
355 0.27
356 0.25
357 0.22
358 0.18
359 0.11
360 0.11
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.19
368 0.22
369 0.28
370 0.29
371 0.35
372 0.4
373 0.47
374 0.49
375 0.49
376 0.47
377 0.44
378 0.4
379 0.34
380 0.29
381 0.21
382 0.19
383 0.14
384 0.14
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.07
389 0.08
390 0.1
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.08
398 0.06
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.08
423 0.12
424 0.16
425 0.18
426 0.25
427 0.3
428 0.38
429 0.48
430 0.49
431 0.53
432 0.56
433 0.57
434 0.55
435 0.54
436 0.47
437 0.37
438 0.34
439 0.26
440 0.21
441 0.22
442 0.18
443 0.14
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.16
448 0.21
449 0.22
450 0.25
451 0.25
452 0.27
453 0.27
454 0.27
455 0.25
456 0.19
457 0.15
458 0.11
459 0.12
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.1
477 0.1
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.15
482 0.22
483 0.22
484 0.22
485 0.23
486 0.22
487 0.24
488 0.33
489 0.32
490 0.29
491 0.31
492 0.29
493 0.28
494 0.28
495 0.23
496 0.16
497 0.15
498 0.12
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.14
503 0.14
504 0.13
505 0.19
506 0.18
507 0.2
508 0.2
509 0.23
510 0.23
511 0.27
512 0.35
513 0.36
514 0.38
515 0.37
516 0.36
517 0.33
518 0.31
519 0.3
520 0.27
521 0.23
522 0.22
523 0.2
524 0.21
525 0.21
526 0.21
527 0.25
528 0.2
529 0.19
530 0.2
531 0.21
532 0.22
533 0.3
534 0.36
535 0.33
536 0.37
537 0.38
538 0.4
539 0.39
540 0.36
541 0.34
542 0.3
543 0.33
544 0.31
545 0.3
546 0.25
547 0.24
548 0.24
549 0.19
550 0.15
551 0.11
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.12
560 0.12
561 0.12
562 0.13
563 0.15
564 0.16
565 0.2
566 0.23
567 0.22
568 0.26
569 0.27
570 0.3
571 0.31
572 0.31
573 0.31
574 0.3
575 0.25
576 0.23
577 0.26
578 0.26
579 0.31
580 0.39
581 0.45
582 0.46
583 0.47
584 0.46
585 0.42
586 0.41
587 0.36
588 0.28
589 0.19
590 0.18
591 0.16
592 0.16
593 0.16
594 0.12
595 0.1
596 0.08
597 0.1
598 0.09
599 0.1
600 0.11
601 0.11
602 0.12
603 0.12
604 0.12
605 0.12
606 0.16
607 0.15
608 0.17
609 0.18
610 0.18
611 0.23
612 0.23
613 0.22
614 0.2
615 0.2
616 0.17
617 0.17
618 0.15
619 0.11
620 0.11
621 0.12
622 0.11
623 0.11
624 0.09
625 0.09
626 0.1
627 0.08
628 0.08
629 0.05
630 0.07
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.08
635 0.09
636 0.1
637 0.11
638 0.14
639 0.2
640 0.23
641 0.23
642 0.24
643 0.24
644 0.23
645 0.22
646 0.22
647 0.19
648 0.2
649 0.22
650 0.21
651 0.22
652 0.24
653 0.24
654 0.22
655 0.2
656 0.22
657 0.22
658 0.23
659 0.25
660 0.23
661 0.23
662 0.22
663 0.25
664 0.26
665 0.26
666 0.29
667 0.3
668 0.36
669 0.37
670 0.39
671 0.4
672 0.43
673 0.51
674 0.57
675 0.64
676 0.66
677 0.75
678 0.79
679 0.82
680 0.84
681 0.82
682 0.82
683 0.77
684 0.7
685 0.62
686 0.55
687 0.47
688 0.41
689 0.4
690 0.32
691 0.27
692 0.28
693 0.26
694 0.3
695 0.31
696 0.27
697 0.21
698 0.23
699 0.27
700 0.25
701 0.25
702 0.26
703 0.27
704 0.31
705 0.29
706 0.26
707 0.23
708 0.25
709 0.25
710 0.21
711 0.2
712 0.17
713 0.2
714 0.2
715 0.18
716 0.17
717 0.18
718 0.18
719 0.17
720 0.17
721 0.16
722 0.16
723 0.15
724 0.15
725 0.16
726 0.18
727 0.18
728 0.18
729 0.2
730 0.21
731 0.22
732 0.26
733 0.29
734 0.34
735 0.38
736 0.38
737 0.35
738 0.41
739 0.44
740 0.43
741 0.46
742 0.41
743 0.44
744 0.48
745 0.51
746 0.49
747 0.51
748 0.51
749 0.47
750 0.47
751 0.47
752 0.42
753 0.4
754 0.36
755 0.31
756 0.27
757 0.23
758 0.26
759 0.2
760 0.2
761 0.18
762 0.17
763 0.16
764 0.17
765 0.18
766 0.11
767 0.1
768 0.09
769 0.08
770 0.08
771 0.11
772 0.16
773 0.15
774 0.18
775 0.2
776 0.22
777 0.27
778 0.36
779 0.38
780 0.42
781 0.43