FuNGI

C5M2F8

Protein Details

Accession

C5M2F8

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-48	TPSSSTASPSKPKPKPQQKESEWQTIP	Hydrophilic
76-96	IKDFTKPVRLHRKDPRNMQFH	Hydrophilic
163-186	PDGGARKNRKNVFKRKTRQINLMD	Hydrophilic
505-524	VASPRKKIKLDDTKIKKEKS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
136-139	KKKE
167-178	ARKNRKNVFKRK
394-409	ARKVDKAGKKLRKVLN
498-532	RKRPSPEVASPRKKIKLDDTKIKKEKSASPVPKAK

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	ctp:CTRG_00247 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSQPEPELKKEVILKKEESSPTPSSSTASPSKPKPKPQQKESEWQTIPLKSCTKEEVDDIRFHIMKFATKQDVDIIKDFTKPVRLHRKDPRNMQFHLTRQELEQRKKEQELAKLERLREQEAEGNPDAVAAEEARKKKEAIAAKIAPEKPTDKNQKDLSQVAPDGGARKNRKNVFKRKTRQINLMDEAKRKLRYEEHYPWVIEDYDGKNVYVGNYEAGSTEQQHVLFVFDKDGFKMIPAEKVYRFTPRNRYATLTLEEAEAKMERNSTVPRWLMKHMEDKSISEGTPDQRFRYNSPAMNGSIIANHTSGRGRMRTVLGGSGSGNDRDSDHDDLDFEEEFADDEEAPIMDGDEEENKLSERKIKKEMLKAAHFDGQSDAEGDDDDLDDLFEIEKARKVDKAGKKLRKVLNKREGAVYDSDDEDVLVPYVSKSDLESDEESEEEVTLKKEPGLEGDSEATKPQRPREVFVKSTGDGFVVVKAPQTFLSTMPPGDWNPNGRKRPSPEVASPRKKIKLDDTKIKKEKSASPVPKAKSPSPSAAAGNASTNGVIDLNNAGPDNLLVTVNDVLDKIRDHPLTTKELLVGLKSRVSAHPENKQRIISIVKQNLRLVDGKLVLKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.48
3	0.57
4	0.56
5	0.51
6	0.5
7	0.47
8	0.45
9	0.44
10	0.41
11	0.34
12	0.32
13	0.34
14	0.34
15	0.37
16	0.4
17	0.47
18	0.57
19	0.63
20	0.72
21	0.77
22	0.81
23	0.85
24	0.88
25	0.9
26	0.86
27	0.88
28	0.85
29	0.84
30	0.74
31	0.69
32	0.64
33	0.59
34	0.55
35	0.51
36	0.49
37	0.41
38	0.43
39	0.41
40	0.4
41	0.36
42	0.39
43	0.42
44	0.4
45	0.41
46	0.4
47	0.42
48	0.39
49	0.37
50	0.36
51	0.28
52	0.3
53	0.3
54	0.35
55	0.35
56	0.34
57	0.35
58	0.37
59	0.41
60	0.39
61	0.38
62	0.36
63	0.31
64	0.33
65	0.33
66	0.28
67	0.32
68	0.3
69	0.37
70	0.44
71	0.48
72	0.56
73	0.65
74	0.74
75	0.75
76	0.84
77	0.83
78	0.78
79	0.75
80	0.72
81	0.69
82	0.64
83	0.63
84	0.55
85	0.46
86	0.42
87	0.5
88	0.52
89	0.53
90	0.55
91	0.54
92	0.57
93	0.59
94	0.63
95	0.59
96	0.58
97	0.6
98	0.59
99	0.62
100	0.61
101	0.59
102	0.58
103	0.55
104	0.5
105	0.42
106	0.37
107	0.34
108	0.31
109	0.36
110	0.31
111	0.29
112	0.25
113	0.23
114	0.2
115	0.14
116	0.12
117	0.07
118	0.11
119	0.16
120	0.19
121	0.22
122	0.24
123	0.24
124	0.26
125	0.33
126	0.36
127	0.36
128	0.43
129	0.44
130	0.47
131	0.54
132	0.53
133	0.47
134	0.42
135	0.39
136	0.34
137	0.41
138	0.48
139	0.42
140	0.48
141	0.53
142	0.55
143	0.56
144	0.55
145	0.48
146	0.43
147	0.4
148	0.33
149	0.27
150	0.23
151	0.21
152	0.22
153	0.27
154	0.27
155	0.33
156	0.42
157	0.48
158	0.57
159	0.64
160	0.72
161	0.74
162	0.79
163	0.83
164	0.85
165	0.89
166	0.84
167	0.83
168	0.79
169	0.77
170	0.71
171	0.7
172	0.64
173	0.56
174	0.55
175	0.5
176	0.46
177	0.39
178	0.38
179	0.36
180	0.37
181	0.43
182	0.47
183	0.48
184	0.49
185	0.48
186	0.45
187	0.4
188	0.34
189	0.25
190	0.21
191	0.17
192	0.18
193	0.19
194	0.18
195	0.16
196	0.16
197	0.16
198	0.13
199	0.12
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.1
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.12
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.11
221	0.1
222	0.14
223	0.12
224	0.15
225	0.17
226	0.2
227	0.2
228	0.23
229	0.24
230	0.29
231	0.31
232	0.32
233	0.41
234	0.45
235	0.49
236	0.47
237	0.5
238	0.45
239	0.46
240	0.41
241	0.33
242	0.25
243	0.21
244	0.2
245	0.16
246	0.14
247	0.1
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.09
253	0.12
254	0.12
255	0.17
256	0.18
257	0.2
258	0.22
259	0.25
260	0.26
261	0.27
262	0.33
263	0.3
264	0.33
265	0.32
266	0.3
267	0.31
268	0.29
269	0.26
270	0.18
271	0.19
272	0.17
273	0.23
274	0.23
275	0.21
276	0.24
277	0.26
278	0.27
279	0.32
280	0.33
281	0.28
282	0.29
283	0.3
284	0.26
285	0.25
286	0.23
287	0.16
288	0.12
289	0.11
290	0.1
291	0.07
292	0.07
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.11
297	0.11
298	0.11
299	0.13
300	0.14
301	0.14
302	0.14
303	0.14
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.1
308	0.1
309	0.09
310	0.09
311	0.08
312	0.08
313	0.1
314	0.13
315	0.13
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.14
321	0.11
322	0.08
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.03
336	0.03
337	0.04
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.15
346	0.19
347	0.23
348	0.3
349	0.37
350	0.42
351	0.49
352	0.57
353	0.57
354	0.56
355	0.53
356	0.49
357	0.47
358	0.41
359	0.34
360	0.28
361	0.21
362	0.17
363	0.15
364	0.12
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.05
378	0.06
379	0.1
380	0.11
381	0.12
382	0.14
383	0.17
384	0.26
385	0.33
386	0.43
387	0.5
388	0.58
389	0.63
390	0.7
391	0.74
392	0.75
393	0.77
394	0.77
395	0.77
396	0.73
397	0.68
398	0.64
399	0.57
400	0.49
401	0.42
402	0.33
403	0.24
404	0.2
405	0.18
406	0.14
407	0.13
408	0.11
409	0.09
410	0.07
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.05
417	0.06
418	0.09
419	0.1
420	0.14
421	0.15
422	0.16
423	0.17
424	0.17
425	0.16
426	0.13
427	0.12
428	0.09
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.09
433	0.1
434	0.11
435	0.11
436	0.14
437	0.15
438	0.15
439	0.15
440	0.17
441	0.18
442	0.17
443	0.18
444	0.17
445	0.2
446	0.23
447	0.26
448	0.34
449	0.34
450	0.39
451	0.45
452	0.51
453	0.49
454	0.51
455	0.51
456	0.42
457	0.41
458	0.36
459	0.28
460	0.21
461	0.19
462	0.15
463	0.12
464	0.11
465	0.12
466	0.12
467	0.13
468	0.13
469	0.15
470	0.14
471	0.14
472	0.19
473	0.18
474	0.18
475	0.18
476	0.2
477	0.18
478	0.22
479	0.24
480	0.26
481	0.33
482	0.43
483	0.48
484	0.49
485	0.56
486	0.58
487	0.64
488	0.64
489	0.62
490	0.61
491	0.66
492	0.73
493	0.74
494	0.74
495	0.73
496	0.73
497	0.69
498	0.64
499	0.65
500	0.65
501	0.65
502	0.7
503	0.71
504	0.75
505	0.81
506	0.78
507	0.72
508	0.66
509	0.66
510	0.63
511	0.65
512	0.62
513	0.63
514	0.7
515	0.69
516	0.69
517	0.67
518	0.64
519	0.61
520	0.58
521	0.54
522	0.5
523	0.5
524	0.45
525	0.41
526	0.38
527	0.31
528	0.27
529	0.22
530	0.18
531	0.15
532	0.13
533	0.11
534	0.09
535	0.08
536	0.07
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.11
541	0.1
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.09
546	0.08
547	0.07
548	0.09
549	0.11
550	0.11
551	0.11
552	0.1
553	0.1
554	0.11
555	0.13
556	0.14
557	0.21
558	0.22
559	0.24
560	0.3
561	0.34
562	0.39
563	0.39
564	0.38
565	0.31
566	0.33
567	0.31
568	0.28
569	0.27
570	0.22
571	0.23
572	0.23
573	0.25
574	0.25
575	0.32
576	0.38
577	0.41
578	0.49
579	0.57
580	0.63
581	0.65
582	0.64
583	0.57
584	0.53
585	0.53
586	0.51
587	0.52
588	0.54
589	0.55
590	0.58
591	0.6
592	0.56
593	0.53
594	0.48
595	0.4
596	0.36
597	0.36

C5M2F8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer