Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MHZ3

Protein Details
Accession C5MHZ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-143SVGKYTKIKKPKFPKSNKIKGGSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-140KIKKPKFPKSNKIKG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 9.5, cyto 8.5, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ctp:CTRG_05686  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSTFKRLFPAPPPTTNAWSINQLINITNNDHHNKSPHEKAHSSDSDDSFSSDDDIEIISGQLKSISTPHSPISPSIKDCTTAATTALFSAPFSEKSNPNSYTKAQESGYCNGDDEEVLVSVGKYTKIKKPKFPKSNKIKGGSGHYKYKITDNTKDLPPFIINTNSPCYSEHSPISPEYQFTATSSPFIDSTASSPLVHTPLRPQTPQTVSAPHSLPLPIAPAPPPPSPSVVVYPQFGIPVYHISMISKPPVSPHPVPSSPVIQQPISPKGNVSVKKENIKRQIEYYFSTENLCKDTYLRSLFNKNDGSVKLDQLLEFNRMKILTKNGKYTNLLLESIEEIPVLELVDNECTSFRLKNWQAWVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.56
3 0.52
4 0.43
5 0.42
6 0.4
7 0.37
8 0.33
9 0.3
10 0.27
11 0.27
12 0.26
13 0.25
14 0.26
15 0.3
16 0.33
17 0.35
18 0.36
19 0.38
20 0.43
21 0.47
22 0.52
23 0.52
24 0.55
25 0.55
26 0.55
27 0.6
28 0.56
29 0.55
30 0.53
31 0.48
32 0.42
33 0.4
34 0.38
35 0.29
36 0.25
37 0.2
38 0.14
39 0.12
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.11
52 0.15
53 0.15
54 0.18
55 0.19
56 0.22
57 0.23
58 0.26
59 0.31
60 0.32
61 0.32
62 0.34
63 0.33
64 0.31
65 0.29
66 0.3
67 0.24
68 0.2
69 0.18
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.1
75 0.08
76 0.1
77 0.12
78 0.12
79 0.16
80 0.2
81 0.23
82 0.28
83 0.35
84 0.35
85 0.36
86 0.39
87 0.37
88 0.4
89 0.38
90 0.37
91 0.3
92 0.32
93 0.34
94 0.34
95 0.34
96 0.27
97 0.25
98 0.22
99 0.21
100 0.16
101 0.12
102 0.09
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.1
111 0.13
112 0.21
113 0.31
114 0.37
115 0.45
116 0.55
117 0.65
118 0.73
119 0.8
120 0.83
121 0.83
122 0.89
123 0.87
124 0.81
125 0.73
126 0.65
127 0.64
128 0.63
129 0.56
130 0.53
131 0.47
132 0.44
133 0.42
134 0.44
135 0.43
136 0.4
137 0.41
138 0.39
139 0.41
140 0.43
141 0.43
142 0.38
143 0.32
144 0.27
145 0.22
146 0.19
147 0.17
148 0.14
149 0.16
150 0.19
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.21
155 0.21
156 0.23
157 0.22
158 0.2
159 0.21
160 0.2
161 0.23
162 0.18
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.07
177 0.08
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.14
187 0.2
188 0.23
189 0.23
190 0.24
191 0.28
192 0.31
193 0.33
194 0.3
195 0.28
196 0.27
197 0.3
198 0.29
199 0.23
200 0.21
201 0.18
202 0.16
203 0.12
204 0.13
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.17
210 0.18
211 0.2
212 0.19
213 0.2
214 0.21
215 0.22
216 0.22
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.21
221 0.19
222 0.17
223 0.16
224 0.13
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.14
233 0.16
234 0.14
235 0.13
236 0.15
237 0.19
238 0.25
239 0.26
240 0.3
241 0.35
242 0.35
243 0.37
244 0.37
245 0.37
246 0.32
247 0.34
248 0.31
249 0.24
250 0.26
251 0.29
252 0.34
253 0.32
254 0.3
255 0.26
256 0.29
257 0.36
258 0.38
259 0.41
260 0.42
261 0.46
262 0.55
263 0.62
264 0.65
265 0.67
266 0.68
267 0.63
268 0.59
269 0.58
270 0.52
271 0.49
272 0.45
273 0.37
274 0.32
275 0.32
276 0.29
277 0.25
278 0.25
279 0.22
280 0.17
281 0.16
282 0.19
283 0.23
284 0.26
285 0.28
286 0.3
287 0.38
288 0.4
289 0.46
290 0.45
291 0.4
292 0.41
293 0.38
294 0.39
295 0.33
296 0.33
297 0.29
298 0.27
299 0.26
300 0.23
301 0.25
302 0.25
303 0.24
304 0.22
305 0.22
306 0.21
307 0.23
308 0.23
309 0.31
310 0.36
311 0.4
312 0.48
313 0.5
314 0.55
315 0.56
316 0.55
317 0.53
318 0.46
319 0.41
320 0.33
321 0.3
322 0.27
323 0.25
324 0.22
325 0.14
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.06
331 0.06
332 0.08
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.15
339 0.17
340 0.17
341 0.24
342 0.29
343 0.35