Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDF8

Protein Details
Accession C5MDF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-24ASLFNSKQMKSRKNLKNLTISGHydrophilic
519-538QISPLKIRPRRKSSVCSPLKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001683  PX_dom  
IPR036871  PX_dom_sf  
IPR036028  SH3-like_dom_sf  
IPR001452  SH3_domain  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
KEGG ctp:CTRG_04259  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00787  PX  
PF00018  SH3_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50195  PX  
PS50002  SH3  
Amino Acid Sequences MSASLFNSKQMKSRKNLKNLTISGPLTLEQPGNVRIITSSNPASPVIPSSIDNNDHVVILVCKYDFNAESENELSVKHNQYLKLVQKLGNGWILVCDLEDKSIQGLVPASYLDIAINDPLNPITLSWLREITNAAHQKTAIESIEDVVIDQVFQNLKDKNFWYKLQFKVDHQFIYVGKTYHDLYELHCKLVPKFLSQLPKLPPPVLRTSYYHSQSSKFDRKLIEKLYTLAQELQEYMKKLLEIPEILIESTDLYEFVHNCPQVIKTQSTVSNEELINQLYPSSIVIEDYRTQNSMKFSTTEPLPPPSPALSLSMEKNSRIFRLPDQYVKYSTYINQQNATRNYVHSHGESGSSNHSSLTNGSEDQNAATPRCPATTDDEDKEVLSHTNNTSRSSCNSSLSNSAEYSTDTAGTSFDENPKQDDESELPMPEEISLSHPQPPRPSIASTYSIHQSQVRISSPRSNSFQSESSESIFDRHMSTTSSTTSVTTPTTIQSETFEKALNNVISELDEFEFSSEAQISPLKIRPRRKSSVCSPLKNCQEYIKIKVFLNNKSQDIIALKIKRSNLISLEYLKKLISFKMYNDYSLYKHFNLSVHDSKETLNDDELLQHIKENLKVKLSLSRTRC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.73
3 0.81
4 0.81
5 0.81
6 0.77
7 0.74
8 0.71
9 0.62
10 0.52
11 0.45
12 0.38
13 0.28
14 0.26
15 0.21
16 0.14
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.17
21 0.16
22 0.14
23 0.16
24 0.18
25 0.2
26 0.21
27 0.21
28 0.23
29 0.23
30 0.23
31 0.22
32 0.22
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.19
37 0.24
38 0.26
39 0.26
40 0.26
41 0.24
42 0.22
43 0.22
44 0.19
45 0.15
46 0.13
47 0.14
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.15
52 0.14
53 0.16
54 0.19
55 0.18
56 0.22
57 0.22
58 0.23
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.21
63 0.24
64 0.26
65 0.29
66 0.29
67 0.34
68 0.42
69 0.46
70 0.47
71 0.47
72 0.45
73 0.45
74 0.46
75 0.45
76 0.39
77 0.33
78 0.24
79 0.21
80 0.19
81 0.15
82 0.13
83 0.11
84 0.08
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.12
111 0.14
112 0.16
113 0.17
114 0.19
115 0.19
116 0.2
117 0.22
118 0.19
119 0.25
120 0.3
121 0.29
122 0.28
123 0.27
124 0.27
125 0.27
126 0.28
127 0.19
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.11
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.13
142 0.16
143 0.17
144 0.21
145 0.24
146 0.3
147 0.34
148 0.37
149 0.39
150 0.44
151 0.49
152 0.54
153 0.55
154 0.5
155 0.54
156 0.55
157 0.48
158 0.41
159 0.38
160 0.29
161 0.31
162 0.29
163 0.2
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.17
169 0.13
170 0.14
171 0.24
172 0.25
173 0.24
174 0.25
175 0.26
176 0.25
177 0.32
178 0.3
179 0.21
180 0.24
181 0.28
182 0.34
183 0.34
184 0.4
185 0.37
186 0.42
187 0.41
188 0.4
189 0.39
190 0.35
191 0.41
192 0.38
193 0.36
194 0.33
195 0.37
196 0.43
197 0.43
198 0.42
199 0.37
200 0.36
201 0.38
202 0.44
203 0.47
204 0.41
205 0.42
206 0.42
207 0.45
208 0.49
209 0.49
210 0.44
211 0.35
212 0.35
213 0.34
214 0.3
215 0.27
216 0.22
217 0.18
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.16
228 0.15
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.04
240 0.04
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.16
250 0.19
251 0.18
252 0.15
253 0.19
254 0.22
255 0.24
256 0.26
257 0.24
258 0.24
259 0.23
260 0.22
261 0.2
262 0.17
263 0.14
264 0.11
265 0.1
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.08
274 0.1
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.14
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.17
286 0.17
287 0.19
288 0.18
289 0.2
290 0.2
291 0.19
292 0.19
293 0.17
294 0.16
295 0.13
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.17
301 0.17
302 0.17
303 0.19
304 0.17
305 0.17
306 0.18
307 0.18
308 0.17
309 0.24
310 0.26
311 0.29
312 0.32
313 0.32
314 0.32
315 0.32
316 0.29
317 0.23
318 0.22
319 0.24
320 0.26
321 0.26
322 0.27
323 0.28
324 0.34
325 0.35
326 0.37
327 0.3
328 0.25
329 0.26
330 0.25
331 0.24
332 0.17
333 0.17
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.14
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.12
358 0.13
359 0.14
360 0.12
361 0.18
362 0.24
363 0.28
364 0.28
365 0.29
366 0.29
367 0.27
368 0.26
369 0.2
370 0.14
371 0.1
372 0.12
373 0.12
374 0.17
375 0.19
376 0.21
377 0.23
378 0.24
379 0.26
380 0.3
381 0.3
382 0.27
383 0.27
384 0.26
385 0.29
386 0.29
387 0.28
388 0.21
389 0.2
390 0.17
391 0.16
392 0.16
393 0.12
394 0.1
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.1
400 0.1
401 0.14
402 0.16
403 0.17
404 0.19
405 0.2
406 0.2
407 0.19
408 0.2
409 0.18
410 0.19
411 0.21
412 0.19
413 0.17
414 0.16
415 0.16
416 0.14
417 0.12
418 0.07
419 0.1
420 0.12
421 0.13
422 0.2
423 0.23
424 0.25
425 0.29
426 0.31
427 0.31
428 0.31
429 0.33
430 0.3
431 0.31
432 0.34
433 0.3
434 0.31
435 0.3
436 0.28
437 0.27
438 0.25
439 0.21
440 0.19
441 0.23
442 0.23
443 0.23
444 0.25
445 0.32
446 0.35
447 0.4
448 0.41
449 0.39
450 0.39
451 0.4
452 0.4
453 0.35
454 0.35
455 0.31
456 0.28
457 0.26
458 0.24
459 0.21
460 0.19
461 0.17
462 0.14
463 0.14
464 0.13
465 0.14
466 0.16
467 0.16
468 0.17
469 0.18
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.15
475 0.14
476 0.13
477 0.14
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.16
482 0.18
483 0.19
484 0.19
485 0.18
486 0.16
487 0.17
488 0.22
489 0.2
490 0.17
491 0.16
492 0.15
493 0.15
494 0.15
495 0.16
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.1
500 0.1
501 0.09
502 0.1
503 0.09
504 0.08
505 0.09
506 0.11
507 0.12
508 0.15
509 0.21
510 0.29
511 0.35
512 0.45
513 0.54
514 0.62
515 0.7
516 0.73
517 0.76
518 0.77
519 0.8
520 0.8
521 0.79
522 0.76
523 0.76
524 0.78
525 0.72
526 0.64
527 0.59
528 0.59
529 0.54
530 0.56
531 0.54
532 0.49
533 0.47
534 0.52
535 0.52
536 0.49
537 0.54
538 0.52
539 0.46
540 0.43
541 0.42
542 0.39
543 0.35
544 0.33
545 0.32
546 0.32
547 0.33
548 0.36
549 0.37
550 0.39
551 0.39
552 0.4
553 0.34
554 0.33
555 0.35
556 0.37
557 0.41
558 0.37
559 0.36
560 0.32
561 0.31
562 0.28
563 0.28
564 0.29
565 0.26
566 0.27
567 0.36
568 0.37
569 0.36
570 0.38
571 0.38
572 0.32
573 0.36
574 0.39
575 0.31
576 0.31
577 0.33
578 0.32
579 0.34
580 0.4
581 0.41
582 0.4
583 0.4
584 0.39
585 0.37
586 0.39
587 0.38
588 0.32
589 0.25
590 0.23
591 0.21
592 0.22
593 0.23
594 0.22
595 0.18
596 0.17
597 0.19
598 0.21
599 0.27
600 0.31
601 0.33
602 0.34
603 0.36
604 0.36
605 0.41
606 0.45