Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M7C4

Protein Details
Accession C5M7C4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-367EQLKAEKKAAERRQKKMQKKQRIKMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-367KLKREERDRLRNMSREEQLKAEKKAAERRQKKMQKKQRIKM
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG ctp:CTRG_01756  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MIYETLNRLLPLFAQESTKDYTLEQLNAMTVWQRLQIRDWRLEIFTMGFIAIFVFLFKAGDLYNKSKVTGFLSGISEVMNKQFYQFGVSPNQLYIKDSSENYSSYATGRVNIASVQINFTLVPRYNVFLWILESGFSFFSSNVKAPEDTVDIVITPSGHYDNFITAIVSKLGMNDARKFNYFLSLCKTSDSPNLPESFVYMSEANEFQEKTTTNELKNSLNLQIANVVKFIALTDQPVEKPESLREFMPNRKVIISLKATTSKKDLKQISAILEAVFNLVDKLVDTAITFRPEAVKRVVKTREAEIEKLKKIQEEARKEELAEEQAKLKREERDRLRNMSREEQLKAEKKAAERRQKKMQKKQRIKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.22
4 0.26
5 0.26
6 0.22
7 0.2
8 0.25
9 0.26
10 0.27
11 0.24
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.19
16 0.15
17 0.12
18 0.11
19 0.16
20 0.18
21 0.19
22 0.25
23 0.32
24 0.37
25 0.41
26 0.43
27 0.41
28 0.39
29 0.38
30 0.34
31 0.27
32 0.21
33 0.16
34 0.13
35 0.1
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.1
48 0.15
49 0.2
50 0.26
51 0.27
52 0.28
53 0.28
54 0.3
55 0.29
56 0.28
57 0.25
58 0.22
59 0.23
60 0.22
61 0.21
62 0.2
63 0.17
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.13
70 0.13
71 0.18
72 0.19
73 0.2
74 0.24
75 0.25
76 0.25
77 0.24
78 0.27
79 0.21
80 0.22
81 0.2
82 0.18
83 0.19
84 0.2
85 0.21
86 0.2
87 0.21
88 0.2
89 0.2
90 0.17
91 0.15
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.14
108 0.12
109 0.14
110 0.13
111 0.15
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.08
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.07
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.07
159 0.09
160 0.1
161 0.14
162 0.17
163 0.18
164 0.19
165 0.2
166 0.19
167 0.24
168 0.22
169 0.19
170 0.22
171 0.24
172 0.23
173 0.22
174 0.23
175 0.18
176 0.23
177 0.25
178 0.22
179 0.21
180 0.22
181 0.21
182 0.21
183 0.2
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.2
199 0.23
200 0.22
201 0.25
202 0.27
203 0.26
204 0.27
205 0.26
206 0.2
207 0.19
208 0.19
209 0.15
210 0.18
211 0.18
212 0.16
213 0.14
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.12
225 0.15
226 0.13
227 0.14
228 0.18
229 0.21
230 0.21
231 0.21
232 0.26
233 0.29
234 0.34
235 0.4
236 0.39
237 0.35
238 0.34
239 0.35
240 0.31
241 0.33
242 0.32
243 0.25
244 0.26
245 0.33
246 0.34
247 0.34
248 0.39
249 0.39
250 0.38
251 0.45
252 0.46
253 0.41
254 0.45
255 0.46
256 0.42
257 0.37
258 0.34
259 0.25
260 0.22
261 0.18
262 0.14
263 0.11
264 0.07
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.09
274 0.12
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.2
279 0.21
280 0.25
281 0.29
282 0.33
283 0.33
284 0.42
285 0.46
286 0.45
287 0.47
288 0.48
289 0.51
290 0.48
291 0.5
292 0.51
293 0.54
294 0.52
295 0.54
296 0.5
297 0.43
298 0.42
299 0.46
300 0.46
301 0.47
302 0.51
303 0.53
304 0.53
305 0.5
306 0.49
307 0.44
308 0.41
309 0.34
310 0.28
311 0.28
312 0.31
313 0.34
314 0.36
315 0.37
316 0.39
317 0.45
318 0.54
319 0.57
320 0.65
321 0.68
322 0.75
323 0.78
324 0.77
325 0.76
326 0.74
327 0.71
328 0.65
329 0.6
330 0.57
331 0.59
332 0.59
333 0.56
334 0.53
335 0.51
336 0.53
337 0.61
338 0.65
339 0.66
340 0.68
341 0.72
342 0.78
343 0.84
344 0.87
345 0.88
346 0.89
347 0.89