FuNGI

A0A5N7ATG0

Protein Details

Accession

A0A5N7ATG0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-50	YNAYRAHTTRKLHKLRKKLGQTTPKGRKYTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-47	KLHKLRKKLGQTTPKGRK
384-399	KGSVKREEAKGKKLAR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR
CDD	cd15481 SRP68-RBD

Amino Acid Sequences

MDITDYIFNQREEVLLAGDYNAYRAHTTRKLHKLRKKLGQTTPKGRKYTAKPPVSAENVSGNAAYVHTLLLSSERAWAQALQMKSAHSADPSAKGITGAARRHIISRLHKSAGYANELVLLLQNQASGATDNDLLEARAYHATLSGALSLEKRKWEQCMQDFSVSRVIYAALGQNNKKDAFRDLLSGTVDPSLRYAAYQMKLPRSKPLPSLAISFFPSDTKLRSEVEKVDPNCLKEDAAGTRRTADGDVQQLPDTITWRSRTVALEDAAISQALAAAAAAESRLASWLADASGKSASSKDKAAAYDNVIIASQDAVDATKSAIDDLVSEGVDPSDKRMQSLQITRTAVNFALVGWRVGRNRVLCGEHDGDLGDTDQVNAAKGTKGSVKREEAKGKKLARLRERVVLYDSTLQSIEFILELPGVAADSAFVQELGAKRSYFRALRCLTIGRSHSILGKYQNALALFSQALALSQESASVAQPTAAAEEPPKLDITRGQAQALESTLQALVSQYRGLVTLEKISEQQSKSASERPMVERLHEYPGDRLDLKNLVPYPPQMQPVPVKPLFLDVAWNYIDYPRERPSTQDATPVSTEPIAEEKQGGRRGWFSFGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.11
3	0.11
4	0.1
5	0.12
6	0.11
7	0.11
8	0.11
9	0.11
10	0.12
11	0.14
12	0.22
13	0.28
14	0.35
15	0.44
16	0.54
17	0.64
18	0.72
19	0.8
20	0.83
21	0.85
22	0.89
23	0.89
24	0.88
25	0.88
26	0.88
27	0.89
28	0.89
29	0.9
30	0.88
31	0.81
32	0.75
33	0.74
34	0.71
35	0.72
36	0.71
37	0.68
38	0.62
39	0.63
40	0.68
41	0.64
42	0.57
43	0.48
44	0.43
45	0.37
46	0.35
47	0.3
48	0.22
49	0.17
50	0.15
51	0.14
52	0.09
53	0.07
54	0.06
55	0.06
56	0.06
57	0.08
58	0.09
59	0.09
60	0.12
61	0.13
62	0.13
63	0.15
64	0.15
65	0.17
66	0.21
67	0.21
68	0.2
69	0.21
70	0.22
71	0.23
72	0.24
73	0.22
74	0.16
75	0.19
76	0.19
77	0.22
78	0.23
79	0.21
80	0.19
81	0.18
82	0.18
83	0.21
84	0.26
85	0.24
86	0.25
87	0.28
88	0.28
89	0.3
90	0.35
91	0.37
92	0.4
93	0.47
94	0.49
95	0.49
96	0.49
97	0.48
98	0.49
99	0.45
100	0.41
101	0.32
102	0.26
103	0.25
104	0.24
105	0.22
106	0.17
107	0.14
108	0.09
109	0.09
110	0.09
111	0.06
112	0.06
113	0.07
114	0.07
115	0.07
116	0.08
117	0.09
118	0.09
119	0.1
120	0.1
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.08
128	0.09
129	0.09
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.09
135	0.11
136	0.13
137	0.15
138	0.18
139	0.21
140	0.22
141	0.28
142	0.33
143	0.4
144	0.44
145	0.5
146	0.5
147	0.53
148	0.52
149	0.48
150	0.49
151	0.39
152	0.32
153	0.24
154	0.21
155	0.14
156	0.14
157	0.16
158	0.13
159	0.18
160	0.19
161	0.22
162	0.25
163	0.26
164	0.26
165	0.23
166	0.23
167	0.23
168	0.22
169	0.23
170	0.21
171	0.22
172	0.23
173	0.21
174	0.18
175	0.16
176	0.15
177	0.12
178	0.12
179	0.1
180	0.09
181	0.09
182	0.11
183	0.14
184	0.15
185	0.19
186	0.23
187	0.31
188	0.35
189	0.36
190	0.41
191	0.4
192	0.42
193	0.41
194	0.42
195	0.38
196	0.34
197	0.38
198	0.32
199	0.3
200	0.28
201	0.25
202	0.2
203	0.17
204	0.17
205	0.14
206	0.14
207	0.14
208	0.15
209	0.16
210	0.17
211	0.2
212	0.22
213	0.28
214	0.33
215	0.32
216	0.37
217	0.38
218	0.37
219	0.36
220	0.32
221	0.26
222	0.19
223	0.21
224	0.18
225	0.2
226	0.21
227	0.19
228	0.19
229	0.2
230	0.2
231	0.18
232	0.14
233	0.13
234	0.16
235	0.17
236	0.17
237	0.17
238	0.16
239	0.16
240	0.15
241	0.14
242	0.11
243	0.12
244	0.13
245	0.14
246	0.14
247	0.16
248	0.17
249	0.18
250	0.2
251	0.17
252	0.16
253	0.15
254	0.15
255	0.13
256	0.11
257	0.09
258	0.05
259	0.05
260	0.04
261	0.03
262	0.02
263	0.02
264	0.02
265	0.02
266	0.02
267	0.02
268	0.02
269	0.02
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.07
281	0.07
282	0.08
283	0.1
284	0.1
285	0.11
286	0.12
287	0.13
288	0.14
289	0.17
290	0.17
291	0.18
292	0.19
293	0.18
294	0.17
295	0.14
296	0.13
297	0.1
298	0.09
299	0.06
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.06
320	0.08
321	0.13
322	0.13
323	0.14
324	0.15
325	0.18
326	0.22
327	0.29
328	0.28
329	0.29
330	0.31
331	0.3
332	0.3
333	0.28
334	0.23
335	0.17
336	0.14
337	0.08
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.11
343	0.11
344	0.13
345	0.17
346	0.15
347	0.17
348	0.2
349	0.21
350	0.19
351	0.23
352	0.24
353	0.2
354	0.2
355	0.18
356	0.15
357	0.13
358	0.13
359	0.08
360	0.06
361	0.05
362	0.06
363	0.06
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.09
370	0.14
371	0.19
372	0.23
373	0.29
374	0.34
375	0.39
376	0.46
377	0.55
378	0.53
379	0.55
380	0.58
381	0.56
382	0.56
383	0.56
384	0.57
385	0.56
386	0.59
387	0.56
388	0.55
389	0.53
390	0.48
391	0.47
392	0.39
393	0.32
394	0.3
395	0.27
396	0.21
397	0.2
398	0.17
399	0.15
400	0.14
401	0.12
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.06
419	0.08
420	0.11
421	0.13
422	0.12
423	0.13
424	0.16
425	0.22
426	0.23
427	0.24
428	0.3
429	0.3
430	0.32
431	0.34
432	0.34
433	0.31
434	0.33
435	0.34
436	0.27
437	0.27
438	0.25
439	0.27
440	0.26
441	0.27
442	0.24
443	0.26
444	0.25
445	0.25
446	0.26
447	0.22
448	0.22
449	0.19
450	0.17
451	0.12
452	0.12
453	0.11
454	0.08
455	0.08
456	0.07
457	0.07
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.07
467	0.08
468	0.08
469	0.1
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.12
474	0.13
475	0.14
476	0.15
477	0.13
478	0.13
479	0.16
480	0.22
481	0.27
482	0.28
483	0.27
484	0.28
485	0.28
486	0.29
487	0.27
488	0.21
489	0.12
490	0.12
491	0.11
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.08
499	0.08
500	0.09
501	0.1
502	0.11
503	0.12
504	0.16
505	0.16
506	0.17
507	0.18
508	0.22
509	0.28
510	0.26
511	0.29
512	0.26
513	0.3
514	0.32
515	0.38
516	0.36
517	0.33
518	0.38
519	0.39
520	0.44
521	0.41
522	0.4
523	0.39
524	0.39
525	0.41
526	0.38
527	0.35
528	0.31
529	0.33
530	0.34
531	0.3
532	0.28
533	0.26
534	0.27
535	0.26
536	0.29
537	0.28
538	0.26
539	0.27
540	0.3
541	0.3
542	0.31
543	0.35
544	0.29
545	0.32
546	0.36
547	0.4
548	0.46
549	0.43
550	0.39
551	0.35
552	0.39
553	0.35
554	0.28
555	0.28
556	0.2
557	0.23
558	0.22
559	0.22
560	0.18
561	0.19
562	0.24
563	0.21
564	0.25
565	0.27
566	0.33
567	0.33
568	0.37
569	0.43
570	0.45
571	0.44
572	0.47
573	0.43
574	0.42
575	0.44
576	0.41
577	0.35
578	0.28
579	0.27
580	0.2
581	0.24
582	0.2
583	0.19
584	0.21
585	0.23
586	0.3
587	0.37
588	0.37
589	0.35
590	0.38
591	0.4

A0A5N7ATG0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer