FuNGI

C5M4V2

Protein Details

Accession

C5M4V2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1182-1222	GTTTRKRTSTQRGQRSQEGNKRRKTGSRKPSQSSAKSNKAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1193-1212	RGQRSQEGNKRRKTGSRKPS

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR002464 DNA/RNA_helicase_DEAH_CS IPR004589 DNA_helicase_ATP-dep_RecQ IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR032284 RecQ_Zn-bd IPR018982 RQC_domain IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0031422 C:RecQ family helicase-topoisomerase III complex GO:0043138 F:3'-5' DNA helicase activity GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006265 P:DNA topological change GO:0006268 P:DNA unwinding involved in DNA replication GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination GO:0007534 P:gene conversion at mating-type locus GO:0045132 P:meiotic chromosome segregation GO:0000706 P:meiotic DNA double-strand break processing GO:0044818 P:mitotic G2/M transition checkpoint GO:0031573 P:mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling GO:0000070 P:mitotic sister chromatid segregation GO:0010947 P:negative regulation of meiotic joint molecule formation GO:0010520 P:regulation of reciprocal meiotic recombination GO:0000722 P:telomere maintenance via recombination GO:0031860 P:telomeric 3' overhang formation
KEGG	ctp:CTRG_01930 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C PF16124 RecQ_Zn_bind PF09382 RQC
PROSITE	View protein in PROSITE PS00690 DEAH_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17920 DEXHc_RecQ cd18794 SF2_C_RecQ

Amino Acid Sequences

MITNINEQVKWIKRTKPYIIPTNKLDLIRKKYPKDAITPTSTPITNNGVVQVPNSLPPSSIPTPDIPRQLPPEPQPQPQPQPQQSMNTANKENMLSSFTFTSSSISSKPPSRQIQSTLPLRKIPANEMRSQRLGTVSQTKSFSLTSLSSSTSTAQAVAAVEQPSVTATTTQYIDLTSSPVKDTTSPIVSRRRPPPVIPPETPPTEKNGQVLANVSTYQKLCQLQETKIKLLEERIHTSESTSISMDDKTAIYGTLEKQIKSIEKQINVTKSNIGNESSISLTESASITISSPEFRTPIAPPRRLAEARQIVANTTNAVPDFNDEDEIEDHFGSDENSGLFTPTQARNRRSDGEIDNGSDLESFIVDSCEEFESESDDAYDDENDDDVVDESFDIRLSQETAQRMNITYGSQLPSRIPHFVSPTRNKPSTRTRSIATIEEIDSEDDAIDAINEDDELDEIDDIEEITFPNVDSVDDPIEVDDKSCDPPHHQEGEEDEGEEDSEESNQILIDDYMTQLNQEREIVDFIELSDDDDDDDDDGSSLEKPLPTNPPQLPPISTAPKASFENTVVPANEDIIEISDSDGFSDDDDDLVDYFRDQRRPAGSEPFIDEVYKVLDNTFKLKDFRSNQLEAVCATLQGKDVFVLMPTGGGKSLCYQLPALIKSGKTSGTTVVISPLISLMQDQVQHLQSKGIKAGMISAHGAKGDNKHTTNLFREGFLDIVYLSPEKANRSGHTQKIIARLYKNDQLARVVIDEAHCLSSWGHDFRPDYQGLKFFKEEFPNVPIMALTATANEKVREDILHNLNMKDPIFLKQSFNRTNLFYEIRLKQRDFLKEIKDYIMEKHPNQTGIIYCHSKQSCEQTSAKLNEYGLRTSFYHAGMSTEDRYKIQTNWQNNKIQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHLFLPRSLEGYYQETGRAGRDGKHSECIMYYSPKDARTLRTLIQGDEQFSEDVKEGHLEKLRQVVQYCENTIDCRRQQVLQYFNESFNPADCNKECDNCLNFNQGEIVERDCTEYARDIISLVKSIQRDKVTVIHCQDVFRGMKYKKIVNLHHDENEYHGKGKALDKNLVERIFFSLINEGYLVEYIVRMKKSKFGTTYVKVGKNGNLRNKKIMIKFNVKPKTTATGGKKYAPKDKNTSKSTTAVSPYFNGTQTKNTQSNRRGGTTTRKRTSTQRGQRSQEGNKRRKTGSRKPSQSSAKSNKATSAMPL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.7
3	0.71
4	0.72
5	0.76
6	0.78
7	0.77
8	0.72
9	0.72
10	0.68
11	0.62
12	0.62
13	0.61
14	0.6
15	0.64
16	0.68
17	0.66
18	0.7
19	0.74
20	0.71
21	0.71
22	0.71
23	0.68
24	0.67
25	0.63
26	0.58
27	0.54
28	0.49
29	0.41
30	0.36
31	0.35
32	0.29
33	0.27
34	0.27
35	0.25
36	0.24
37	0.24
38	0.24
39	0.19
40	0.21
41	0.23
42	0.21
43	0.18
44	0.19
45	0.27
46	0.26
47	0.28
48	0.27
49	0.3
50	0.36
51	0.42
52	0.48
53	0.41
54	0.44
55	0.48
56	0.5
57	0.52
58	0.5
59	0.55
60	0.53
61	0.57
62	0.61
63	0.63
64	0.67
65	0.68
66	0.73
67	0.69
68	0.72
69	0.69
70	0.67
71	0.64
72	0.65
73	0.62
74	0.58
75	0.55
76	0.48
77	0.47
78	0.42
79	0.37
80	0.28
81	0.25
82	0.2
83	0.2
84	0.2
85	0.18
86	0.18
87	0.17
88	0.18
89	0.16
90	0.19
91	0.18
92	0.2
93	0.25
94	0.3
95	0.36
96	0.43
97	0.49
98	0.53
99	0.55
100	0.58
101	0.61
102	0.63
103	0.67
104	0.66
105	0.61
106	0.58
107	0.56
108	0.54
109	0.48
110	0.48
111	0.48
112	0.46
113	0.5
114	0.53
115	0.56
116	0.55
117	0.53
118	0.46
119	0.4
120	0.36
121	0.34
122	0.37
123	0.34
124	0.36
125	0.37
126	0.36
127	0.35
128	0.33
129	0.28
130	0.22
131	0.2
132	0.18
133	0.18
134	0.2
135	0.19
136	0.2
137	0.2
138	0.18
139	0.17
140	0.15
141	0.13
142	0.12
143	0.11
144	0.11
145	0.14
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.08
154	0.08
155	0.11
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.12
160	0.13
161	0.12
162	0.15
163	0.14
164	0.14
165	0.15
166	0.16
167	0.17
168	0.17
169	0.21
170	0.22
171	0.27
172	0.28
173	0.33
174	0.42
175	0.47
176	0.54
177	0.59
178	0.62
179	0.6
180	0.61
181	0.66
182	0.66
183	0.68
184	0.62
185	0.6
186	0.58
187	0.59
188	0.59
189	0.49
190	0.45
191	0.42
192	0.41
193	0.37
194	0.34
195	0.29
196	0.27
197	0.29
198	0.23
199	0.2
200	0.19
201	0.18
202	0.17
203	0.17
204	0.17
205	0.2
206	0.21
207	0.21
208	0.28
209	0.31
210	0.34
211	0.43
212	0.46
213	0.44
214	0.44
215	0.44
216	0.38
217	0.4
218	0.41
219	0.37
220	0.38
221	0.38
222	0.37
223	0.36
224	0.35
225	0.33
226	0.27
227	0.23
228	0.18
229	0.16
230	0.15
231	0.16
232	0.15
233	0.13
234	0.11
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.09
239	0.11
240	0.12
241	0.2
242	0.22
243	0.21
244	0.22
245	0.26
246	0.29
247	0.29
248	0.37
249	0.35
250	0.36
251	0.41
252	0.47
253	0.5
254	0.49
255	0.47
256	0.43
257	0.39
258	0.39
259	0.35
260	0.31
261	0.24
262	0.22
263	0.22
264	0.17
265	0.15
266	0.12
267	0.11
268	0.09
269	0.1
270	0.1
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.08
276	0.09
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.12
281	0.12
282	0.14
283	0.16
284	0.25
285	0.33
286	0.36
287	0.36
288	0.38
289	0.46
290	0.45
291	0.44
292	0.44
293	0.42
294	0.39
295	0.41
296	0.38
297	0.31
298	0.31
299	0.3
300	0.21
301	0.14
302	0.14
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.11
307	0.13
308	0.12
309	0.13
310	0.11
311	0.13
312	0.14
313	0.15
314	0.14
315	0.11
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.07
327	0.08
328	0.13
329	0.18
330	0.26
331	0.33
332	0.37
333	0.41
334	0.46
335	0.49
336	0.46
337	0.46
338	0.41
339	0.39
340	0.38
341	0.34
342	0.29
343	0.26
344	0.23
345	0.17
346	0.14
347	0.08
348	0.06
349	0.05
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.08
384	0.1
385	0.14
386	0.16
387	0.17
388	0.19
389	0.19
390	0.19
391	0.18
392	0.17
393	0.14
394	0.13
395	0.14
396	0.15
397	0.14
398	0.15
399	0.14
400	0.17
401	0.18
402	0.19
403	0.18
404	0.19
405	0.24
406	0.29
407	0.37
408	0.41
409	0.48
410	0.53
411	0.56
412	0.55
413	0.55
414	0.61
415	0.61
416	0.6
417	0.55
418	0.49
419	0.49
420	0.51
421	0.47
422	0.38
423	0.31
424	0.24
425	0.22
426	0.21
427	0.16
428	0.13
429	0.11
430	0.08
431	0.06
432	0.05
433	0.04
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.04
443	0.04
444	0.03
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.07
460	0.08
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.1
470	0.12
471	0.12
472	0.15
473	0.21
474	0.26
475	0.28
476	0.27
477	0.26
478	0.28
479	0.32
480	0.28
481	0.23
482	0.18
483	0.14
484	0.14
485	0.12
486	0.09
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.05
499	0.06
500	0.05
501	0.06
502	0.08
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.1
509	0.1
510	0.08
511	0.07
512	0.06
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.06
517	0.06
518	0.05
519	0.06
520	0.06
521	0.05
522	0.05
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.06
530	0.06
531	0.07
532	0.1
533	0.16
534	0.18
535	0.24
536	0.26
537	0.28
538	0.3
539	0.3
540	0.29
541	0.26
542	0.28
543	0.26
544	0.25
545	0.23
546	0.22
547	0.24
548	0.24
549	0.21
550	0.18
551	0.15
552	0.17
553	0.17
554	0.18
555	0.15
556	0.15
557	0.14
558	0.12
559	0.11
560	0.09
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.05
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.06
570	0.05
571	0.05
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.04
578	0.05
579	0.04
580	0.04
581	0.08
582	0.11
583	0.13
584	0.14
585	0.17
586	0.2
587	0.24
588	0.26
589	0.29
590	0.27
591	0.26
592	0.28
593	0.26
594	0.23
595	0.2
596	0.17
597	0.11
598	0.11
599	0.1
600	0.08
601	0.06
602	0.08
603	0.09
604	0.12
605	0.13
606	0.13
607	0.15
608	0.15
609	0.23
610	0.24
611	0.31
612	0.33
613	0.33
614	0.33
615	0.32
616	0.32
617	0.24
618	0.23
619	0.15
620	0.1
621	0.09
622	0.08
623	0.09
624	0.08
625	0.08
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.04
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.06
639	0.09
640	0.08
641	0.09
642	0.09
643	0.12
644	0.15
645	0.15
646	0.16
647	0.15
648	0.15
649	0.15
650	0.17
651	0.15
652	0.13
653	0.13
654	0.12
655	0.12
656	0.13
657	0.12
658	0.12
659	0.11
660	0.1
661	0.09
662	0.08
663	0.06
664	0.05
665	0.05
666	0.04
667	0.06
668	0.07
669	0.07
670	0.1
671	0.12
672	0.12
673	0.13
674	0.15
675	0.15
676	0.16
677	0.16
678	0.14
679	0.12
680	0.12
681	0.14
682	0.11
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.1
689	0.09
690	0.12
691	0.15
692	0.19
693	0.19
694	0.21
695	0.23
696	0.26
697	0.28
698	0.31
699	0.27
700	0.23
701	0.23
702	0.22
703	0.2
704	0.16
705	0.13
706	0.07
707	0.06
708	0.07
709	0.06
710	0.05
711	0.06
712	0.07
713	0.09
714	0.13
715	0.15
716	0.15
717	0.24
718	0.3
719	0.32
720	0.35
721	0.36
722	0.35
723	0.41
724	0.43
725	0.38
726	0.34
727	0.34
728	0.35
729	0.38
730	0.38
731	0.32
732	0.29
733	0.27
734	0.26
735	0.23
736	0.19
737	0.14
738	0.11
739	0.1
740	0.1
741	0.09
742	0.09
743	0.08
744	0.08
745	0.08
746	0.09
747	0.12
748	0.13
749	0.12
750	0.15
751	0.17
752	0.19
753	0.23
754	0.22
755	0.21
756	0.21
757	0.27
758	0.26
759	0.28
760	0.26
761	0.24
762	0.27
763	0.29
764	0.3
765	0.26
766	0.26
767	0.25
768	0.24
769	0.21
770	0.17
771	0.13
772	0.11
773	0.09
774	0.06
775	0.06
776	0.07
777	0.08
778	0.1
779	0.1
780	0.1
781	0.1
782	0.11
783	0.11
784	0.12
785	0.17
786	0.2
787	0.24
788	0.25
789	0.25
790	0.26
791	0.28
792	0.26
793	0.2
794	0.18
795	0.16
796	0.19
797	0.2
798	0.22
799	0.25
800	0.34
801	0.37
802	0.39
803	0.38
804	0.35
805	0.36
806	0.36
807	0.33
808	0.26
809	0.28
810	0.31
811	0.36
812	0.39
813	0.37
814	0.38
815	0.42
816	0.45
817	0.43
818	0.44
819	0.42
820	0.41
821	0.42
822	0.38
823	0.35
824	0.3
825	0.3
826	0.33
827	0.32
828	0.29
829	0.34
830	0.34
831	0.32
832	0.32
833	0.3
834	0.24
835	0.22
836	0.26
837	0.24
838	0.22
839	0.29
840	0.29
841	0.29
842	0.29
843	0.34
844	0.34
845	0.36
846	0.37
847	0.34
848	0.42
849	0.43
850	0.42
851	0.36
852	0.32
853	0.31
854	0.31
855	0.29
856	0.22
857	0.21
858	0.2
859	0.21
860	0.23
861	0.19
862	0.18
863	0.16
864	0.16
865	0.15
866	0.17
867	0.17
868	0.18
869	0.18
870	0.18
871	0.21
872	0.22
873	0.22
874	0.28
875	0.33
876	0.4
877	0.49
878	0.55
879	0.57
880	0.55
881	0.6
882	0.51
883	0.45
884	0.36
885	0.29
886	0.24
887	0.18
888	0.18
889	0.11
890	0.11
891	0.09
892	0.08
893	0.06
894	0.05
895	0.06
896	0.07
897	0.08
898	0.08
899	0.1
900	0.11
901	0.1
902	0.11
903	0.11
904	0.15
905	0.16
906	0.2
907	0.2
908	0.21
909	0.22
910	0.21
911	0.22
912	0.18
913	0.17
914	0.16
915	0.18
916	0.17
917	0.16
918	0.16
919	0.15
920	0.16
921	0.16
922	0.16
923	0.14
924	0.17
925	0.23
926	0.28
927	0.3
928	0.34
929	0.33
930	0.31
931	0.3
932	0.29
933	0.25
934	0.25
935	0.23
936	0.24
937	0.27
938	0.27
939	0.31
940	0.31
941	0.33
942	0.33
943	0.37
944	0.33
945	0.38
946	0.38
947	0.35
948	0.39
949	0.36
950	0.32
951	0.29
952	0.28
953	0.2
954	0.19
955	0.19
956	0.13
957	0.11
958	0.1
959	0.12
960	0.12
961	0.16
962	0.21
963	0.21
964	0.22
965	0.3
966	0.32
967	0.33
968	0.33
969	0.32
970	0.34
971	0.37
972	0.37
973	0.32
974	0.3
975	0.3
976	0.33
977	0.37
978	0.31
979	0.33
980	0.34
981	0.34
982	0.4
983	0.44
984	0.47
985	0.43
986	0.48
987	0.44
988	0.44
989	0.42
990	0.37
991	0.3
992	0.24
993	0.24
994	0.18
995	0.22
996	0.22
997	0.26
998	0.28
999	0.31
1000	0.31
1001	0.35
1002	0.38
1003	0.35
1004	0.37
1005	0.37
1006	0.34
1007	0.32
1008	0.31
1009	0.24
1010	0.23
1011	0.2
1012	0.2
1013	0.15
1014	0.15
1015	0.17
1016	0.16
1017	0.17
1018	0.16
1019	0.17
1020	0.16
1021	0.15
1022	0.15
1023	0.13
1024	0.15
1025	0.16
1026	0.15
1027	0.14
1028	0.17
1029	0.19
1030	0.22
1031	0.28
1032	0.27
1033	0.27
1034	0.28
1035	0.35
1036	0.33
1037	0.38
1038	0.39
1039	0.38
1040	0.37
1041	0.37
1042	0.35
1043	0.34
1044	0.33
1045	0.28
1046	0.34
1047	0.29
1048	0.34
1049	0.37
1050	0.42
1051	0.42
1052	0.49
1053	0.53
1054	0.53
1055	0.6
1056	0.6
1057	0.61
1058	0.58
1059	0.51
1060	0.48
1061	0.5
1062	0.42
1063	0.36
1064	0.31
1065	0.27
1066	0.28
1067	0.35
1068	0.37
1069	0.34
1070	0.39
1071	0.39
1072	0.46
1073	0.51
1074	0.49
1075	0.42
1076	0.36
1077	0.35
1078	0.31
1079	0.29
1080	0.23
1081	0.21
1082	0.19
1083	0.2
1084	0.19
1085	0.14
1086	0.12
1087	0.13
1088	0.12
1089	0.07
1090	0.07
1091	0.11
1092	0.16
1093	0.18
1094	0.21
1095	0.22
1096	0.29
1097	0.34
1098	0.42
1099	0.41
1100	0.44
1101	0.5
1102	0.52
1103	0.61
1104	0.62
1105	0.62
1106	0.56
1107	0.56
1108	0.56
1109	0.56
1110	0.59
1111	0.6
1112	0.62
1113	0.61
1114	0.66
1115	0.69
1116	0.7
1117	0.69
1118	0.69
1119	0.67
1120	0.67
1121	0.69
1122	0.72
1123	0.75
1124	0.68
1125	0.63
1126	0.57
1127	0.55
1128	0.5
1129	0.53
1130	0.5
1131	0.51
1132	0.54
1133	0.59
1134	0.61
1135	0.61
1136	0.67
1137	0.65
1138	0.64
1139	0.65
1140	0.71
1141	0.73
1142	0.73
1143	0.74
1144	0.68
1145	0.66
1146	0.61
1147	0.57
1148	0.53
1149	0.46
1150	0.42
1151	0.38
1152	0.38
1153	0.36
1154	0.36
1155	0.33
1156	0.29
1157	0.34
1158	0.37
1159	0.44
1160	0.47
1161	0.5
1162	0.57
1163	0.61
1164	0.67
1165	0.65
1166	0.63
1167	0.59
1168	0.57
1169	0.62
1170	0.63
1171	0.67
1172	0.66
1173	0.65
1174	0.64
1175	0.71
1176	0.76
1177	0.76
1178	0.75
1179	0.75
1180	0.77
1181	0.8
1182	0.85
1183	0.84
1184	0.84
1185	0.83
1186	0.83
1187	0.82
1188	0.81
1189	0.81
1190	0.78
1191	0.79
1192	0.79
1193	0.79
1194	0.79
1195	0.81
1196	0.82
1197	0.82
1198	0.86
1199	0.86
1200	0.85
1201	0.85
1202	0.83
1203	0.82
1204	0.78
1205	0.73
1206	0.68
1207	0.61

C5M4V2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer