Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M3R3

Protein Details
Accession C5M3R3    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-39NDDEVLGKTRKQKQKLRNQVKLNYDSDHydrophilic
185-207LNDYKRKDIKKARKAQEERKKLQBasic
241-268ALARLNSTKKKSNKKKPRNQIDESNKELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-205KRKDIKKARKAQEERKK
249-258KKKSNKKKPR
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
KEGG ctp:CTRG_00702  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MNDSDEEDLIVINDDEVLGKTRKQKQKLRNQVKLNYDSDSSDPEESDNEDVVKGKVTSQNDDEDDMFASDNEDKDMVGECRETNESKKTPQFLDVSQLEGQEKLVIESDVSDTDEDNDDEEVDHEYYNNTDDADIYTTRKRRAPKMEAFNLEEEANEGKFDLDGNYIRNDTNGEESAPANDDVWLNDYKRKDIKKARKAQEERKKLQTNKLLERNINMDPIDVLLSGLIDILEPDETPMEALARLNSTKKKSNKKKPRNQIDESNKELIQKVTDLCSTLINDKFLDDVYELTREELMRKYQVETGEAYKLKRGTKRAREEEDVDDEIDYGEKIWEFRWIGDDEINGPYSSYEMNHWKQSYFKNKVEVRKVGSGTEFKNVSYIEFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.08
4 0.12
5 0.12
6 0.17
7 0.26
8 0.37
9 0.46
10 0.55
11 0.64
12 0.7
13 0.8
14 0.87
15 0.89
16 0.89
17 0.89
18 0.87
19 0.87
20 0.83
21 0.74
22 0.66
23 0.56
24 0.49
25 0.41
26 0.37
27 0.3
28 0.25
29 0.22
30 0.2
31 0.19
32 0.19
33 0.2
34 0.17
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.14
39 0.16
40 0.14
41 0.16
42 0.21
43 0.23
44 0.27
45 0.29
46 0.34
47 0.32
48 0.35
49 0.31
50 0.26
51 0.24
52 0.2
53 0.17
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.12
67 0.15
68 0.19
69 0.2
70 0.22
71 0.29
72 0.31
73 0.37
74 0.42
75 0.43
76 0.42
77 0.45
78 0.44
79 0.36
80 0.41
81 0.34
82 0.32
83 0.29
84 0.29
85 0.24
86 0.21
87 0.2
88 0.14
89 0.14
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.18
124 0.21
125 0.25
126 0.29
127 0.32
128 0.39
129 0.48
130 0.54
131 0.57
132 0.63
133 0.67
134 0.67
135 0.65
136 0.57
137 0.49
138 0.39
139 0.3
140 0.22
141 0.15
142 0.11
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.1
171 0.11
172 0.1
173 0.14
174 0.14
175 0.17
176 0.23
177 0.25
178 0.31
179 0.4
180 0.5
181 0.56
182 0.66
183 0.71
184 0.76
185 0.81
186 0.83
187 0.84
188 0.83
189 0.77
190 0.76
191 0.76
192 0.69
193 0.69
194 0.66
195 0.63
196 0.61
197 0.65
198 0.59
199 0.51
200 0.5
201 0.45
202 0.38
203 0.33
204 0.25
205 0.17
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.07
210 0.06
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.02
217 0.02
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.08
232 0.13
233 0.18
234 0.22
235 0.31
236 0.39
237 0.5
238 0.59
239 0.69
240 0.76
241 0.83
242 0.89
243 0.92
244 0.94
245 0.92
246 0.87
247 0.87
248 0.86
249 0.81
250 0.76
251 0.69
252 0.58
253 0.5
254 0.46
255 0.35
256 0.26
257 0.21
258 0.17
259 0.16
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.19
266 0.2
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.15
272 0.15
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.13
281 0.15
282 0.17
283 0.18
284 0.21
285 0.22
286 0.23
287 0.25
288 0.26
289 0.26
290 0.25
291 0.25
292 0.28
293 0.29
294 0.27
295 0.28
296 0.32
297 0.36
298 0.39
299 0.46
300 0.5
301 0.58
302 0.68
303 0.73
304 0.76
305 0.76
306 0.74
307 0.69
308 0.64
309 0.55
310 0.45
311 0.36
312 0.29
313 0.23
314 0.19
315 0.13
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.15
322 0.15
323 0.16
324 0.2
325 0.2
326 0.22
327 0.23
328 0.24
329 0.19
330 0.21
331 0.21
332 0.17
333 0.15
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.14
339 0.22
340 0.26
341 0.34
342 0.35
343 0.36
344 0.41
345 0.5
346 0.55
347 0.55
348 0.56
349 0.58
350 0.64
351 0.72
352 0.75
353 0.73
354 0.69
355 0.68
356 0.65
357 0.58
358 0.57
359 0.54
360 0.47
361 0.47
362 0.41
363 0.33
364 0.35
365 0.31