Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M212

Protein Details
Accession C5M212    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MKCVRNKNKKREKERKKKILRISTTVFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-19NKNKKREKERKKKI
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
KEGG ctp:CTRG_00101  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MKCVRNKNKKREKERKKKILRISTTVFTSTITTNMSELPISYDNKSKKLSLSTIPDENNEDLLQLKLDVDQLNTLTQEIINQGSDVPPQPKPENFNKDLSKMIKKLYDGGVQAFKVGKFEDSARQFTIGIEMINRRPKIESFQGTIQELSMFLMSRTDAYLRIKEYQKAFNDADLLLSMQMNTPDNFLRRGVANYFLQNYEAARSDYQRGLQFDENNERLQKELTVCLDKILEENGDYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.96
2 0.96
3 0.96
4 0.95
5 0.94
6 0.93
7 0.89
8 0.86
9 0.8
10 0.74
11 0.66
12 0.57
13 0.47
14 0.37
15 0.31
16 0.24
17 0.2
18 0.16
19 0.14
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.11
24 0.1
25 0.13
26 0.16
27 0.18
28 0.19
29 0.26
30 0.28
31 0.33
32 0.36
33 0.33
34 0.32
35 0.35
36 0.37
37 0.36
38 0.41
39 0.41
40 0.44
41 0.43
42 0.41
43 0.4
44 0.36
45 0.31
46 0.23
47 0.18
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.08
52 0.08
53 0.06
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.09
72 0.1
73 0.12
74 0.13
75 0.17
76 0.2
77 0.22
78 0.27
79 0.35
80 0.41
81 0.41
82 0.46
83 0.44
84 0.43
85 0.46
86 0.45
87 0.41
88 0.35
89 0.34
90 0.29
91 0.28
92 0.29
93 0.27
94 0.26
95 0.21
96 0.22
97 0.21
98 0.19
99 0.19
100 0.17
101 0.14
102 0.11
103 0.11
104 0.09
105 0.08
106 0.09
107 0.15
108 0.17
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.12
116 0.09
117 0.08
118 0.1
119 0.13
120 0.2
121 0.2
122 0.19
123 0.2
124 0.2
125 0.25
126 0.3
127 0.29
128 0.27
129 0.3
130 0.31
131 0.31
132 0.3
133 0.25
134 0.18
135 0.14
136 0.11
137 0.08
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.09
146 0.12
147 0.15
148 0.17
149 0.23
150 0.25
151 0.29
152 0.32
153 0.37
154 0.36
155 0.4
156 0.38
157 0.33
158 0.32
159 0.27
160 0.24
161 0.17
162 0.15
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.1
169 0.09
170 0.11
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.16
175 0.17
176 0.17
177 0.2
178 0.19
179 0.21
180 0.22
181 0.24
182 0.25
183 0.24
184 0.23
185 0.21
186 0.2
187 0.18
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.18
192 0.21
193 0.23
194 0.27
195 0.3
196 0.3
197 0.33
198 0.37
199 0.37
200 0.39
201 0.46
202 0.44
203 0.43
204 0.43
205 0.38
206 0.34
207 0.32
208 0.29
209 0.22
210 0.26
211 0.27
212 0.31
213 0.3
214 0.31
215 0.3
216 0.27
217 0.25
218 0.22
219 0.18