Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MB37

Protein Details
Accession C5MB37    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
445-481QESSSKPKYVYKSRKVEKPEAKKNKKTQIKSISNYFKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
456-470KSRKVEKPEAKKNKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_mito 3, mito 2.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004808  AP_endonuc_1  
IPR020848  AP_endonuclease_F1_CS  
IPR036691  Endo/exonu/phosph_ase_sf  
IPR005135  Endo/exonuclease/phosphatase  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003906  F:DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0008311  F:double-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006284  P:base-excision repair  
KEGG ctp:CTRG_03279  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03372  Exo_endo_phos  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00728  AP_NUCLEASE_F1_3  
PS51435  AP_NUCLEASE_F1_4  
Amino Acid Sequences MDKDILLQEPFTKITSKSKGDSTIRYVTFNVNGIKTIFNYHPWNKFKQDYNALFNSLHADIITLQELKLSESTIQQAKNIAHLADYKSFISLPATKKGYSGVGLFIRNPSDGKNAKHLTVVKAEEGITGWLCSRNGSNVPYRELNDNIGGYTDFDKQSGQFLDSEGRCVVVELADNTVVFGVYCPANSQRTYEGELFRLTFMKLLLERCRNLKNMGKKVVVMGDININLDLIDNAEGIELGVKDNSIRRASSGHTFECMNYAECVKFKSSSDARILLNKYVYRSMWQDLSIDGKEENKDDEQKQFLYDTTRFIQGRRMKMYTVWNTLTNSREINYGSRIDLILFSDESMVKNISQADIWPCILGSDHCPVFTDYDIDECQEDDDITEVPTKLHLEARYHFKLEKTRDITSLFGSKNPKKSASPDSSSTSSVTSSQSSTPKPANSQESSSKPKYVYKSRKVEKPEAKKNKKTQIKSISNYFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.36
3 0.39
4 0.4
5 0.44
6 0.52
7 0.55
8 0.58
9 0.56
10 0.57
11 0.53
12 0.52
13 0.48
14 0.43
15 0.4
16 0.39
17 0.36
18 0.27
19 0.28
20 0.27
21 0.26
22 0.23
23 0.26
24 0.23
25 0.24
26 0.32
27 0.37
28 0.46
29 0.49
30 0.54
31 0.56
32 0.6
33 0.62
34 0.63
35 0.66
36 0.63
37 0.65
38 0.62
39 0.58
40 0.52
41 0.45
42 0.39
43 0.29
44 0.23
45 0.15
46 0.13
47 0.11
48 0.12
49 0.14
50 0.11
51 0.1
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.13
59 0.19
60 0.22
61 0.22
62 0.22
63 0.26
64 0.25
65 0.28
66 0.28
67 0.23
68 0.19
69 0.22
70 0.25
71 0.24
72 0.26
73 0.22
74 0.21
75 0.21
76 0.19
77 0.2
78 0.22
79 0.22
80 0.28
81 0.31
82 0.3
83 0.31
84 0.32
85 0.3
86 0.25
87 0.23
88 0.2
89 0.2
90 0.22
91 0.22
92 0.22
93 0.22
94 0.2
95 0.2
96 0.17
97 0.22
98 0.26
99 0.28
100 0.35
101 0.36
102 0.36
103 0.41
104 0.42
105 0.37
106 0.38
107 0.37
108 0.28
109 0.27
110 0.27
111 0.22
112 0.19
113 0.17
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.14
122 0.16
123 0.19
124 0.25
125 0.26
126 0.3
127 0.32
128 0.33
129 0.33
130 0.31
131 0.3
132 0.25
133 0.23
134 0.18
135 0.16
136 0.14
137 0.12
138 0.13
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.17
145 0.16
146 0.15
147 0.12
148 0.12
149 0.19
150 0.18
151 0.2
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.09
173 0.12
174 0.12
175 0.14
176 0.15
177 0.18
178 0.22
179 0.24
180 0.23
181 0.22
182 0.22
183 0.21
184 0.19
185 0.17
186 0.13
187 0.11
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.14
192 0.19
193 0.23
194 0.24
195 0.27
196 0.3
197 0.3
198 0.33
199 0.35
200 0.39
201 0.42
202 0.47
203 0.44
204 0.41
205 0.4
206 0.37
207 0.32
208 0.23
209 0.16
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.07
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.13
237 0.15
238 0.21
239 0.22
240 0.19
241 0.19
242 0.2
243 0.19
244 0.19
245 0.18
246 0.13
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.11
255 0.19
256 0.19
257 0.23
258 0.25
259 0.27
260 0.27
261 0.31
262 0.32
263 0.26
264 0.28
265 0.25
266 0.23
267 0.22
268 0.22
269 0.18
270 0.19
271 0.19
272 0.18
273 0.17
274 0.16
275 0.14
276 0.18
277 0.15
278 0.14
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.15
284 0.14
285 0.19
286 0.2
287 0.23
288 0.24
289 0.24
290 0.24
291 0.22
292 0.2
293 0.21
294 0.2
295 0.2
296 0.19
297 0.25
298 0.24
299 0.24
300 0.32
301 0.33
302 0.39
303 0.4
304 0.4
305 0.35
306 0.38
307 0.47
308 0.44
309 0.43
310 0.39
311 0.36
312 0.36
313 0.39
314 0.36
315 0.29
316 0.24
317 0.19
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.18
323 0.16
324 0.17
325 0.16
326 0.15
327 0.14
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.09
338 0.11
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.12
343 0.13
344 0.15
345 0.15
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.13
350 0.12
351 0.12
352 0.15
353 0.16
354 0.16
355 0.17
356 0.18
357 0.19
358 0.18
359 0.17
360 0.12
361 0.15
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.07
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.11
374 0.11
375 0.1
376 0.12
377 0.13
378 0.14
379 0.18
380 0.21
381 0.23
382 0.28
383 0.36
384 0.39
385 0.4
386 0.4
387 0.4
388 0.45
389 0.47
390 0.52
391 0.49
392 0.47
393 0.48
394 0.48
395 0.46
396 0.41
397 0.42
398 0.32
399 0.32
400 0.39
401 0.42
402 0.48
403 0.51
404 0.52
405 0.48
406 0.54
407 0.59
408 0.58
409 0.57
410 0.53
411 0.55
412 0.53
413 0.51
414 0.46
415 0.37
416 0.29
417 0.26
418 0.23
419 0.19
420 0.18
421 0.22
422 0.27
423 0.29
424 0.33
425 0.36
426 0.38
427 0.41
428 0.46
429 0.49
430 0.47
431 0.51
432 0.53
433 0.56
434 0.61
435 0.6
436 0.57
437 0.52
438 0.55
439 0.58
440 0.61
441 0.64
442 0.66
443 0.73
444 0.76
445 0.82
446 0.83
447 0.85
448 0.85
449 0.85
450 0.86
451 0.86
452 0.89
453 0.91
454 0.92
455 0.92
456 0.92
457 0.88
458 0.87
459 0.87
460 0.87
461 0.83