Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6Q1

Protein Details
Accession C5M6Q1    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-34EDSITSKKTSKPQSSRKGKKAWRKNIDIEDLEHydrophilic
273-304LSVNKPNKFKIKTKTKRNKELKHKERVKLEQEHydrophilic
326-352AEKEAAKPESKKRKRREKLFKHELIETBasic
387-415GKVESRVPVAKRRKYQKKITEKWTYKDFKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-26TSKPQSSRKGKKAWRK
278-300PNKFKIKTKTKRNKELKHKERVK
328-344KEAAKPESKKRKRREKL
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG ctp:CTRG_01532  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MSEDSITSKKTSKPQSSRKGKKAWRKNIDIEDLEKNLQDKRDEEIILGKKEEDFIIDDKPSNIGLKSVKKLKSKEILTNKSKIPALVHGKHQDKDKKNTIQGVKKTDLLRLIKLNGGKFKSEDKLMNRIEQDGLVSGSSKDLWDDNEEDEEDNKKMPKYIKSTAEVTKAKVVPKTLKETPIKLIDNDLTQKKIHAGKSYNPSLESWKDLINQEYDIEYKQELTRQKMEEHRKMIQKLVSTLDDMVVDNHDDDDDEEEDQEAKEKVGEEKDYSLSVNKPNKFKIKTKTKRNKELKHKERVKLEQEIKDLKKQLKDLSNLEEILQKEAEKEAAKPESKKRKRREKLFKHELIETPMEVKLSDELSGNLRNLKPEGNLFYDQMLNLQSSGKVESRVPVAKRRKYQKKITEKWTYKDFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.8
3 0.86
4 0.91
5 0.91
6 0.92
7 0.91
8 0.91
9 0.91
10 0.91
11 0.9
12 0.88
13 0.88
14 0.85
15 0.84
16 0.76
17 0.7
18 0.64
19 0.57
20 0.5
21 0.42
22 0.35
23 0.3
24 0.31
25 0.29
26 0.24
27 0.27
28 0.31
29 0.3
30 0.29
31 0.34
32 0.37
33 0.37
34 0.37
35 0.32
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.2
40 0.16
41 0.15
42 0.19
43 0.2
44 0.21
45 0.2
46 0.21
47 0.2
48 0.19
49 0.17
50 0.17
51 0.21
52 0.27
53 0.34
54 0.42
55 0.48
56 0.54
57 0.57
58 0.62
59 0.65
60 0.63
61 0.66
62 0.68
63 0.71
64 0.69
65 0.72
66 0.65
67 0.61
68 0.56
69 0.47
70 0.39
71 0.38
72 0.42
73 0.39
74 0.45
75 0.49
76 0.52
77 0.54
78 0.6
79 0.61
80 0.6
81 0.65
82 0.67
83 0.66
84 0.67
85 0.72
86 0.72
87 0.71
88 0.7
89 0.68
90 0.61
91 0.58
92 0.54
93 0.49
94 0.48
95 0.41
96 0.38
97 0.34
98 0.33
99 0.31
100 0.33
101 0.34
102 0.33
103 0.32
104 0.3
105 0.28
106 0.31
107 0.31
108 0.31
109 0.34
110 0.31
111 0.39
112 0.39
113 0.42
114 0.38
115 0.37
116 0.33
117 0.27
118 0.24
119 0.15
120 0.14
121 0.09
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.1
131 0.12
132 0.12
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.16
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.13
142 0.17
143 0.21
144 0.26
145 0.31
146 0.38
147 0.41
148 0.43
149 0.47
150 0.47
151 0.51
152 0.46
153 0.4
154 0.4
155 0.37
156 0.35
157 0.33
158 0.32
159 0.3
160 0.32
161 0.38
162 0.35
163 0.4
164 0.41
165 0.41
166 0.42
167 0.42
168 0.4
169 0.33
170 0.32
171 0.25
172 0.25
173 0.27
174 0.24
175 0.19
176 0.18
177 0.18
178 0.2
179 0.24
180 0.24
181 0.25
182 0.27
183 0.31
184 0.38
185 0.42
186 0.39
187 0.34
188 0.33
189 0.31
190 0.29
191 0.25
192 0.19
193 0.17
194 0.18
195 0.18
196 0.19
197 0.15
198 0.15
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.13
208 0.15
209 0.19
210 0.24
211 0.25
212 0.29
213 0.36
214 0.45
215 0.47
216 0.49
217 0.51
218 0.52
219 0.51
220 0.51
221 0.45
222 0.38
223 0.33
224 0.31
225 0.25
226 0.2
227 0.19
228 0.15
229 0.13
230 0.12
231 0.1
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.1
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.11
252 0.14
253 0.16
254 0.15
255 0.17
256 0.18
257 0.18
258 0.18
259 0.17
260 0.17
261 0.24
262 0.3
263 0.32
264 0.36
265 0.41
266 0.5
267 0.53
268 0.58
269 0.6
270 0.64
271 0.69
272 0.76
273 0.81
274 0.83
275 0.88
276 0.91
277 0.91
278 0.91
279 0.93
280 0.91
281 0.91
282 0.9
283 0.85
284 0.83
285 0.81
286 0.76
287 0.74
288 0.72
289 0.67
290 0.64
291 0.66
292 0.6
293 0.58
294 0.58
295 0.53
296 0.5
297 0.48
298 0.5
299 0.48
300 0.5
301 0.47
302 0.47
303 0.46
304 0.41
305 0.38
306 0.35
307 0.28
308 0.26
309 0.23
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.18
314 0.15
315 0.15
316 0.19
317 0.26
318 0.3
319 0.35
320 0.44
321 0.52
322 0.62
323 0.71
324 0.75
325 0.79
326 0.86
327 0.91
328 0.93
329 0.92
330 0.94
331 0.94
332 0.91
333 0.84
334 0.79
335 0.71
336 0.65
337 0.56
338 0.45
339 0.36
340 0.29
341 0.25
342 0.19
343 0.17
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.15
350 0.19
351 0.19
352 0.23
353 0.23
354 0.25
355 0.26
356 0.27
357 0.26
358 0.28
359 0.31
360 0.31
361 0.33
362 0.31
363 0.31
364 0.3
365 0.27
366 0.24
367 0.2
368 0.15
369 0.13
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.16
374 0.16
375 0.18
376 0.18
377 0.21
378 0.26
379 0.33
380 0.36
381 0.42
382 0.51
383 0.58
384 0.67
385 0.75
386 0.79
387 0.81
388 0.88
389 0.89
390 0.9
391 0.9
392 0.9
393 0.91
394 0.87
395 0.84